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  • 發布時間:2019-03-15 11:00 原文鏈接: 陳大華/孫欽秒團隊蛋白聚集參與果蠅壽命調控新機制

      傳統觀點認為,真核細胞中RNA結合蛋白(RBPs)通過它們的RNA結合結構域(如KH、RRM結構域等)與其靶RNA結合形成RNP復合物(RNA granules, RNA顆粒),從而調控靶RNA的命運和功能【1,2】。近來研究揭示,許多RBPs含低復雜度Low Complexity(LC)結構域【3-5】。LC結構域不僅可以通過液-液相變形式,調控RBPs “自我聚集”的狀態,同時也可能以低親和力形式與RNA結合參與RNA顆粒的組裝,但是LC結構域與RNA相互作用的生物學功能及其調控機制遠不清楚。有趣的是,一些RBPs不僅含有LC結構域,同時還具有酶的活性(如泛素和去泛素的酶活),LC與RNA相互作用是否影響蛋白的相變、聚集,進而調控酶活是RNA生物學領域中的一個值得關注的研究方向。

      Otu家族蛋白代表一大類去泛素化蛋白酶。果蠅Otu 蛋白是第一個被鑒定的Otu家族成員,并具有結合RNA的特性,但與其它Otu家族成員相比,果蠅Otu 蛋白具有獨特的酶活中心。有趣的是,果蠅Otu還含有一個經典的LC結構域,但其生物化學和生物物理特性不詳。

      中科院動物研究所陳大華和孫欽秒研究組對果蠅Otu的酶學特性和生物學功能進行了長期和系統的研究【6】。2019年3月14日,他們在Molecular Cell上發表文章LC Domain-Mediated Coalescence Is Essential for Otu Enzymatic Activity to Extend Drosophila Lifespan,發現LC結構域調控Otu蛋白相變,并在Otu的“自我聚集”行為中發揮著不可或缺的作用。重要的是,“聚集”形式的Otu蛋白作為一種有活性蛋白酶,催化底物的去泛素化。進一步研究發現,RNA通過與Otu蛋白LC結構域結合促進Otu的“自我聚集”,并正向調控其酶的活性。遺傳學研究表明,Otu酶活功能對于控制正常水平的腸道免疫活性,保證腸道屏障的穩態維持至關重要。當Otu表達失調或蛋白聚集受阻時,果蠅腸道屏障功能受損,免疫信號紊亂,壽命縮短。

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      體內Otu的“自我聚集”行為和酶活是一個可調控過程。分子伴侶蛋白Bam與Otu蛋白形成復合物,促進Otu聚集,增強其去泛素化酶活性,協助參與對免疫信號及壽命的調節。同時Bam的表達隨年齡的增長呈動態性變化,在果蠅成長和衰老過程中,Bam的動態變化影響并調節了Otu的活性,從而調節果蠅壽命。機制上,Bam/Otu復合物靶向IMD信號通路重要因子dTraf6,影響其K63位泛素鏈的切割。Otu/Bam/dTraf6三者形成可調節的“反饋軸”,在果蠅衰老過程中動態調控IMD免疫信號通路,影響果蠅腸道的屏障及穩態,進而影響果蠅壽命。

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    圖 Otu-Bam-dTraf6調控軸調節果蠅免疫及腸道穩態

      蛋白在細胞中的狀態直接影響細胞的命運決定及疾病的發生。大量研究表明,蛋白的聚集異常是阿爾茨海默癥、亨廷頓舞蹈癥、肌萎縮側索硬化癥等許多神經退行性疾病的病因【7,8】。果蠅Otu研究揭示蛋白“自我聚集”不僅可以控制酶的活性,以應對生理和環境的變化, 同時這一動態調控機制對于維持腸道穩態,個體健康及延緩衰老上具有重要意義。

      原文鏈接:

      https://doi.org/10.1016/j.molcel.2019.02.004

      參考文獻

      1. Lunde, B.M., C. Moore, and G. Varani, RNA-binding proteins: modular design for efficient function. Nat Rev Mol Cell Biol, 2007. 8(6): p. 479-90.

      2. Kiebler, M.A. and G.J. Bassell, Neuronal RNA granules: movers and makers. Neuron, 2006. 51(6): p. 685-90.

      3. Han, T.W., et al., Cell-free formation of RNA granules: bound RNAs identify features and components of cellular assemblies. Cell, 2012. 149(4): p. 768-79.

      4. Kato, M., et al., Cell-free formation of RNA granules: low complexity sequence domains form dynamic fibers within hydrogels. Cell, 2012. 149(4): p. 753-67.

      5. Murray, D.T., et al., Structure of FUS Protein Fibrils and Its Relevance to Self-Assembly and Phase Separation of Low-Complexity Domains. Cell, 2017. 171(3): p. 615-627 e16.

      6. Ji, S., et al., Bam-dependent deubiquitinase complex can disrupt germ-line stem cell maintenance by targeting cyclin A. Proc Natl Acad Sci U S A, 2017. 114(24): p. 6316-6321.

      7. Bentmann, E., C. Haass, and D. Dormann, Stress granules in neurodegeneration--lessons learnt from TAR DNA binding protein of 43 kDa and fused in sarcoma. FEBS J, 2013. 280(18): p. 4348-70.

      8. Kim, H.J., et al., Mutations in prion-like domains in hnRNPA2B1 and hnRNPA1 cause multisystem proteinopathy and ALS. Nature, 2013. 495(7442): p. 467-73.


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