NatureMethods|朝思暮想：單細胞蛋白質組測序之夢
近期，Nature Methods 雜志技術編輯Vivien Marx發表文章 A dream of single-cell proteomics，探討了單細胞蛋白組學的發展，提出了該技術有可能會面對的問題和潛在解決方案。單細胞蛋白質組測序的夢想并不遙遠（Credit: S. Larochelle, E. Dewalt, Springer Nature） 現在，很多實驗室每年都在產生大量的單細胞基因組以及轉錄組的數據。但是在蛋白質組學研究中，高通量的方法尚未實現。蛋白質的研究工作比RNA或者DNA的研究要更難，比如說因為蛋白質比較黏、不可擴增并且容易降解等，但是科學家的前赴后繼可能可以將單細胞mRNA與單細胞蛋白質組測量相整合。 20年前，Richard Smith和他的同事們首次對紅細胞中的血紅蛋白進行了表征【1】，雖然紅細胞是個特例，因為其中主要組成成分就是血紅蛋白，但這的確是單細胞分析。最近關于蛋白質組的研究方法，......閱讀全文
Nature－Methods－|－朝思暮想：單細胞蛋白質組測序之夢
近期，Nature Methods 雜志技術編輯Vivien Marx發表文章 A dream of single-cell proteomics，探討了單細胞蛋白組學的發展，提出了該技術有可能會面對的問題和潛在解決方案。單細胞蛋白質組測序的夢想并不遙遠（Credit: S. Larochell
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
當宏基因組遇上單細胞測序
日前，科學家們通過宏基因組測序和單細胞測序鑒定了一類新細菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成為了微生物檢測和分類鑒定的強有力工具。這種方法為科學家們揭示了微生物群體的高度復雜性，但它還是有所遺漏。美國能源部聯合基因組研究所上周的一次會議上，研究者人員向人們展示了在四個溫泉樣本
對瘧原蟲的單細胞基因組測序
美國圣安東尼奧，2014年5月8日——美國德克薩斯生物醫學研究所的科研人員和他們的同事開發出了一種分離單個瘧原蟲細胞然后對其基因組測序的新方法。這一進展將讓科學家能夠改進他們識別病人感染的多種類型的瘧原蟲的能力，而且還可帶來最佳的經設計的藥物何疫苗以應對這種主要的全球性殺手。瘧疾仍然是全世界最致
高通量單細胞轉錄組測序發展與展望
單細胞轉錄組測序技術這幾年的發展之快，運用之廣已眾所周知。為更好的在國內推廣該技術，也為更好的將該技術運用到廣大科研工作者的實際工作中，上海生物芯片有限公司生物信息團隊通過對該技術的整理和歸納，在《生命科學》雜志上發表了名為“高通量單細胞轉錄組測序發展與展望”綜述文章，希望能進一步提升科研工作者對該
當代謝組學技術遇到單細胞測序技術
代謝組的狀態是對遺傳因素、外部環境和治療干預等信息的綜合反映，因此是一個跟蹤和了解上述因素對表型影響的理想研究目標。代謝組可做多種樣品類型、結果富含各種信息、可作為連接其他組學數據與表型之間的橋梁。過去20年，組學研究飛速發展，處于中心法則末端的代謝組學雖然起步較晚但是發展很快。很多組學研究目前已進
空間轉錄組和單細胞轉錄組測序聯合應用的典型案例
單細胞轉錄組測序技術的如火如荼，伴隨著空間轉錄組測序技術的蓬勃發展，可以看到，在現有的高通量檢測技術領域，這兩種技術已為科學研究的發展提供了前所未有的技術支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術進展，到2020年空間轉錄組技術也被評為年度技術進展，相信在接
單細胞測序推進了基因組的發展領域
單細胞測序能夠幫助我們了解那些難以培養的微生物的基因組功能、了解遺傳鑲嵌功能在普通生物學功能或是疾病發生中的作用、腫瘤內在異質性對腫瘤發展以及耐藥性的影響、重新定義細胞亞型等等。 單細胞測序可以揭示出每個細胞獨特的微妙變化，甚至可以揭示全新的細胞類型，測序技術可謂是科技發展的一大創舉，它推進了基因
單細胞轉錄組測序研究熱點和發文錦囊
從Top50期刊2000余篇文獻統計： 在剛剛發布的“十四五”規劃中，“基因與生物技術”作為前沿科技攻關領域之一。而在這個領域，近年來最具里程碑的技術突破必然不能忽略“單細胞轉錄組測序”。本文通過對PubMed數據庫中Top50期刊的共計2357篇單細胞轉錄組測序的引文進行數據分析，幫助讀者了
單細胞測序新技術：同時分析轉錄組和甲基化組
單細胞轉錄組和甲基化組分析已經成為了單細胞研究的強大工具。然而，在單細胞中揭示DNA甲基化與基因表達的直接關聯還比較困難。這是因為細胞之間存在較大的差異，又不能同時檢測一個細胞的轉錄組和甲基化組。加州大學范國平教授和同濟大學薛志剛教授領導團隊解決了這個問題。他們在Genome Biology雜志上發
謝曉亮：單細胞全基因組測序曙光初現
?謝曉亮 12月21日出版的美國《科學》雜志發表了題為《單細胞全基因組測序探索精子重組規律和遺傳缺陷》的論文。同時，該期《科學》雜志也將單細胞全基因測序列為2013年六大值得關注的科學領域之一。 該論文由美國科學院院士、哈佛大學教授謝曉亮課題組與北京大學生物動態光學成像中心（
