⑴糾正酸中毒：根據碳酸氫根丟失情況補充堿劑，2～10mmol/(kg·d)，可用重碳酸氫鹽、枸櫞酸鹽、乳酸鹽等，每日4～5次，分次給服，以血中碳酸氫鹽水平恢復正常為標準。補鈉可使低血鉀加重，應注意檢測；對已有低血鉀者宜同時補鉀2～4mmol/(kg·d)。若堿劑用量過大患者不能耐受時，可加用氫氯噻嗪(雙氫克尿塞)2～3mg/(kg·d)，它可使細胞外液縮減而促進碳酸氫根的再吸收，但應謹慎防止腎小球濾過率下降。
⑵糾正低血容量：Fanconi綜合征常因多尿而致脫水，除了針對病因治療外，應補足含鹽的液體(包括鈉、鉀、鈣等)，可采用定時口服，必要時臨時追加。
⑶糾正低磷血癥：應用中性磷酸鹽每日1～3g，分5次服用。如有腹瀉或腹部不適可減量。注意補磷可加重低血鈣與骨病，故應合用維生素D每日5000U或1，25(OH)2D3每日0.25～0.5μg ，應從少量開始，逐漸加至足量。為防止腎鈣化應監測尿鈣排量，以不超過每日0.6g為標準。
⑷低尿酸血癥、氨基酸尿及蛋白尿一般不需治療。
⑸腎功能衰竭宜進行透析或腎移植。
