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近年來，新一代測序(NGS)平臺在甲基化研究中開始嶄露頭角。它們帶來了非常靈敏的DNA甲基化圖譜，以單分子分辨率覆蓋整個CpG島。然而，對于時下熱門的5-hmC研究，似乎還缺乏專門的樣品制備工具。為此，Zymo Research公司近日推出兩款新的NGS文庫制備試劑盒，適用于全基因組范圍的5-hmC和5-mC分析。 5-羥甲基胞嘧啶(5-hmC)是這幾年備受關注的一種表觀遺傳學修飾，可能參與了DNA去甲基化或基因表達調控。對于全基因組范圍的甲基化分析，亞硫酸氫鹽測序是一種常用方法，但無法區分5-mC和5-hmC。 Zymo Research此次為5-hmC研究帶來了RRHP? 5-hmC文庫制備試劑盒(RRHP? 5-hmC Library Prep Kit)，利用對不同甲基化狀態敏感的MspI來制備測序文庫。它的操作流程如下：首先用MspI消化基因組DNA，然后連接接頭，并用 β-葡萄糖基轉移酶在5......閱讀全文
第二代測序技術， 又稱新一代測序技術， 是相應于以Sanger 測序法為代表的第一代測序技術而得名。第二代測序中3種主流測序技術分別為依次出現的 Roche/454 焦磷酸測序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成測序(2006 年)和 ABI/SOLiD 連接酶測序(
第二代測序是當今應用最為廣泛的技術，但讀長短是它的軟肋，并且它無法解決高度雜合的基因組、高度重復序列、高GC區域、拷貝數變異、大的結構變異等問題。第三代測序技術避免了第二代測序讀長短的缺點，近年來漸漸被應用于各大研究中。以前談到第三代測序，也許你想到的是病毒基因組或細菌基因組測序，而如今隨著技
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
摘要：農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１７年度主要農作物基因組
隨著人類基因組計劃（human genome project ）在2003年順利完成，基因組測序技術取得了長足的進步，這直接導致了每兆基因組成本的大幅下降以及檢測的基因組數量越來越多。人們對基因組的復雜性深感震驚，這也引導著測序技術的進一步發展。最近的一些突破性技術使得測序技術在更短的時間內可以
隨著人類基因組計劃（human genome project ）在2003年順利完成，基因組測序技術取得了長足的進步，這直接導致了每兆基因組成本的大幅下降以及檢測的基因組數量越來越多。人們對基因組的復雜性深感震驚，這也引導著測序技術的進一步發展。最近的一些突破性技術使得測序技術在更短的時間內可以
DNA甲基化是近年來研究的熱點，因為越來越多的證據表明，它參與了胚胎發育、基因印跡等過程。同時，它在疾病發展中也起著舉足輕重的作用。甲基化狀態的改變被認為是引起癌癥的一個重要因素，這種變化包括基因組整體甲基化水平的降低和CpG島局部甲基化水平的異常升高，從而導致基因組的不穩定(如染色體的不穩定、
環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子，不同于對其豐富的表達譜研究，環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制，部分circRNA可競爭性結合miRNA，解除miRNA對靶基因的抑制作用，上調靶基因的表達。其實，環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白，分別在轉
2014年全球下一代測序（NGS）市場規模為20億美元，預計2022年市場值達300億美元。全基因組測序技術發展最快，逐漸霸占NGS市場。腫瘤研究和產前檢測位居NGS應用市場的前二甲。行情分析：預計2022年市場值達300億美元。根據Grand View Research 2015年9月的報道，20
Genome Sequencer FLX (GS FLX)系統是羅氏454 公司的第二代測序臺，GS FLX的命名正是來源于其在多領域的靈活(flexible)應用。隨著該系統性能和應用領域的不斷提升和擴展，必將帶動整個測序領域的技術發展，
2009年，基因組定向捕獲工具的出現，讓外顯子組的捕獲成為可能。科學家們普遍認為外顯子組測序比全基因組測序更有優勢，特別是對罕見的單基因疾病。不僅僅是費用更低，數據的闡釋也更為簡單。因此，外顯子組測序也在2010年被《Science》雜志評為年度十大突破。 數百篇已發表的文章，也證實了外顯
臨床類 杜克大學分子遺傳學教授David Goldstein David Goldstein提出運用精準醫學治療神經系統疾病。Goldstein專注于幾個癲癇患者大規模研究的課題，其中包括一項對超過350個患病的兒童及其父母進行測序來發現新突變的項目。盡管許多發現的突變屬罕見突變，但是它
DNA甲基化修飾是表觀遺傳研究的熱點之一，我們通常認為DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化（5-methylcytosine, 5mC），卻不知道隨著測序技術的快速發展，科研者們已經在真核生物中（果蠅 、真菌、萊茵衣藻、秀麗隱桿線蟲等）發現了一種新的DNA甲基化修飾—DNA-6mA甲基化，且DNA-6m