單細胞轉錄組測序構建胸腺器官發生的分子圖譜
2019年10月8日，四川大學胡洪波研究組、解放軍總醫院第五醫學中心劉兵研究組與暨南大學基礎醫學院蘭雨研究組合作在Immunity雜志在線發表了題為“Single-cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thy
單細胞基因組測序：從實驗到分析，步步解析
隨著生命科學研究的微觀化，基于細胞群體的研究方法已不適用于某些研究領域（如腫瘤異質性、早期胚胎發育等）。單細胞基因組測序通過在單個細胞水平上進行測序，解決了用組織樣本無法獲得不同細胞間的異質性信息或樣本量太少無法進行常規測序的難題，為科學家研究單個細胞的行為、機制等提供了新的方向。【應用概覽】從20
人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果
人腦是由多種不同類別細胞組成的極其復雜的器官。傳統的細胞分類方法只能根據少數已知的細胞的標記分子（marker）對細胞進行分類，對每一類細胞的認識也非常有限。斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其團隊利用單細胞測序技術，對466個人大腦皮層的單細胞進行了轉錄組測序，通過數據分析發
單細胞測序需要準備什么再去測序
DNA測序的測序原理： DNA測序是指分析特定DNA片段的堿基序列，也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）與鳥嘌呤的（G）排列方式。快速的DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。
Nature：單細胞測序（下）
隨著技術的飛速發展，成本大大降低，使得基因組測序成為常規技術。然而，大多數的人類基因組、癌癥或其他仍然是通過從多個細胞中抽提DNA來進行測序，它所忽略的細胞間的差異對于控制基因表達、細胞行為和藥物反應卻有可能是至關重要的。 該研究小組也觀測了其他類型的乳腺癌。將腫瘤作為一個整體測序，研究小
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
Nature：單細胞測序（上）
Nicholas Navin所需要的就只是一個細胞――問題是如何得到它。這是在2010年，冷泉港實驗室的博士后研究員正在探究驅動乳腺癌的遺傳改變。此前的大部分癌癥基因組研究都是碾碎少量的腫瘤組織，一并將這些DNA進行測序，生成的是一張癌癥基因組的一致圖像。但Navin想要解析來自單個細胞的序
單細胞測序方法匯總
單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題，而且-前沿的領域就是單細胞RNA測序了（scRNA-seq）。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序，并給出平均差異，但并沒有兩個細胞是完全一樣的，而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變，甚至這種技術還能夠闡明完整
科學家開發單細胞全轉錄組測序新技術
北京大學生物動態光學成像中心黃巖誼、湯富酬課題組在《美國科學院院刊》（PNAS）上發表題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的論文。該研究利用微流控芯片技術實現了高質量單細胞的全轉錄組測序樣品準備，全面提高了單細胞全
新型微流控芯片可提高單細胞轉錄組測序效率
近日，中國科學院深圳先進技術研究院醫工所微納系統與仿生醫學研究中心研究員陳艷和南加州大學教授鐘江帆合作，在針對稀有細胞樣本的單細胞測序技術方面取得新進展。相關研究成果以Improving single-cell tranome sequencing efficiency with a microfl
單細胞基因組測序測的是什么dna還是rna
深度測序的read指的是高通量中雙端測序得到的一條條序列，如測序前將dna打成小的片段，測序是從這個片段的兩端測的，即會產生兩條reads。至于是mapping到基因組還是dna基因組，這要看你做什么了，一般基因組是指生物個體的全基因組。并不是所有測序都要rna反轉，這其實要看你想做什么分析，如做轉
單細胞基因組測序測的是什么dna還是rna
深度測序的read指的是高通量中雙端測序得到的一條條序列，如測序前將dna打成小的片段，測序是從這個片段的兩端測的，即會產生兩條reads。至于是mapping到基因組還是dna基因組，這要看你做什么了，一般基因組是指生物個體的全基因組。并不是所有測序都要rna反轉，這其實要看你想做什么分析，如做轉
單細胞基因組測序測的是什么dna還是rna
深度測序的read指的是高通量中雙端測序得到的一條條序列，如測序前將dna打成小的片段，測序是從這個片段的兩端測的，即會產生兩條reads。至于是mapping到基因組還是dna基因組，這要看你做什么了，一般基因組是指生物個體的全基因組。并不是所有測序都要rna反轉，這其實要看你想做什么分析，如做轉