氨酰tRNA合成酶(aminoacyl tRNA synthetase,通常簡寫為aaRS)是一類催化特定氨基酸或其前體與對應tRNA發生酯化反應而形成氨酰tRNA的酶。由于每一種的氨基酸與 tRNA的連接都需要專一性的氨酰tRNA合成酶來催化,因此氨酰tRNA合成酶的種類與標準氨基酸的數量一樣都為20種。氨酰tRNA合成酶也是自然界中最古老的蛋白質之一。酪氨酸tRNA合成酶(TyrRS)就是其中一種。
最近,美國斯克里普斯研究所(TSRI)的科學家發現,TyrRS還有另一個主要功能:在細胞應激過程中保護DNA。這一發現是TSRI幾個實驗室共同合作的結果,發表在2014年10月2日的《分子細胞》(Molecular Cell)雜志。
從基礎科學層面上來說,這一發現非常值得注意,而且也指明了可能的治療應用。采用某種策略增強TyrRS酶的DNA保護功能,可以幫助人們免受輻射損傷以及DNA修復系統中的遺傳缺陷。
TSRI教授楊湘磊(Xiang-Lei Yang)帶領了這項研究,她指出:“我們在斑馬魚中過度表達了TyrRS,發現它們能完全保護魚免于紫外線輻射誘導的DNA損傷。”
這一新發現也能夠使我們更好地理解神經退行性疾病Charcot-Marie-Tooth,這是一種遺傳性、進行性神經性肌萎縮綜合癥,1886年最早由法國兩位神經病學家Jean Martin Charcot和Pierre Marie以及一位英國學者Howard Henry Tooth首先在臨床描述而得名。在某些情況下,這種疾病是由TyrRS基因突變引起。
TyrRS(酪氨酰-tRNA合成酶)屬于一個進化上非常古老的酶家族,對于細胞的蛋白質裝配必不可少。它們能識別包含在基因轉錄本中的代碼,并將其與相應的氨基酸(蛋白質的構建模塊)聯系起來。
TyrRS的作用是識別指定酪氨酸的遺傳代碼。但是近年來有研究發現,TyrRS和細胞中相對豐富的其他tRNA合成酶,具有更多的功能。這些報告是由TSRI教授Paul Schimmel的實驗室在1999年得出,他發現TyrRS有時會浮出垂死的細胞,分成兩塊,每一塊分別攜帶一個傳達到其他細胞的免疫刺激信號。
在2012年的一項研究報道中,楊教授和她的同事們發現,TyrRS在細胞核中似乎有另一個作用,當蛋白質制造過程放慢速度時,它可能在某些時候重新遷移到那里。
楊教授說:“蛋白質合成減少,往往與應激反應有關。所以我們開始順著這個方向進行探索。”
在這項新的研究中,楊教授與TSRI的幾個實驗室共同合作。她說:“專業的寬度和這里的學院環境使這項研究變得更加容易。”
該研究團隊,包括第一作者、楊教授實驗室的助理研究員Na Wei,首先開始在幾種細胞類型中制備不同的壓力條件。研究人員觀察到,只有“氧化”應激——細胞內高活性氧分子過量所造成的一種常見應激,能夠將TyrRS送入細胞核。
TyrRS在細胞核內做了什么?為了了解更多,研究小組記錄了當TyrRS充滿細胞核時,基因表達模式是如何變化的。他們指出,這些變化中的許多變化,在那些與DNA保護和修復相關的基因當中活性激增。將TyrRS排除在細胞核之外,能夠阻止這種激增。
在隨后的實驗中,研究小組對細胞核中TyrRS停止DNA損傷應答的基因表達分子細節,進行了梳理。他們還能夠在培養皿實驗中表明,TyrRS移動到細胞核,提供了相當大的保護來對抗DNA氧化損傷。
DNA修復專家、TSRI副教授Xiaohua Wu指出:“我們發現,TyrRS可促進DNA修復的最保守和無誤差的同源重組途徑,當其受到損傷時,這將有助于維持細胞基因組的穩定性。”
為了確認TyrRS保護作用的生理相關性,研究人員人為地增加了TyrRS在斑馬魚胚胎中的表達,有效地迫使一些TyrRS進入細胞核,在那里它能夠行使其基因激活作用。結果發現,TyrRS的大量涌入,可提供強有力的保護,使其免受紫外線輻射引起的DNA損傷。再次,當科學家們將TyrRS排除在斑馬魚細胞核之外時,保護作用就消失了。
TSRI助理教授Shuji Kishi指出:“這是斯克里普斯研究所一項碩果累累的合作項目。其中,第二作者、楊教授實驗室的Yi ('Eric') Shi發揮了關鍵作用,他迅速掌握和執行了我實驗室中斑馬魚的所有基本技能。利用斑馬魚模型系統,我們能夠在有機體水平上證明TyrRS的基因組保護作用。”
楊教授表示:“對于這樣一個明確的結果,我感到很驚訝。”
她補充說,原則上,將更多TyrRS帶入細胞核或在那里模擬其活性的治療方法,可能為暴露輻射或毒素、或有DNA修復缺陷的人,提供強有力的DNA保護作用。
楊教授也希望,他們發現的TyrRS在細胞核中的這一新作用,最終將澄清Charcot-Marie-Tooth (CMT)的根本機制,這是一種遺傳性周圍神經變性綜合征,影響世界上至少幾百萬人。已知一些CMT病例與TyrRS基因突變有關,2009年的一項研究發現,這些突變并不損害TyrRS在蛋白質翻譯中的的主要酶功能,這表明TyrRS在細胞核中的作用,將是下一個研究的焦點。
楊教授表示:“我懷疑,TyrRS的細胞核功能,與CMT有關。這個假設已經成為我們這項工作的一個重要動機,是我們打算繼續深入探究的事情。”
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