摘要: CRISPR/Cas9基因組編輯技術和新一代測序技術(也稱高通量測序技術),是當今對生命科學研究有重大影響的兩項技術。二者并非毫不相干。有效地將二者聯用,有時可以大大加速科研進程。兩者之間有什么樣的聯系呢?在哪些研究領域或方向上可以聯用呢?上海伯豪生物根據在這兩個領域的技術服務經驗,對相關內容進行了系統地整理。 一.引言 在分子生物學的發展歷史中,人們曾經不止一次地從微生物的某些生命活動中得到啟示,發展出了對于DNA操作有重要意義的工具,如分子克隆用的限制性內切酶和PCR用的耐熱聚合酶。它們為分子生物學的發展帶來了革命性的影響。近兩三年來,另一種從細菌的獲得性免疫系統發展而來的革命性的基因操作工具CRISPR/Cas9受到廣泛關注,其應用和影響范圍仍在不斷擴大。CRISPR/Cas9系統的發現與DNA測序技術分不開,它的發展與推廣仍然得益于DNA測序技術。CRISPR/Cas9技術與近五、六......閱讀全文
四.CRISPR/Cas9技術與新一代測序技術的聯用 革命性技術總是發展迅速、應用廣泛的。作為另一項革命性的生命科學研究技術,DNA新一代測序技術在近五、六年得到快速發展和推廣。它已經用于生命科學相關領域的許多方面。同樣地,也可以用在CRISPR/Cas9相關的研究中。兩者之間的應用領域有
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。 一、大規模基因功能的篩選 盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展,但是解析復雜的基
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。 一、大規模基因功能的篩選 盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展,但是解析復雜的基因型-表型關系仍
單細胞測序被評為2013年年度技術 2014 年首刊,《Nature Methods》雜志將2013年度技術(Method of the Year 2013)授予了單細胞測序(single-cell sequencing)。同時,雜志還介紹了2014年值得關注的技術,包括
美國著名科普雜志《科學家》(The Scientist)是一份在生命科學方面被廣大讀者認可,并受業界尊敬的月刊雜志。該雜志一直致力于研究生命科學,為科研人員提供最新的研究動態,科研成果發布等多方面的報道。每年年底,該雜志都會頒發生命科學相關的十大創新產品獎項。 近日,《科學家》公布了其評選的2
3.楊輝/李亦學/Lars M. Steinmetz等團隊建立新型脫靶檢測技術,基因編輯工具安全性評估或迎來新突破 CRISPR/Cas9是廣泛關注的新一代基因編輯工具,自從2012年被發明以來,它一直以其高效性和特異性備受世人的期待,然而值得注意的是,CRISPR/Cas9從問世以來,其脫靶風險
基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。
基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。
哈佛大學David R Liu實驗室利用體外篩選和高通量測序檢測CRISPR/Cas9的脫靶,針對CLTA基因的四個不同靶位點共設計了八條不同序列的gRNA,即每個靶位點有兩條gRNA,結果發現,四個靶位點均存在脫靶現象,脫靶效率最高可達 84%,同時CRISPR/Cas9的特異性僅與g
自2013年Science雜志將CRISPR技術選為年度突破開始,這一新技術就給基因編輯世界帶來一場風暴:在過去的這一年半時間里,CRISPR方法已迅速席卷了整個動物王國,成為DNA突變和編輯的一種明星技術。 國內外各大生物實驗室的科學家們紛紛嘗試利用這種技術進行攻關,近期來自北京大學生命
摘要:CRISPR/Cas9基因組編輯技術和新一代測序技術(也稱高通量測序技術),是當今對生命科學研究有重大影響的兩項技術。二者并非毫不相干。有效地將二者聯用,有時可以大大加速科研進程。兩者之間有什么樣的聯系呢?在哪些研究領域或方向上可以聯用呢?上海伯豪生物根據在這兩個領域的技術服務經驗,對相關內容
環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),是繼microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非編碼RNA家族中極具研究潛力的新成員。越來越多的研究表明,環狀RNA具
基因編輯技術是指對目標基因進行編輯,實現對特定DNA片段的敲除、插入等。自CRISPR/Cas9基因編輯技術問世以來,取得了一系列重大突破,并相繼在2012、2013、2015和2017年被Science雜志評為十大科學進展之一。因此,CRISPR/Cas9以其操作簡便和成本低廉等優勢受到了眾多
基因編輯技術是指對目標基因進行編輯,實現對特定DNA片段的敲除、插入等。自CRISPR/Cas9基因編輯技術問世以來,取得了一系列重大突破,并相繼在2012、2013、2015和2017年被Science雜志評為十大科學進展之一。因此,CRISPR/Cas9以其操作簡便和成本低廉等優勢受到了眾多
