1.消除誘因
應盡量避免使用麻醉、止痛、安眠、鎮靜等類藥物，如使用不當，可出現昏睡，甚至昏迷。當患者狂躁不安或有抽搐時，禁用嗎啡及其衍生物、副醛、水合氯醛、哌替啶及速效巴比妥類，可減量使用（常量的1/2或1/3）地西泮、東莨菪堿，并減少給藥次數。或用異丙嗪、氯苯那敏等抗組胺藥代替。必須及時控制感染和上消化道出血，避免快速和大量的排鉀利尿和放腹水。注意糾正水、電解質和酸堿平衡失調。
2.減少腸內毒物的生成和吸收
（1）飲食開始數天內禁食蛋白質。每天供給熱量5.0～6.7kJ和足量維生素，以糖類為主要食物，昏迷不能進食者可經鼻胃管供食。脂肪可延緩胃的排空宜少用。神志清楚后，可逐步增加蛋白質至40～60g/d。以用植物蛋白為最好。
（2）灌腸或導瀉保持大便通腸，清除腸內積食、積血或其他含氮物質以減少氨的生成和吸收，可用生理鹽水或弱酸性溶液（例如稀醋酸液）灌腸，或口服或鼻飼25%硫酸鎂30～60ml導瀉。對急性門-體分流性腦病昏迷患者用乳果糖500ml加水500ml灌腸作為首選治療。
（3）抑制細菌生長口服新霉素或選服巴龍霉素、卡那霉素、氨芐西林均有良效。口服甲硝唑療效和新霉素相等，適用于腎功能不良者。乳果糖口服后在結腸中被細菌分解為乳酸和醋酸，使腸腔呈酸性，從而減少氨的形成和吸收。對忌用新霉素或需長期治療的患者，乳果糖或異山梨醇為首選藥物。近年發現乳糖在乳糖酶缺乏人群的結腸中，經細菌發酵產酸后也降低糞便pH，減少氨含量，用以治療肝性腦病，效果和乳果糖一樣。
3.促進有毒物質的代謝清除，糾正氨基酸代謝紊亂
（1）降氨藥物①谷氨酸鉀和谷氨酸鈉加入葡萄糖液中靜脈滴注。谷氨酸鉀、鈉比例視血清鉀、鈉濃度和病情而定；②精氨酸1g加入葡萄糖中靜滴，此藥可促進尿素合成，藥呈酸性，適用于血pH偏高的患者；③苯甲酸鈉可與腸內殘余氮質如甘氨酸或谷氨酰胺結合，形成馬尿酸，經腎排出，因而降低血氨；④苯乙酸與腸內谷氨酰胺結合，形成無毒的馬尿酸經腎排泄，也能降低血氨濃度；⑤鳥氨酸-α酮戊二酸和鳥氨酸門冬氨酸均有顯著降氨作用。降氨藥對慢性反復發作的門體分流性腦病的療效較好，對重癥肝炎所致的急性肝性昏迷無效。
（2）肝用氨基酸輸液（支鏈氨基酸）口服或靜脈輸注以肝用氨基酸輸液（支鏈氨基酸）為主的氨基酸混合液，但對門體分流性腦病的療效尚有爭議。
（3）GABA/BZ復合受體拮抗藥GABA受體的拮抗藥已有荷包牡丹堿（bicuculline）苯二氮類受體的拮抗劑為氟馬西尼（flumazenil）。
（4）人工肝用藥用炭、樹脂等進行血液灌注或用聚丙烯腈進行透析，清除血氨和其他毒物，對急、慢性肝性腦病有一定療效。
4.肝移植
原位肝移植為各種終末期肝病患者提供了新的治療途徑。
5.其他對癥治療
（1）糾正水、電解質和酸堿平衡失調每天入液總量以不超過2500ml為宜。及時糾正缺鉀和堿中毒，缺鉀者補充氯化鉀；堿中毒者可用精氨酸鹽溶液靜脈滴注。
（2）保護腦細胞功能用冰帽降低顱內溫度，以減少能量消耗，保護腦細胞功能。
（3）保持呼吸道通暢深昏迷者，應作氣管切開排痰給氧。
（4）防治腦水腫靜脈滴注高滲葡萄糖、甘露醇等脫水劑以防治腦水腫。
（5）防止出血與休克有出血傾向者，可靜脈滴注維生素K1或輸鮮血，以糾正休克，缺氧和腎前性尿毒癥。
（6）腹膜或血液透析如氮質血癥是肝性腦病的原因，腹膜或血液透析可能有用。