近日,國家微生物科學數據中心發布了由中國科學院微生物研究所、中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院、中國科學院海洋研究所等單位牽頭的2019年科技基礎性工作專項微生物領域項目數據集,所有公開數據通過國家微生物科學數據中心門戶對國內外科學家共享(www.nmdc.cn)。此次共開放數據集107個,來自于2019年結題的7個項目、20個數據提交單位,數據集涵蓋2012-2019年23個省份的微生物菌種資源數據、標本數據、DNA條形碼數據,還包括專項形成的志書、報告、標準規范等文檔數據。其中,菌種數據865個屬39 757條,標本數據858個科,2108個屬,58 555條,圖片96 600張,序列文件538 300條,2015-2019《西藏地區極端特色微生物菌種名錄》、《中國大小興安嶺真菌名錄》等志書25本,《青藏高原及新疆地區特色微生物資源與多樣性調查報告》等調研報告6份,標準規范5份。

圖1. 2019微生物領域科技基礎性工作專項項目科學數據

圖2. 數據匯交情況
通過各單位初步的數據匯交集成后,國家微生物科學數據中心進一步審核了匯交數據的完整性,并完成了數據分類去冗余,物種名稱標準化,數據編號規范化等質量控制,從而保證數據準確性和可用性。數據中心將加工整理后的數據入庫并開發了數據檢索和展示系統。用戶可以通過每個項目展示頁面瀏覽該項目基本信息,元數據/數據,也可以通過選擇項目名稱、數據集、數據類別及輸入關鍵詞等方式對數據進行精準檢索。在此基礎上,建立了微生物菌種資源數據庫、真菌條形碼數據庫、標本資源數據庫、微生物圖像數據庫等幾大核心數據庫。

圖3. 數據集元數據描述

圖4. 數據檢索
科技基礎性工作是基礎研究的重要組成部分,為認識自然現象和發現科學規律做出了卓越的貢獻,具有基礎性、長期性和公益性的特點。依據《科學數據管理辦法》和《科技基礎性工作專項項目科學數據匯交管理辦法(試行)》,國家微生物科學數據中心對科技基礎性工作專項微生物領域的項目完成了數據接收、審核、驗收、分級分類、加工整理并根據數據共享級別,進行公開共享等工作,在保障科學數據安全的同時,推動了科學數據資源向社會開放共享。
近日,國家微生物科學數據中心發布了由中國科學院微生物研究所、中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院、中國科學院海洋研究所等單位牽頭的2019年科技基礎性工作專項微生物領域項目數據集,所有公開數據通過國......
近日,國家微生物科學數據中心發布了由中國科學院微生物研究所、中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院、中國科學院海洋研究所等單位牽頭的2019年科技基礎性工作專項微生物領域項目數據集,所有公開數據通過國......
細胞是構成人體的基本單位。一個成年人的細胞數量大約是10的13次方,而與人體共生的細菌比人體細胞還要多10倍,其中腸道菌群就包含了500-1000種不同的細菌。早在1886年,就有學者發現了大腸桿菌對......