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。一、大規模基因功能的篩選盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展,但是解析復雜的基因型-表型關系仍然是數量遺傳學的一個
在2013年,來自麻省總醫院的研究人員發現使用CRISPR-Cas RNA引導性核酸酶的一個重要局限:會在預期靶點以外的位點上生成多余的DNA突變。此后陸續有研究直接說明了CRISPR/Cas9存在嚴重的脫靶性,即該技術可以發生非特異性切割,引起基因組非靶向位點的突變,這樣會造成研究結果的不確定
基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。圖片
近年來,Pacific Biosciences、Oxford Nanopore Technologies、Bionano Genomics和10x Genomics等公司的長讀長測序和基因組圖譜技術越來越受歡迎。隨著相關技術的推廣應用,長讀長測序技術在快速、高效提取高質量高分子量DNA方面的痛點
經過特殊的算法,我們得到了2018年前10個月中國生物醫學風云榜人物及最火爆的3個重大學術界事件,能夠上榜的風云人物/事件,都曾長時間占據過100多個公生物醫學公眾號的頭版頭條。 在此,我們精選了其中的3個事件及16位風云榜人物。我們對其進行了劃分,分別是:6星級的3個事件,分別位諾貝爾獎,國
隨著大數據和全基因組測序的發展成熟和大量研究的廣泛開展,有時不免讓人覺得研究人員將他們的顯微鏡(microscope)更換為宏觀鏡(macroscope)。但是,《科學家》雜志舉辦的2018年十大創新競賽講述了一個不同的故事:單個細胞。在《科學家》雜志的獨立評審團評選出的2018年十大創新產品中,它
最近,CRISPR/Cas9系統也應用于靶基因的抑制(CRISPRi)或激活(CRISPRa)的遺傳修飾。這類修飾系統可用于研制相應致癌基因,和/或抑制TSGs基因的誘導和可逆激活小鼠模型。比如借助CRISPRa為基礎的系統,通過激活致癌基因的轉錄,達到研究其致癌潛力的目的。雖然CRISPR/Cas
“基因組編輯未來產業運用發展是如今的熱點,利用這個技術,不管做動植物轉化改造還是醫藥領域應用,可以做的事情非常多,但是具體怎么落地?我跟大家一樣,有的時候會覺得無從下手,所以今天我會更多從技術層面給大家做一個簡單的介紹。” △魏文勝 北京大學生命科學學院教授 以下是正文: 各位下午好!謝謝
BioTechniques雜志日前評出了2015年最受歡迎的十篇技術文章,涵蓋了對PCR、DNA提取、無細胞蛋白表達等常規技術的改良,以及CRISPR/Cas9、Hi-Plex、微圖案化等新技術的應用。 1. Visual detection of isothermal nucleic aci
CRISPR的火熱及其在臨床上應用的美好愿景,令這一技術相關的公司不斷涌現,除了張鋒等人創辦的Editas Medicine,Emmanuelle Charpentier等人的ERS Genomics,另外一位CRISPR先驅Jennifer Doudna也創辦了自家公司:Caribou Bio
基因修飾動物是研究在發育和疾病中基因功能的重要工具。CRISPR/Cas9系統有效的應用于構建基因敲除和敲入小鼠。而楊輝團隊正好專注于該領域。 楊輝,30歲時,就成為中科院上海生科院神經所研究員;2015年,入選國家“青年千人計劃”;2019年,楊輝博士獲得國家杰出青年基金資助。 由楊輝創辦
自發現以來,基于CRISPR的基因編輯系統已經從根本上改變了研究者們操縱基因組的能力。近日,Cell雜志推出CRISPR特輯——Gene Editing in Stem Cells,用2個SnapShots、2篇綜述以及7篇論文,回顧了近階段基因編輯技術與干細胞之間“擦出的火花”。 Cell
在4月21日的《自然實驗手冊》(Nature Protocols)雜志上,清華大學的朱聽(Ting Zhu)研究員與博士生姜文君(Wenjun Jiang)撰文,詳細介紹了利用一種叫做Cas9輔助靶向染色體片段(CATCH)的方法,靶向分離及克隆100kb微生物基因組序列的優化實驗方案。 朱聽
新的基因組編輯工具——如ZFNs、TALENs以及最近的CRISPR/Cas9系統,已經大大提高了在不同動物模型中敲除基因的能力,包括斑馬魚。然而,對數量龐大的動物進行篩選,所需的時間和成本,仍然是一個瓶頸。 最近,意大利多恩動物研究所(Stazione zoologica Anton Doh
Leptin(LEP)是由脂肪細胞分泌的蛋白質類激素,主要由白色脂肪組織產生。其前體由167個氨基酸殘基組成,N末端有21個氨基酸殘基信號 肽,該前體的信號肽在血液中被切掉而成為146氨基酸,分子量為16KD,形成Leptin。Leptin具有廣泛的生物學效應,其中較重要的是作用于下 丘腦的代謝
兩篇研究揭示Cas4核酸酶對于CRIPSR免疫反應的重要性2018年3月27日的,Shiimori團隊在Cell Reports期刊上發文,證明了Cas4核酸酶是間隔序列前體臨近基序( PAMs )靶向選擇所必須的,有助于Cas1和Cas2選擇新的CRISPR間隔物,并賦予天然宿主S