深度測序的read指的是高通量中雙端測序得到的一條條序列,如測序前將dna打成小的片段,測序是從這個片段的兩端測的,即會產生兩條reads。至于是mapping到基因組還是dna基因組,這要看你做什么了,一般基因組是指生物個體的全基因組。并不是所有測序都要rna反轉,這其實要看你想做什么分析,如做轉錄組、表達譜分析就只需rna樣品,而做全基因組重測序當然就要dna了。......閱讀全文
深度測序的read指的是高通量中雙端測序得到的一條條序列,如測序前將dna打成小的片段,測序是從這個片段的兩端測的,即會產生兩條reads。至于是mapping到基因組還是dna基因組,這要看你做什么了,一般基因組是指生物個體的全基因組。并不是所有測序都要rna反轉,這其實要看你想做什么分析,如做轉
深度測序的read指的是高通量中雙端測序得到的一條條序列,如測序前將dna打成小的片段,測序是從這個片段的兩端測的,即會產生兩條reads。至于是mapping到基因組還是dna基因組,這要看你做什么了,一般基因組是指生物個體的全基因組。并不是所有測序都要rna反轉,這其實要看你想做什么分析,如做轉
最近,卡羅林斯卡學院的研究人員開發出了一種單細胞程序,測量了單個胚胎干細胞中短的非編碼RNA序列的絕對數量。這種新方法可以加深我們對于“基因是如何被調節、不同的細胞類型如何發展”的理解。相關研究結果發表在10月31日的《Nature Biotechnology》。當我們基因中的信息被使用時――例如構
最近在《Nature Immunology》發表的一項新研究,詳細檢測了一組新發現的免疫細胞(被稱為ILC)。通過對單個扁桃體細胞的基因表達進行分析,瑞典卡羅林斯卡學院的科學家們,發現了三個以前未知的ILC子群,并揭示了關于“這些細胞在人體中如何發揮功能”的更多信息。 先天淋巴細胞(ILC)是
隨著現代生物學的發展,細胞群體的研究已不再能滿足科研需求。單細胞測序通過對單個細胞進行測序,解決了用組織樣本測序或樣本少時無法解決的細胞異質性難題,為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向。 2011 年,《自然方法》雜志( Nature Methods )將單細胞測序列為年
美國圣安東尼奧,2014年5月8日——美國德克薩斯生物醫學研究所的科研人員和他們的同事開發出了一種分離單個瘧原蟲細胞然后對其基因組測序的新方法。這一進展將讓科學家能夠改進他們識別病人感染的多種類型的瘧原蟲的能力,而且還可帶來最佳的經設計的藥物何疫苗以應對這種主要的全球性殺手。瘧疾仍然是全世界最
隨著科研人員對各種遺傳疾病和癌癥的深入挖掘,單細胞基因組方法捕獲的信息變得越來越重要。卡羅林斯卡學院( Karolinska Institute)的研究人員近日公布了一種新方法,這種方法可以讀取個體胚胎干細胞中短的、非編碼RNA序列,有助于人們更好地理解基因如何調控不同細胞類型的發展。相關結
如今,單細胞生物學是一個熱門話題。而在這一領域中,最前沿的則是單細胞RNA測序(scRNA-seq)。傳統“批量的”RNA測序方法(RNA-seq)可以一次處理成千上萬個細胞,并得到變異的平均水平。但是沒有兩個細胞是完全相同的,而scRNA-seq則可以揭示出每個細胞獨特的微妙變化,甚至可以揭示全新
日前,科學家們通過宏基因組測序和單細胞測序鑒定了一類新細菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性,使其成為了微生物檢測和分類鑒定的強有力工具。這種方法為科學家們揭示了微生物群體的高度復雜性,但它還是有所遺漏。美國能源部聯合基因組研究所上周的一次會議上,研究者人員向人們展示了在四個溫泉樣本
多細胞測序和單細胞測序,你pick誰?如今,大多數研究人員也許會選擇后者,因為不一樣的角度,會帶來不一樣的見解。 多細胞測序和單細胞測序,你pick誰?如今,大多數研究人員也許會選擇后者,因為不一樣的角度,會帶來不一樣的見解。單細胞測序的最初動力來自癌癥研究,可幫助人們了解腫瘤異質性和腫瘤微環