江蘇疾控首次鑒定一種新型環狀單鏈DNA病毒

　　該病毒是我中心病原所對今年9月27日江蘇出入境檢驗檢疫局送檢的一例從新加坡回國的發熱病人咽拭子樣本進行病原體檢測后所得。病原所實驗室人員通過對送檢樣本用高通量測序技術檢測發現其中含有一種新型環狀單鏈DNA病毒片段，后根據高通量測序reads序列設計特異引物，對病人咽拭子樣本進行PCR擴增，產物經過sanger測序、序列組裝，于10月26日獲得該病毒全長基因序列3018 nt。

　　該病毒基因組含2種主要開放讀碼框（ORFs），分別編碼復制酶蛋白Rep和衣殼蛋白Cap；有2個基因間隔區，其中大的間隔區含有環狀病毒特征性莖環結構。與該病毒最相似的為豬糞相關的環狀病毒5（porcine stool-associated circular virus 5 (PoSCV5) , isolate CP3），編碼蛋白氨基酸序列相似性約為43%和50%，進化分析揭示這2種編碼蛋白分別與環狀病毒科及未分類的環狀單鏈DNA病毒聚為一類，疑似為一種新型病毒。初步將該病毒命名為Human PoSCV5-like circular virus (isolate MRJ) ，基因組序列已遞交GenBank數據庫（Accession no. KY052047)。

　　對病人的尿、血和唾液樣本進一步檢測發現，唾液中可以檢測出，而尿和血液中檢測不到。豬糞相關的環狀病毒可引起豬腹瀉，人未見感染報道。其他種屬的環狀單鏈DNA病毒有在多發性硬化癥病人的腦積液和血清、心包炎病人的心包液及腦炎病人的腦積液檢測出的報道，但是與疾病的聯系均不能確立。該新型環狀單鏈DNA病毒與病例所患疾病的關聯還不明確。

　　目前，實驗室正對樣本進行病毒分離培養，以便開展下一步的研究工作。該新型環狀單鏈DNA病毒為世界首次鑒定，體現了江蘇疾控中心不明原因疾病鑒定能力的進一步提升。