在每一個人的身體里,每天都有數萬億個細胞在安靜地工作、分裂、死亡。維持這套系統精密運轉的,是一套我們看不見也感覺不到的“指令系統”。而當這套指令的“剪輯”出現錯誤時,癌癥、發育畸形、神經退行性疾病就可能接踵而至。
日前,西湖大學萬蕊雪團隊聯合施一公團隊在國際學術期刊《Vita》上發表了一項最新研究,他們首次解析了人源U12型剪接體在催化核心狀態的高分辨率結構,并揭示了數個與腫瘤發生發展密切相關的關鍵蛋白。
值得注意的是,他們在“剪輯”現場,揪出了幾個與癌癥密切相關的“幫兇”。這不僅是結構生物學的一次突破,更有可能為未來的抗癌藥物,打開一扇全新的大門。
而這一切的背后,是一段跨越六年、歷經107次失敗的真實故事。
論文截圖
追蹤一臺看不見的“幽靈機器”
我們的生命密碼(DNA)就像一本厚重的“人生指南”,但細胞在“閱讀”時,并不會逐字逐句地念。因為這本書里充斥著大量“無用信息”(內含子),必須經過“剪輯”,再把有用的段落(外顯子)無縫拼接,才能生成正確的“工作指令”(mRNA)。
負責這項“剪刀手”任務的,是一臺名為“剪接體”的超級分子機器。而在龐大的剪接體家族中,有一支神出鬼沒的“特種部隊”——稀有的U12型剪接體。
為什么說它“稀有”?萬蕊雪打了個形象的比方:如果說負責99%以上剪輯工作的主要剪接體,是城市主干道上川流不息的車流,那這支“特種部隊”就是深夜里偶爾駛過的一輛自行車。
“一旦這臺機器發生故障,后果往往是災難性的,癌癥、嚴重的生長發育缺陷、神經退行性疾病便會接踵而至。”萬蕊雪解釋道。
自20世紀90年代被發現以來,稀有剪接體已困擾了學界三十余年,因它在細胞內含量極低,像一臺看不見的“幽靈機器”。
“它是RNA剪接機理方面,一個顯著存在的未解之謎。”萬蕊雪說。這是一個充滿誘惑卻又極具挑戰的領域。作為剛剛獨立的青年科學家,她的目標明確:不僅要看到它究竟“長什么樣”,還要看清它究竟“怎么工作”。
2021年和2024年,萬蕊雪團隊與施一公團隊合作,先后在《科學》雜志上發表了稀有剪接體在“準備開工”(激活態)和“剛組裝好”(組裝態)狀態的結構。但這些狀態,都只是“剪輯”開始前的準備工作。真正的核心——催化反應,即那把“剪刀”如何落下(催化態),依然是一個深不見底的黑箱。也是在這一步,萬蕊雪發現,他們被難住了。
論文資料圖
107次“迭代”后的奇跡
要想看清“剪輯”過程,首先得讓這臺“幽靈機器”在工作時被“抓”住。
這幾乎是個不可能完成的任務。它在細胞里的含量只有“主力部隊”的1%左右,且極不穩定。想讓它在體外“聽話”地進入工作狀態,曾是領域內無人敢輕言攻克的關卡。
科研團隊設計了一種高效的“誘餌”(pre-mRNA)——一段需要稀有剪接體“剪輯”的特定素材,能夠像釣魚一樣,特異性地從細胞提取物中“釣”出目標機器。
這更像一場漫長的“迭代游戲”。他們像一群精細的工匠,反復調整“誘餌”的設計:修核心序列、換外顯子、加增強子……每一次調整,都只為讓活性提升一點點。
測試、失敗、再調整、再測試……這樣的循環持續了整整三年。
“我們肯定是在不斷地主動想辦法,而不是中途放棄。”萬蕊雪回憶,“每次活性提升了一點點,我們馬上興奮地去試新實驗。”
終于,在第107次嘗試時,奇跡發生了:經過特殊改造的“誘餌”,讓稀有剪接體的體外工作效率提升了約100倍!這就好比原本一分鐘只能剪輯1條素材,現在能剪100條。這一數量級的跨越,讓捕捉“剪輯進行時”從不可能變成了可能。
科研團隊合影 白蕊(左)與郭晗(右)
意外牽出的“癌癥線索”
捕捉成功后,團隊利用冷凍電鏡技術,第一次讓人類親眼“看見”了稀有剪接體執行剪接反應的完整瞬間,并在高清結構下,看清了許多令人驚嘆的細節。
真正的驚喜來自“合影”里出現的幾個“無關人員”。在解析結構時,團隊發現有幾個從未見過的蛋白質,死死地“卡”在剪接體的關鍵位置上。順著線索追查下去,他們發現,這些蛋白,竟然都與癌癥密切相關。
比如MMTAG2,是一個在多發性骨髓瘤中異常活躍的蛋白。研究發現,它像一根“支柱”,撐住了剪接體的活性中心。這意味著,癌細胞可能正是在利用這根“支柱”來維持瘋狂生長。
又或者WDR25和FAM204A,是剪接第二步反應的“穩定器”。過往數據顯示,它們在多種癌癥患者體內的含量,直接與患者的生存率掛鉤。
雖然目前還不清楚這些蛋白是導致癌癥的“元兇”,還是癌癥帶來的“幫兇”,但這項研究無疑為抗癌藥物的開發提供了一批全新的潛在“靶點”。或許未來,我們可以通過干擾這些蛋白,來切斷癌細胞賴以生存的剪接通路。
從“剪接體長什么樣”到“它為什么要長這樣”,萬蕊雪的追問還在繼續。對于這位年輕的科學家來說,解析結構只是揭開帷幕一角,更廣闊的未知在于進化邏輯與疾病關聯的深層拷問。而科學最迷人的地方,或許正是在于這種從分子機器的精密運轉中,窺見生命與疾病隱秘關聯的瞬間。
(西湖大學供圖)
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