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  • 發布時間:2008-12-20 21:21 原文鏈接: 鼻息肉的22DE圖譜建立和蛋白質組學分析

    [摘要]  目的: 建立鼻息肉及鼻黏膜雙向凝膠電泳( two 2dimensionalpolyacrylamide gel electrophoresis,2 2DE) 圖譜,鑒定差異表達蛋白質。方法: 收集鼻息肉及鼻黏膜樣本各7 例,采用固相pH 梯度2 2DE,凝膠銀染,掃描圖像, ImageMaster 2 2DE軟件比較分析等方法,識別差異表達蛋白質, 通過質譜分析得到相應肽質指紋圖譜( pep tide mass fingerp rint, PMF ) ,采用Pep tIdent軟件查詢Swiss2Prot and TreMBL 數據庫, 鑒定差異表達蛋白質。結果: 建立了鼻息肉和鼻黏膜蛋白質的2 2DE圖譜。鼻息肉和鼻黏膜3 塊凝膠的平均蛋白質點數分別為82 5 ±78 和9 36 ±6 2; 平均匹配點數為6 82 ±9 6 和8 21 ±7 8 , 匹配百分率為82. 7%和8 7. 7% ; 同一鼻息肉的3 塊膠在蛋白質點位置上有較好的重復性, 不同膠間蛋白質點在等電聚焦( IEF )方向偏差為( 1. 0 6 ±0. 14 ) mm ,在SDS2PAGE方向偏差為( 1. 45 ±0. 21 ) mm。比較分析兩種組織各7 例樣本的2 2DE圖譜,鼻息肉和鼻黏膜蛋白質點數為1 458 個和1 6 17 個, 平均匹配點數為1 0 26個。質譜分析差異蛋白質點40 個, 獲取3 4 張PMF , 查詢數據庫鑒定出蛋白質24 個。結論: 建立了分辨率高和重復性好的鼻息肉及鼻黏膜2 2DE圖譜,識別鑒定出一些與鼻息肉病變相關的蛋白質。
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