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  • 發布時間:2016-12-08 14:32 原文鏈接: 基于iTRAQ技術鑒定梭子蟹中與生長相關的差異表達蛋白

      梭子蟹廣泛分布在韓國,日本,中國和東南亞的沿海水域。這種物種棲息在河口和沿海水域。 在中國,它是一種主要的食用蟹種和重要的漁業資源,也是中國重要的養殖物種。目前關于梭子蟹的研究已經很廣泛,但關于其遺傳背景信息的研究亟待深入。目前為止,關于梭子蟹蛋白質組學的研究比較少。

      在這項研究中,中國水產科學院李健課題組利用iTRAQ蛋白質組定量分析技術對梭子蟹中與生長相關的蛋白質組進行了分析與鑒定,以了解其分子機制。從梭子蟹五種組織:眼眶、鰓、心臟、肝胰腺和肌肉中分離總蛋白,利用iTRAQ技術對每個組織中等量蛋白質進行蛋白質組分析。基于液相色譜與串聯質譜法和de novo測序數據,總共鑒定了961個蛋白質。以1.2倍的表達變化作為生理學顯著的基準,發現了30個與梭子蟹生長相關的差異表達蛋白(DEP),這些蛋白質大部分是表達上調的,包括參與代謝、免疫反應、DNA重復和蛋白質合成等相關的蛋白質,表明能源守恒是應對生長的重要戰略。使用iTRAQ的分析結果與測定的mRNA表達水平之間存在高一致性,突顯出了蛋白質組學方法的高重現性,以及其在闡明梭子蟹生長調節分子機制中的巨大價值。

      圖 梭子蟹中八個基因的mRNA和蛋白質水平比較

      在本研究中,第一次使用iTRAQ方法來研究梭子蟹中生長相關的分子機制。研究確定的30種新型與生長相關的差異表達蛋白,包括GTP-binding核蛋白和幾種細胞內相關蛋白。 此外,本研究還鑒定了多種免疫及脫皮相關蛋白,揭示了該物種的生長機制。研究還發現,近交繁殖抑制許多生理活性并降低了細胞間蛋白質濃度。

      本研究中的iTRAQ蛋白質組定量分析由聯川生物協助完成。

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