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    利用CRISPR研究基因組“暗物質”

    超過98%的人類基因組由非編碼基因組成。這些非編碼基因被稱為基因組的“暗物質”,它們能調控編碼基因的表達,從而影響人類健康和疾病進程。自從人類基因組序列被公開發表以來,科學家們努力解析基因中的功能元件,包括非編碼調節區——參與轉錄調節的順式調節區和非編碼RNA(ncRNA)。轉錄因子在整個基因組中可能有數百至數千個結合位點,因此研究起來非常復雜。目前常用的兩種研究轉錄因子調控基因表達位點的方法是:1,耗時且復雜的增強子研究;2,在非天然狀態中克隆增強子或啟動子序列,開展并行研究。最近Sanjana等人和Fulco等人的研究都指出,可以利用CRISPR技術在天然狀態里研究非編碼調控元件的功能。 大規模的生化試驗使人們發現了由潛在的、被數百種蛋白靶向結合的調節序列。值得一提的是,識別脫氧核糖核酸酶I超敏感位點(deoxyribonuclease I hypersensitive site, DHS)和大規模染色質免疫沉淀測序(......閱讀全文

    Natureasia聚焦:CRISPR/Cas研究進展Top20

      CRISPR/Cas系統是目前發現存在于大多數細菌與所有的古菌中的一種后天免疫系統,其以消滅外來的質體或者噬菌體并在自身基因組中留下外來基因片段作為“記憶”。  CRISPR/Cas系統全名為常間回文重復序列叢集/常間回文重復序列叢集關聯蛋白系統(clustered regularly inte

    2位女科學家得諾貝爾化學獎,華裔科學家張鋒失之交臂

      北京時間10月7日下午5點45分,瑞典皇家科學院宣布將2020年諾貝爾化學獎授予法國生物化學家Emmanuelle Charpentier和美國生物化學家Jennifer Doudna,以表彰其在基因編輯方面做出的杰出貢獻。  CRISPR技術自問世以來,就一直被諾獎候選的光環所圍繞。為了CRI

    2017年5月CRISPR/Cas亮點盤點

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。  

    基因編輯進展梳理 Part I CRISPR系統拓展及機制研究篇

      基因編輯技術是指對目標基因進行編輯,實現對特定DNA片段的敲除、插入等。自CRISPR/Cas9基因編輯技術問世以來,取得了一系列重大突破,并相繼在2012、2013、2015和2017年被Science雜志評為十大科學進展之一。因此,CRISPR/Cas9以其操作簡便和成本低廉等優勢受到了眾多

    CRISPR:基因編輯技術的“攪局者”,將給生命科學帶來巨變

      3年前,美國加利福尼亞州舊金山市Gladstone研究所(Gladstone Institutes in San Francisco, California)的遺傳學家Bruce Conklin想到了一個能夠改變他們實驗室工作流程的新辦法。Conklin的研究方向是DNA變異與人類疾病的關系,但

    基因編輯進展梳理 Part I CRISPR系統拓展及機制研究篇

      基因編輯技術是指對目標基因進行編輯,實現對特定DNA片段的敲除、插入等。自CRISPR/Cas9基因編輯技術問世以來,取得了一系列重大突破,并相繼在2012、2013、2015和2017年被Science雜志評為十大科學進展之一。因此,CRISPR/Cas9以其操作簡便和成本低廉等優勢受到了眾多

    重磅回顧!2015年“魔剪”CRISPR技術重大突破 TOP30

      CRISPR作為基因編輯領域的明星技術儼然已經成了眾多突破研究的“得力助手”。從技術改良、疾病治療到作物改良,越來越多的科學研究離不開這項才進入科研領域短短幾年的技術。張鋒、胚胎編輯、George Church等熱詞讓CRISPR在2015年“屢次刷屏”。  筆者從去年開始關注CRISPR技術,

    年終盤點:2018年基因編輯盤點

      2018年11月,中國科學家賀建奎聲稱世界上首批經過基因編輯的嬰兒-一對雙胞胎女性嬰兒---出生。他利用一種強大的基因編輯工具CRISPR-Cas9對這對雙胞胎的一個基因進行修改,使得她們出生后就能夠天然地抵抗HIV感染。這也是世界首例免疫艾滋病基因編輯嬰兒。這條消息瞬間在國內外網站上迅速發酵,

