華南植物園揭示錐屬物種基因組變異的驅動機制

遺傳變異的形成與維持機制是進化生物學研究的重要議題。已有研究表明，不同物種間的基因組變異模式存在一定的相似性，并受到多種進化力量的影響。然而，關于不同進化機制對相似基因組變異景觀形成的貢獻以及不同機制間復雜的互作模式尚不清楚。此外，已有研究多是基于近期快速輻射產生的物種或者少量分化時間較長的物種對，缺乏在長期進化尺度上對基因組變異景觀的系統研究。

中國科學院華南植物園組裝了高質量的甜櫧參考基因組，進而對我國亞熱帶常綠闊葉林中廣泛分布的12個錐屬物種進行群體水平取樣，通過基因組重測序獲得了5千多萬個單堿基核酸變異位點。群體基因組學分析發現，這些物種的基因組變異格局高度相似，遺傳變異水平與重組率和基因密度相關，說明長期的連鎖選擇和保守的基因組特征共同塑造了相似的基因組變異景觀。進一步，研究通過追蹤多個遺傳參數間相關性隨著物種分化時間增加的變化趨勢證實，除背景選擇外，反復的選擇性清除也是導致基因組相似變異模式的重要驅動力。該研究通過對不同物種基因組上等位基因分布模式、遺傳負荷積累程度以及正選擇信號的綜合分析，揭示了種間漸滲特別是適應性漸滲對錐屬物種基因組變異模式的影響。

上述研究揭示了多種進化力量共同驅動基因組變異格局的復雜過程與機制。

近期，相關研究成果發表在《分子生物學與進化》（Molecular Biology and Evolution）上。研究工作得到廣東省基礎與應用基礎研究旗艦項目和廣東省重點實驗室項目的支持。