由浙江海洋學院、上海交通大學、復旦大學等高校研究機構聯合破譯的大黃魚全基因組圖譜,日前在世界權威期刊——《自然》周刊發表。這是繼半滑舌鰨之后,我國公布的第二個海水魚類的基因組圖譜,也是世界上第一個石首科魚類基因組圖譜,標志著我國海洋生物學的研究真正進入基因組時代。
自1985年大黃魚人工養殖取得成功以來,大黃魚成為我國網箱養殖產量最高的海水經濟魚類。但隨著養殖產業的進一步發展,人工養殖大黃魚遺傳多樣性降低、抗病能力減弱的問題日益成為困擾大黃魚養殖產業發展的重要瓶頸。
“養殖大黃魚抗病能力差,是不是可能與其免疫系統的特定基因組及其特定進化模式有關聯?”浙江海洋學院吳常文教授等科研團隊成員基于這樣的懷疑,于2010年以來展開專題研究,2012年,《基于全基因組信息的魚類遺傳育種》項目列入國家863計劃項目。科研人員試圖通過大黃魚基因組測序、基因注釋,解析大黃魚抗病性狀的遺傳基礎,為大黃魚抗病力的遺傳解析和抗病力強的優良品系培育奠定了基礎。
科研人員發現,繪制出基因序列圖譜的大黃魚基因組,包含48條染色體,比人類還多兩條,全基因組大小在750米左右,相當于人類的1/4。
以往包括大黃魚在內的硬骨魚免疫基因功能的研究發現,大黃魚存在一些重要的先天免疫基因,這些基因被海洋病原菌感染后,在魚體內的表達將嚴重下調。科研團隊對大黃魚進行了高深度全基因測序、從頭組裝和分析,發現大黃魚具有發育良好的先天免疫系統,形成了一套獨特的免疫模式,部分基因在大黃魚先天性免疫方面起到了重要作用。
這一研究展示了令人興奮的應用前景,研究團隊下一步將重點研究挖掘其他更多的免疫基因,闡明它們在免疫中的作用,解析它們在抗病力呈現中的權重,進而檢測野生大黃魚和養殖大黃魚的免疫基因組成差異。
研究人員表示,通過大黃魚免疫基因位點優良等位基因的聚合和選育,將有望培育出先天免疫能力強、抗病力高的大黃魚抗病品系,解決養殖過程中大黃魚病害頻發的瓶頸問題。除此之外,研究團隊將通過基因組信息的挖掘,發現更多與大黃魚生長、抗逆、性成熟等生產性狀有關的基因,全面提高養殖大黃魚生產性能,促進大黃魚增養殖產業的發展。
據介紹,《自然》周刊所刊載的內容涵蓋了自然科學各個研究領域,尤其在生物學、醫學、物理學等領域卓有成就。許多新的發現、創新性的文獻大多首發于《自然》周刊。我國每年公布的世界十大科技新聞,也大多來源于《自然》周刊。
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