近日,在國內高等學府清華大學醫學部的高性能計算系統項目招標中,中國國產服務器第一品牌曙光公司再傳捷報,經過用戶的測試比較,曙光解決方案在spider(掃描電鏡后處理軟件)上面運行的成績明顯優于競爭對手,屆時曙光5000高性能計算系統平臺將全面運用于清華大學醫學部。
據了解,掃描電鏡是生命科學研究中必不可少的儀器設備,獲得重要科研進展的重要工具,這種實驗設備往往科技含量,價格昂貴。掃描電鏡系統則是通過用極細的電子束在樣品表面掃描,獲得原始數據(RAW DATA)然后通過軟件進行提純和分析,將產生的二次電子用特制的探測器收集,形成電信號運送到顯像管,在熒光屏上顯示物體,(細胞、組織)表面的立體構像,攝制成照片,獲得人類認知范疇之內的信息。
隨著社會經濟的發展,人類越來越注重身體的健康,生命科學和醫學被認為是當今世界科學技術領域最活躍、最有希望取得關鍵性突破的學科之一,醫學部充分利用清華的師資和實驗室條件,完成相關理工學科基礎教學任務,建立起一套比較完整、先進的基礎及臨床醫學的教學系統平臺。
立足于清華大學醫學部對計算的需求特點,曙光為清華大學選用了掃描電鏡后處理軟件spide,但是最重要的應用電鏡后處理軟件spider,占整個應用的70%以上 ,針對spider軟件的計算量大,對內存容量和帶寬要求高,曙光使用具有直連架構的AMD 六核處理器,將內存的容量擴展至32GB,從而有效消除前端總線的瓶頸,大幅提高內存的容量和內存訪問帶寬。
Spider軟件的應用主要以openmp方式為主,普通刀片的計算能力和內存容量難以滿足需求,在大部分的計算都能通過刀片集群滿足用戶需求的情況下,曙光配置了一臺高性能的SMP胖節點,該計算節點的計算能力達到單臺32核心,內存容量更是擴展到128GB。
管理軟件方面,考慮到系統的易管理、易維護、易使用性,保證系統的高效運行,曙光大型管理監控軟件Gridview,提供統一的集中式監控平臺,具備可擴展性、集成性、可靠性和易用性,提供對各種商用、自己研發的管理工具的集成接口,從而滿足同時對各不同廠家大型機的環境、硬件、軟件等各方面進行監控的需求。中文的瀏覽器管理界面,高效的圖形界面的作業調度系統,真正降低用戶的使用難度,保證了系統的高效運轉。
而在服務方面,曙光將在原有服務的基礎上進行升級,承諾7*24小時,五年原廠工程師免費上門服務,在接到報修后,曙光的技術人員會在30分鐘內進行電話反饋。如果確認需要現場服務,曙光工程師將在4小時內上門(或在途)。
此次清華大學醫學部曙光5000高性能計算系統平臺的建設不僅能有效的滿足目前的計算需求,整個系統的架構還可以滿足未來幾年技術和應用發展的需要,能夠達到保護用戶投資的目的。同時,該系統平臺解決方案的完整性和先進性等優勢必將為清華大學醫學部研究水平的提升起到關鍵性的作用,并將為清華大學走向世界的奮進目標邁出了重要一步。
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