    強強聯合:在CRISPR/Cas9相關研究中應用高通量測序技術

      摘要:   CRISPR/Cas9基因組編輯技術和新一代測序技術(也稱高通量測序技術),是當今對生命科學研究有重大影響的兩項技術。二者并非毫不相干。有效地將二者聯用,有時可以大大加速科研進程。兩者之間有什么樣的聯系呢?在哪些研究領域或方向上可以聯用呢?上海伯豪生物根據在這兩個領域的技術服務經驗

    與CRISPR/Cas系統相愛相殺的抗CRISPR蛋白研究最新進展 一

    CRISPR/Cas系統是目前發現存在于大多數細菌與所有的古菌中的一種免疫系統,被用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。在CRISPR/Cas系統中,CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列(clustered regularly interspaced short palindr

    盤點2014年度十大改變世界的革命性技術

      基因編輯更快更準更簡單  1973年,斯坦利?N?科恩(Stanley N. Cohen)和赫伯特?W?博耶(Herbert W. Boyer)找到了改變生物體基因組的方法,成功將蛙的DNA插入到細菌中。20世紀70年代末,博耶的基因泰克(Genetech)公司對大腸桿菌進行基因改造,使其帶有一

    CRISPR/Cas9應用近期重大進展

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。  

    Cell:重磅!揭示抗CRISPR蛋白阻斷CRISPR系統機制

      想象一下細菌和病毒一直處于軍備競賽之中。對很多細菌而言,一種抵抗病毒感染的防御線是一種復雜的RNA引導的“免疫系統”,即CRISPR-Cas。這個免疫系統的核心是一種識別病毒DNA和觸發它破壞的監視復合物。然而,病毒能夠反擊,利用抗CRISPR蛋白讓這種監視復合物不能夠發揮功能。但是,在此之前,

    Cell:首次發現針對III型CRISPR-Cas系統的蛋白抑制劑

      如果說CRISPR復合物聽起來很熟悉,那是因為它們是新一波基因組編輯技術的最前沿。CRISPR/Cas系統是目前發現存在于大多數細菌與所有的古菌中的一種免疫系統,被用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。  在CRISPR/Cas系統中,CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列(cl

    2020年CRISPR/Cas最新研究進展

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。圖片

    生物谷7月份結構生物學研究進展一覽

      1. Cell:中科院生物物理所王艷麗/章新政課題組從結構上揭示Cas13a切割RNA機制  doi:10.1016/j.cell.2017.06.050  CRISPR/Cas系統是目前發現存在于大多數細菌與所有的古菌中的一種免疫系統,被用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。在CR

    21人的CRISPR基因編輯臨床試驗20人死亡 大家怎么看?

      2018年11月26日,賀建奎團隊對外宣布,一對經過CRISPR基因編輯的嬰兒雙胞胎誕生。隨即引發輿論風暴,被各界輿論一致譴責,賀建奎本人也因此被調查。  今天,剛好是賀建奎“基因編輯嬰兒事件”一周年,筆者查閱文獻時,無意間看到一篇2018年6月份發表在頂級醫學期刊 Journal of Cli

    中國速度:基因編輯技術投入人體試驗,領先美國兩年多

      在杭州的一家醫院里,從3月份開始,吳式琇一直在嘗試用一種很有希望的新型基因編輯工具來治療癌癥患者。  這種名叫Crispr-Cas9的工具是由美國科學家設計的,從2012年媒體報道說這種工具可以用來編輯DNA之后就引發了全球關注。美國還不允許醫生將這種工具用于人體試驗,但對吳式琇和其他中國醫生來

    CRISPR/Cas9技術,熱度背后的冷思考

      俞曉峰博士現任賽業模式生物副總裁、高級科學家,負責基因修飾模式動物的研發與技術服務等工作。   俞博士在遺傳基因模式動物領域有超過20年研發與管理等方面的豐富經驗,在干細胞相關領域及哺乳動物細胞系基因改造研究也取得了巨大成就,其研究成果多次發表在Nature Immunology、Hum Mo

    基因編輯進展梳理 Part I CRISPR系統拓展及機制研究(二)

     兩篇研究揭示Cas4核酸酶對于CRIPSR免疫反應的重要性2018年3月27日的,Shiimori團隊在Cell Reports期刊上發文,證明了Cas4核酸酶是間隔序列前體臨近基序( PAMs )靶向選擇所必須的,有助于Cas1和Cas2選擇新的CRISPR間隔物,并賦予天然宿主S

    CRISPR/Cas9技術,熱度背后的冷思考

      近年來,CRISPR/Cas9基因編輯技術正在給整個科研界帶來革命性變化,該技術使用CRISPR系統將Cas9蛋白和向導RNA注入小鼠受精卵,就能輕松實現基因敲除,同時,注入Donor DNA則可實現基因敲入,甚至國際著名學術期刊Genome Biology有文章指出這項新技術將很快取代使用胚胎

    張鋒:如何在34歲躋身于世界頂尖生物學家?

