藥源性肺病的診斷比較困難，原因是其肺部改變為非特異性，又缺少特異性檢查手段，有些輔助檢查如免疫學檢查、組織學檢查和肺功能檢查雖可有一定幫助，但無特異性，另外由于受到病人和醫院條件的限制，并非所有病人都能進行上述檢查。診斷最重要的是要有對藥源性肺病的警惕性和可靠詳細的用藥史，因此臨床醫師應對各種藥物的藥理作用，適應證，劑量，給藥途徑和副作用等有所了解。若在用藥過程中，一旦發現不良反應，應結合臨床經過，作全面深入的分析，排除肺部其他疾病，作出正確的診斷。可疑病例及時停藥后癥狀消失有助于診斷，但晚期病例的組織學變化常呈不可逆性，故停藥后癥狀持續并不能排除藥源性肺病的可能。