李虹：以黨建促創新，“跨界”的系統生物學家

　　學術帶頭人、婦委副主任、黨支部書記……中國科學院上海營養與健康研究所（以下簡稱營養與健康所）研究員李虹身上，有著多個“標簽”，正如她的名字一樣，如彩虹般多彩。

　　這些身份匯聚成一起，則是簡單的白色。回歸人物本身，李虹是一位純粹、熱愛科研的科學家。她被科學的未知所吸引，也為經過努力問題得以解答而欣喜。

　　獲國家自然科學基金優秀青年項目、上海市科技系統“青年五四獎章”榮譽稱號、上海市科技系統“三八紅旗手”稱號、研究成果曾入選中國生物信息學十大應用......李虹卻認為自己“只是一名普通的科研工作者”。

李虹。

　　“跨界”的系統生物學家

　　作為生物（BT）與信息（IT）融合的科學家，李虹自學生時代以來，經歷了幾次跨界。

　　2005年，李虹以年級第一的成績從中南大學信息與計算科學專業畢業。當同學大多數都去IT或金融行業時，懷著對生命科學好奇心的她，決定去生物學領域看看，來到中國科學院上海生命科學研究院讀博，扎進生物信息學領域。

　　2013年10月，李虹從美國系統生物學研究所再次回到中國科學院上海生命科學研究院，從助理研究員開始，把研究方向從遺傳病轉向腫瘤，并將系統生物學的思想應用于腫瘤研究。

　　從數學到生物、從遺傳病到腫瘤，回顧這段看似曲折的科研之路，李虹走得不急不躁且堅定。“學數學是偶然，但我非常感謝這段經歷。”李虹表示，“本科階段的基礎訓練非常有用，有一些知識現在依然可以用到。”

　　經典生命科學研究大多從假設出發、以實驗為主，而生物信息學則是數據密集型的研究。面對假設驅動和數據驅動的鴻溝，首先需要聽懂對方的語言。李虹指出：“厘清大數據和生物臨床問題之間的邏輯，需要從整體、系統的視角去理解科學問題，再找到最合適的方法解決”。聽起來似乎不難，但兩者的無縫結合，離不開學科交叉，同時需要生物學家和臨床醫生之間長期的思想碰撞。

　　問最重要的問題，啃難啃的“硬骨頭”。目前，腫瘤研究是前沿生物技術最為集聚的領域之一，這要求科學家針對新技術持續迭代、優化計算方法。

　　李虹同合作者在肝癌個體化用藥的智能分析和應用、肝損傷再生、胰腺癌肝轉移等方向取得系列進展，形成了“科學問題-產生數據-深度分析-實驗驗證-解決問題”的研究閉環。

　　“近幾年，我們聚焦單細胞和空間多組學數據的共性問題和技術瓶頸，整合分子組學和病理表型，以期通過系統生物學發研究策略，持續優化研究方法，提升解決科學問題的能力。”李虹說道。

　　同時，李虹結合臨床醫生的診斷需求，開發病理切片的人工智能模型。“診斷結果直接關系著病人的治療方案，我們希望通過這個工作，幫助到更多臨床醫生。”李虹表示，“這是課題組的一個新方向，雖然未必能在短期內看到成果，但非常有必要堅持下去。”

　　“以黨建促創新”

　　李虹是一名有著二十年黨齡的科學家，對她而言，將科研同國家需求相結合，是一件“十分自然”的事情。擔任計算生物學第二黨支部書記以來，李虹一直在思考，如何將黨建工作有效融入科研工作。

　　近些年，我國肝癌的流行病學發生了顯著變化。一方面，在疫苗的普及下，原本主要由乙型肝炎病毒（HBV）感染引起的癌癥得到了控制；另一方面，隨著人們生活方式的改善，長期的慢性脂肪肝發展為肝癌的患者開始增多。

　　在“健康中國”的大背景下，是否可以結合系統生物學的方法，在病人的癥狀發展為癌癥之前就開始早期防控，變治“已病”為“未病”？

　　李虹認為，應該發揮營養與健康所的建制化優勢，結合系統生物學的方法，去做一些事情。她主動轉變研究方向，帶頭參與營養與健康所重點部署的“揭榜掛帥”科技任務，同研究所聚焦代謝和免疫的課題組合作。“即便同是濕實驗的實驗室之間，工作內容也有非常大的差異，因此我們合作前期需要花費相當多的時間和精力，互相溝通學習。”李虹說道。

　　如今，因為“對共同的科學問題感興趣”而形成的合作團隊，已經形成了“分可獨立作戰，聚可合力攻關”的氛圍，他們協同攻關，共同打造“營養-大數據-健康”為一體的“治未病”平臺，探索慢性脂肪肝炎轉變為肝癌的機理。

　　在李虹的帶動下，計算生物學第二黨支部已成為營養與健康所“以黨建促創新”的科研新標桿。2023年，她和其他單位的兩位黨支部書記共同牽頭，聯合舉辦了一個非常有影響力的生物信息學青年論壇。

　　“我們希望以黨建為抓手，把各個單位組織起來，為不同課題組之間提供一個交流平臺。”李虹表示，“雖然目前還沒有落實到不同支部的科研人員合作申請項目，但是我們相信這是一個很好的開始。”

　　從學生到導師

　　作為一名由中國科學院培養的“國產”學術帶頭人，獨立成立課題組后，李虹把相當一部分的精力放在了學生培養上。

　　系統生物學是一個對綜合素養要求很高的領域，需要掌握生物學、數學、信息科學等不同領域的知識。李虹課題組的學生也有著不同的背景和興趣點。她堅持因材施教的原則，和每一位剛入組的學生進行深度溝通，傳授入門交叉學科的方法，并幫助他們確定適合自己的課題。

　　“做第一個課題的過程中，孩子們其實是在學習并了解如何探索未知，過大的不確定性可能會對他們造成很大的打擊。”李虹補充，“我不希望我的學生將來帶著畏難情緒或者遺憾畢業。”

　　從第二個課題開始，李虹開始鼓勵學生做更有挑戰的課題，主導課題的設計，并從中發現新的問題。期間，不乏有學生的選題進展遇到了一定的阻滯，李虹可以感受到他們面臨的壓力。在協調資源、尋找合作伙伴解決問題的同時，她也會反復去和學生強調課題的重要性，解釋進展緩慢的原因。

　　“我在學生階段，也在科研中遇到過困難，這是很正常的，我很擔心學生會因為課題的不順利而自我懷疑。”李虹希望用自己的經驗教會學生在困難中成長，給他們更多的信心。

　　在李虹的指導下，近年間實驗室陸續有科研成果發表，她為學生開心的同時，更欣慰于他們的成長。李虹也期待著，和學生們一起解決更多難題。