α-干擾素副作用 [1] 表現為用藥1周內幾乎所有患者都會出現流感樣表現，如發熱、畏寒、身痛、頭痛、出汗、惡心、嘔吐等。癥狀較輕時可不予治療，只須適當多喝開水、臥床休息，一般10日左右癥狀便可消失。癥狀重者則須服用些解熱鎮痛藥，如阿司匹林、消炎痛等。
用藥1個月后有的病人會出現消化道癥狀，皮膚過敏樣癥狀或精神癥狀，如食欲不振、噯氣、惡心、嘔吐；注意力不集中，眩暈、嗜睡或失眠，甚至產生悲觀厭世等精神癥狀。所以一般消化道反應較輕者，經2-4周可自行緩解，重者則宜服用促消化藥。皮膚過敏反應一般1周左右可自行消退。失眠者可服用鎮靜劑，精神癥狀較重時則應減藥，或停用α干擾素。
約23%的使用α干擾素者外周血白細胞和血小板減少，發生這種副作用無任何感覺，卻為嚴重副作用，重者可誘發感染和出血（包括內臟出血），但只要按醫囑復查血常規即可及時發現這種副作用并及時處理。
α干擾素的不良反應在停藥1個月左右會自行消失，副反應的輕重每個人并不一樣。