陳玲玲，楊力受邀Cell子刊發表綜述：核重復序列

　　2月10日，上海生化細胞所陳玲玲研究員與上海生科院（健康院）計算生物學所楊力研究員受邀在《Trends Cell Biol》發表了題為“ALUternative Regulation for Gene Expression.”的綜述論文，系統總結了靈長類（包括人）基因組中特異的Alu短散在核重復序列（short interspersed nuclear elements）在基因表達過程中的重要調控作用。

　　45%的人類基因組序列由轉座子來源的序列構成，其中很重要的一部分是短散在核重復序列（short interspersed nuclear elements, SINE）。在包括人在內的靈長類基因組中存在一類特殊的SINE序列－Alu序列，其約300 bp長。其中，人類基因組中包含了超過一百萬個的Alu序列，占據了人類基因組超過11%的序列構成。Alu等重復序列在前期通常被認為是無用的“垃圾”序列，但是隨著研究的深入，大量的證據表明Alu無論是在基因組進化（DNA和轉錄調控水平），還是在遺傳信息的多樣性（表觀遺傳調控和RNA水平）都發揮重要的調控作用。

　　有意思的是,Alu序列可以通過RNA Polymerase III獨立轉錄、或者是通過RNA Polymerase II共轉錄，產生各色各樣的RNA分子并發揮重要的基因表達調控作用，例如,大量存在于內含子的Alu序列可以通過反向互補形成RNA配對結構（inverted repeated Alu sequences, IRAlus）調控環形RNA的生成加工，而人基因組中所蘊含的大量特殊Alu序列則是環形RNA在人中高表達的主要原因之一。發表在《Trends Cell Biol》上的這一特邀綜述論文，主要對上述多種Alu序列的重要調控新功能進行了總結和展望。

　　陳玲玲研究組致力于長非編碼RNA和環形RNA的代謝機制與功能作用研究，楊力研究組專注于轉錄組RNA計算生物學研究。近期通過合作，系統揭示了多種新型長非編碼RNA，并全面揭示了這些特殊結構非編碼RNA生成加工的新機制及其潛在的重要生物學功能，極大地推動了長非編碼RNA研究領域的發展，其在Alu序列對環形RNA生成加工機制的合作研究處于該領域的國際領先水平（Zhang et al, Cell, 2014； Zhang et al, Cell Rep, 2016； Zhang et al, Genome Res, 2016； Dong et al, RNA Biol, 2017； etc），并多次撰寫相關研究進展綜述（Chen and Yang, RNA Biol, 2015； Yang, WIREs RNA, 2015； Chen, Nat Rev Mol Cell Biol, 2016； etc）。