本文中小編整理了多篇文章，來解讀測序技術在闡明癌癥發生機制、癌癥診斷及療法開發等方面的巨大潛力，與各位一起學習！ 【1】JAMIA：新工具深入挖掘外顯子測序結果 幫助找到最佳癌癥治療藥物 doi：10.1093/jamia/ocw022 科羅拉多大學的研究人員最近在國際學術期刊JAMIA上
近年來涌現出不少DNA甲基化的檢測技術，少說也有十幾種。大致可以分為兩類：特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析，后者也稱為甲基化圖譜分析(methylation profiling)。下面大家介紹一些常用的方法。一、特異位點的甲基化檢測1. 甲基化特異性PCR(MS-PCR)這種方法經濟實用，
文章導讀 m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾，能夠在多種生物過程中發揮重要作用，包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。 2020年1月17日，美國芝加哥大學何川，中科院
在DNA測序過去的40年中，我們見證了諸多技術的變革和測序規模的極度增長。從幾千個堿基到第一個人體基因組，乃至當前數以萬計的人體和無數其它的基因組。包括作為大量分子現象的“計數器”在內，DNA測序被廣泛和創造性地應用于各個領域。從長遠來看，我們可以預測DNA測序技術所帶來的影響將會與顯微鏡的使用
m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾，能夠在多種生物過程中發揮重要作用，包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。 2020年1月17日，美國芝加哥大學何川，中科院北京基因組研究所
近年來涌現出不少 DNA 甲基化的檢測技術，少說也有十幾種。大致可以分為兩類：特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析，后者也稱為甲基化圖譜分析 (methylation profiling)。下面大家介紹一些常用的方法。 特異位點的甲基化檢測 甲基化特異性 PCR (MS-PCR)
在過去的2016年，第三代測序獲得了完美突破，首次登上了太空，首次完成人類基因組測序，首次確定了二代測序未能檢測到的致病性大片段缺失突變，最終確診了一種罕見遺傳病......第三代測序也被Science納入2016年十大科學突破之一。 第三代測序技術避免了第二代測序讀長短的缺點，在臨床上具有無
北京大學北京未來基因診斷高精尖創新中心，北大生命科學學院與第三醫院等處的研究人員發表了題為“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章，利用單細胞DNA甲基化組高通量測序方法，首次在單細胞分辨
北京時間2018年3月31日晚間，北京希望組生物科技有限公司（以下簡稱“希望組”）在南京舉行的第五屆NGS創新開發者大會，與北京基云惠康科技有限公司（以下簡稱“基云惠康”）共同宣布啟動“個人參考基因組服務計劃（Personal Reference Genome Service Project）”
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
【摘要】 2005年454公司首推劃時代的新一代測序儀，從而引發了測序市場上454、Illumina、ABI等公司在新一代測序技術上的比拼高潮。也正是這種你追我趕，讓繪制人類全基因組圖譜由過去的耗費4.37億美元和13年時間，驟然縮短到如今SOLiD 3運行一次即獲得50GB可定位測序數據。新一代
上海交通大學附屬第一人民醫院張箴波團隊以題為“Metformin sensitizes endometrial cancer cells to chemotherapy through IDH1-induced Nrf2 expression via an epigenetic mechanis
資料來源： IQ4I Research & Consultancy 測序技術的發展已經經歷了很長的時間，而下一代測序（NGS）徹底改變了人類基因組測序的方式。據專家預測，未來的幾年內，人類基因組測序的費用將在1000美元，1-2天即可出結果。自實現第一個人類基因組測序以來（花了十年時間，3
測序技術的發展已經經歷了很長的時間，而下一代測序（NGS）徹底改變了人類基因組測序的方式。據專家預測，未來的幾年內，人類基因組測序的費用將在1000美元，1-2天即可出結果。自實現第一個人類基因組測序以來（花了十年時間，30億美元），測序所需的費用和時間大幅度降低。NGS的發展為臨床診斷打開了新
一、聽說最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？ 1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點，RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一，亮點文章頻出，著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的，就有高達 17 篇。