HIVAN治療原則主要為降低病毒復制和延緩腎臟疾病進展，其他還包括對癥支持治療及合并癥的治療。
1．高效抗逆轉錄病毒治療（highly active anti-retroviral therapy，HAART）： 聯合應用抗病毒藥物，過去稱“雞尾酒療法”，是治療 HIVAN的重要措施。用于治療 HIV感染的藥物主要有三類：①核苷類逆轉錄酶抑制劑（NRTI）：如拉米夫定（3TC）、齊多夫定（AZT）、恩曲他濱（FTC）等；②非核苷類逆轉錄酶抑制劑（NNRTI）：如依法韋侖（Efavirenz）、奈偉拉平（Nevirapine）等；③蛋白酶抑制劑（PI）：如替諾福韋（TDF）等。認為，采用強有力的 PI加上兩種NRTI或兩種 PI加上 NRTI中的 1~2種可取得較好的治療效果。因大多數抗病毒藥物主要經腎臟排泄，在腎功能減退時需注意調整劑量。
2. 延緩腎臟疾病進展，保護腎功能
（1） 激素和免疫抑制劑：有個別報道在 HIVAN患者使用激素及免疫抑制劑（如環孢霉素）有效，但也有相反報道稱使用該類藥物不但不能降低蛋白尿，反而可因增加患者的條件性致病感染而導致死亡率升高，且對各種惡性腫瘤的發生是否有促進作用尚不得而知。因此，對激素及免疫抑制劑的應用需謹慎選擇，注重個體化。
（2） 腎素-血管緊張素-醛固酮（renin-angiotensin-aldosterone system, RAS）系統抑制劑：少數研究發現使用血管緊張素轉換酶抑制劑（angiotensin convert enzymeinhibitor, ACEI）或血管緊張素受體拮抗劑（angiotensin receptor blocker, ARB）對HIVAN有治療作用，可降低患者的蛋白尿水平、延緩腎臟疾病進展，但其確切療效仍需進一步研究加以證實，同時治療期間需定期監測血鉀和腎功能。
（3） 透析和移植：HIVAN患者進展至終末期腎衰竭后需適時開始透析，血液透析和腹膜透析療效相當。有關 HIVAN腎移植問題研究較少，尚不能肯定其療效，個別報道在 CD4 +T細胞計數>400/ul、無 HIV病毒活動性復制及無機會性感染的患者施行腎移植并獲得成功。但因 HIV腎移植患者條件性致病感染的發生率很高，其遠期生存及預后不明確。
3. 對癥支持治療
（1） 隔離傳染源，防止 HIV感染傳播。醫護人員的防護，做好消毒隔離工作很重要；
（2） 活動期 AIDS患者應予充分休息，補充足夠熱量和營養；
（3） 積極防治各種感染，避免加重腎損傷的各種危險因素；
（4） 對癥支持治療，高熱時可應用退熱藥物及物理降溫；
（5） 防治腎衰竭相關并發癥 如貧血、鈣磷代謝紊亂、水電解質及酸堿平衡失調等等。
4. 合并癥的治療
（1） 患者常合并致病菌感染和條件致病性感染，應根據病原學選擇敏感的抗菌藥物治療，積極控制感染病灶；
（2） 對于發生各種惡性腫瘤患者，可適當選用抗腫瘤藥物。