根據病毒血清型的不同，HSE分為兩類：
1、HSV-1型腦炎
由HSV-1型病毒引起，約占HSE的90%。HSV-1多經呼吸道或唾液接觸傳染，HSV可能通過嗅神經或三叉神經侵入腦組織，損害額葉眶部、顳葉皮質和邊緣系統。
2、HSV-2型腦炎
由HSV-II型病毒引起，只有6%～15%系。HSV-2主要引起生殖器皰疹，由其所致HSE主要見于新生兒，分娩時生殖道分泌物與胎兒接觸是導致新生兒感染的主要原因。HSV-2原發感染也見于年輕人，可通過性接觸傳播，引起成年人的無菌性腦膜炎，而非腦炎。
