胡黃連與黃連，均為大苦大寒純陰之品，共具清熱，瀉火，燥濕，涼血之效。然不同之處，以《本草正義》言惟其質重色黑，沉降性尤其速，故清導下焦濕熱，其力愈專，其效較川黃連為捷。熱痢脫肛，痔漏瘡瘍，血痢，血淋，溲血，瀉血及梅毒疳瘡等證，濕火結聚，非此不能直達病所，而小兒疳積膨脹之實證，亦可用之。蓋苦降直墜，導熱下趨，最為迅疾，且不致久留中州，妨礙脾胃沖和之氣耳。除此，黃連退蒸消疳功效不顯著，而胡黃連瀉心火，解毒之力也不及黃連。