      豉汁蒸鳳爪端上桌后,一個小女孩頑皮地用筷子噠噠地敲打著餐桌。一位穿著Polo衫和牛仔褲的男士,正在和自己的小女兒、妻子和母親享用著廣式點心。在波士頓唐人街這個喧鬧的餐廳,沒人會多瞄一眼這位男青年。  沒人能猜到,34歲的張鋒會是這一代人中公認的最具轉化能力的生物學家,在不久的將來可能會在兩個領域

    利用I型CRISPR/Cas系統對人細胞進行靶向轉錄調節

      在一項新的研究中,美國杜克大學生物醫學工程副教授Charles Gersbach、Gersbach實驗室博士后研究員Adrian Oliver及其團隊首次描述了他們如何成功地利用I型CRISPR系統開啟和關閉基因,并對人細胞中的表觀基因組進行編輯。他們希望這能夠極大地擴展生物醫學工程師可用的基于

    CRISPR/Cas9技術,熱度背后的冷思考

    近年來,CRISPR/Cas9基因編輯技術正在給整個科研界帶來革命性變化,該技術使用CRISPR系統將Cas9蛋白和向導RNA注入小鼠受精卵,就能輕松實現基因敲除,同時,注入Donor DNA則可實現基因敲入,甚至國際著名學術期刊Genome Biology有文章指出這項新技術將很快取代使用胚胎

    CRISPR/Cas9 技術,熱度背后的冷思考

    近年來,CRISPR/Cas9 基因編輯技術正在給整個科研界帶來革命性變化,該技術使用 CRISPR 系統將 Cas9 蛋白和向導 RNA 注入小鼠受精卵,就能輕松實現基因敲除,同時,注入 Donor DNA 則可實現基因敲入,甚至國際著名學術期刊 Genome Biology 有文章指出這

    George Church專訪:CRISPR是如何引領基因編輯革命的?

      George Church:哈佛醫學院著名遺傳學家  11月26日,Nature Communications雜志發表了遺傳學界的大牛George M. Church領導哈佛醫學院的團隊,在人iPS細胞中進行了CRISPR基因編輯。他們將全基因組測序和靶向深度測序結合起來,評估了Cas9編輯iP

    新發現!Cell:噬菌體抱團抑制細菌CRISPR免疫系統

       在2018年7月19日同時在線發表在Cell期刊上的兩篇論文中,來自兩個研究團隊的研究人員提供了當入侵含有CRISPR的細菌時,噬菌體彼此間進行合作的證據。他們發現為了壓制CRISPR的破壞,噬菌體通過聯合起來快速地感染細菌來加以適應,而且有時一個噬菌體還會為此作為引火噬菌體(primer p

    CRISPR/Cas9專利紛爭不斷,如何避免被殃及池魚

      CRISPR/Cas9知識產權的專利戰是一段頗具傳奇色彩的微妙故事。持續多年的CRISPR專利之爭主要是在博德研究所的張鋒團隊與加州大學伯克利分校的杜德納團隊之間展開,大多數人似乎認為CRISPR專利之爭是這兩個研究團隊的問題,事實上,這場專利糾紛比人們想象的更加復雜。  美國專利之爭  博德研

    除了希望之外,CRISPR如今正走向實驗室

      CRISPR是一種強大的DNA編輯技術。因這種強大的基因編輯技術具有巨大的潛力,它受到科學界和大眾傳媒的大量關注。2015年,它被《科學》期刊評選為當年的年度突破[1]。  CRISPR并不是第一個被設計來編輯DNA的分子工具,但是因為它解決了這個領域的一些長期存在的問題,它才聞名于世。首先,它

    Crispr技術:蹣跚起步 漸成新寵

      1月30日,《細胞》雜志網站報道,全球首對靶向基因編輯猴子已在中國出生,科學家采用的是最新基因編輯技術Crispr,可以對目標DNA進行插入、刪除或重寫,類似計算機編輯文字一樣讓科學家對物種的基因進行編輯,而且成功率一般可提高到30%,甚至50%。美國哈佛大學的George Church說,

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