基因檢測的幾個常識

　　關于基因檢測或者說基因測序，還是不要說基因檢測，最好和市面上那些消費級基因檢測拉開些距離，這行的名聲都快被消費級的檢測毀了，我一下說的都是醫療級的測序，包括嬰幼兒的遺傳病篩查、腫瘤的測序和以天賦檢測等消費級基因檢測不是一個東西。消費級的檢測簡直就是笑話。行業內也有大佬說過“毀掉一個孩子最好的辦法就是給他做一個天賦檢測”。

　　關于醫療級基因檢測也寫了好幾篇文章了，時不時還會有人問我一些相關的問題，今天先一次性給大家介紹幾個關于檢測經常會碰見的幾個基本的知識。特別注意，我說的不是消費級的！！！

　　你能接觸到的基因檢測類型

　　全基因組測序（WGS）：對整個基因組的所有堿基進行測序，這樣就可以獲得整個基因組的序列情況。相對外顯子，有些以外的DNA序列也可以影響基因活性，繼而影響蛋白質的表達，導致疾病發生。而只利用全外顯子組測序并不能檢測到。因此，“全基因組測序”，這種方法可以讀取到個體所有DNA核苷酸的序列，即可以檢測出基因組任何部分的變異。

　　主要應用基本都是科研，個人沒有必要用，太貴。

　　全外顯子測序（WES）：利用二代測序技術，對一部分DNA片段含有蛋白質合成的密碼“指令”，這部分片段被稱作“外顯子”（exon）進行測序。外顯子只占到人類基因組的大約1%，基因組中所有的外顯子被統稱為“外顯子組”（exome），對這部分序列的測序就被稱為“全外顯子組測序”。這種方法能夠檢測出所有基因的蛋白質編碼區域的變異，而不僅僅是被選擇的有限的若干基因。由于已知的大多數導致疾病的突變均發生在外顯子中，全外顯子組測序從而被認為是一種高效的識別可能致病的突變的方法。

　　目前最高效的測序方法。外顯子是人基因組的蛋白編碼區域，利用序列捕獲技術可以將其包含22000個基因。主要用于疾病的臨床輔助判別和查找致病基因。

　　全突變測序：大Panel測序，就是熱點區域測序，也有叫靶向測序，主要是對一些選定的基因進行測序（當然越多越好688個基因肯定好過599個的）。通常是對已知致病基因或感興趣的基因進行測序，在臨床中，主要應用于輔助疾病的診斷和治療，這個可能是你們接觸最多的，定價從一萬左右一直到兩三萬都有，各家競爭最激烈的產品線，選擇的時候擦亮你們的雙眼。

　　單病種檢測：小Panel測序，就是對某個疾病突變集中的幾個基因進行檢測，有的公司做的二十幾個基因也有做百十來個的，但是這個類型最大的缺點就是容易遺漏一些突變異質性病種的突變，容易花了錢啥也沒沒檢測到，而且價格也不便宜。

　　基因檢測的方法：

　　一代測序（Sanger測序）:準確性遠高于二、三代測序，因此被稱為測序行業的“金標準”,一次可以得到700-1000bp的序列，序列長度高于二代測序；第一代測序價格低廉一次才十幾到幾十元，但是總成本太高，人類基因組計劃就是用的一代測序花了將近30億美元。

　　二代測序（NGS）：高通量測序又名下一代測序（Next Generation Sequencing，NGS)，核心思想是邊合成邊測序（Sequencing by Synthesis)，即通過捕捉新合成的末端的標記來確定DNA的序列，二代測序技術大大降低了測序成本的同時，還大幅提高了測序速度，并且保持了高準確性。但序列讀長較短，Illumina平臺最長為250-300bp，454平臺也只有500bp左右，二代測序是現階段科研市場的主力平臺，主要應用包括：基因組測序、轉錄組測序、群體測序、擴增子測序、宏基因組測序、重測序等

　　第三代測序技術（單細胞測序）：第三代測序技術與前兩代測序技術相比，其最大的特點就是單分子測序。單細胞測序解決了用組織樣本測序時或樣本少無法解決的細胞異質性難題；為從單核苷酸水平深入研究癌癥發生、發展機制及其診斷、治療提供了新的研究思路，單細胞測序還可被廣泛用于其他重要的生物學研究領域，如組織器官內細胞基因組的異質性研究、干細胞的異質性研究、生殖細胞的遺傳重組研究、胚胎的植入前遺傳學診斷研究。