NatureGenetics揭示eccDNA功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤內的異質性，是腫瘤進化的動力。那么除此外，eccDNA是否還有其他生物學功能呢？相信各位老師跟小編一樣迫切想要了解eccDNA研究的新方向，而云序生物一直關注eccDNA的研究動態，今天帶來的文章剛好揭示了eccDNA新功能--驅動神經母細胞瘤基因組重排，為現代癌癥基因組學提供了令人興奮的新方向。下面請跟著編者一起走進eccDNA的新世界，了解這個神奇的分子在癌癥治療方面劃時代的功能。 2019年12月16日，eccDNA驅動致癌基因重構一文發表在Nature Genetics（IF=25.455）期刊上，該文章結合eccDNA......閱讀全文
Nature－Genetics－揭示eccDNA功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
Nature－Genetics揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重..
1.?神經母細胞瘤eccDNA整體統計研究人員聯合eccDNA-seq和RNA-seq（云序生物提供此服務）技術，與開創性的生物信息學算法相結合，首次在神經母細胞瘤（一種主要發生在兒童的致命腫瘤）中進行詳細的環狀DNA序列分析。本研究中分析了93名兒童的神經母細胞瘤組織樣本，結果顯示，每個組織樣本平
揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
eccDNA新型生物標志物的多種應用
文章導讀 新年伊始，eccDNA（染色體外環狀DNA）的相關研究成果不斷。2019年11月同期Nature、Cell報道了環狀DNA通過高度開放染色質、復雜的拓樸異構特征增強表達的顛覆性發現，2019年12月Nature Genetics也剛剛揭示了eccDNA能夠驅動神經母細胞瘤基因重排
國自然研究熱點——eccDNA的前世今生（三）
小編在這兒也給大家整理了eccDNA表達譜的研究思路，如下圖。?（2）生物標志物eccDNA優于線性DNA的生物穩定性以及獨特的分子結構特征，為迅速發展的無創活檢道路增添了新的方向，如果有較多的臨床樣本，它非常適合做生物標志物的研究。下面這篇文章是eccDNA在液體活檢方面探索的先驅文章，小編帶大家
研究發現染色體外環狀DNA驅動神經母細胞瘤癌基因重構
近日，紀念斯隆?凱特林癌癥中心等科研機構的研究人員在Nature Genetics上發表了題為“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章，發現染色體外環狀DNA驅動神
國自然研究熱點—eccDNA的前世今生
2019年11月，頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，徹底顛覆了人們對癌基因的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生物醫學界，一時之間，將人們的目光都吸引到這個科研界的新寵
再登Nature－GeneticsecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良...1
再登Nature Genetics-ecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良預后相關文章導讀研究發現，許多擴增的原ai基因，并不只是位于染色體，而且還能變成游離的染色體外DNA（ecDNA），并出現大量拷貝，而且相當高比例的ecDNA是以環狀DNA分子的形式存在，即eccDNA（染色體外環狀DNA
國自然研究熱點—eccDNA的前世今生
?1. eccDNA為什么火？它到底是何方神圣？ 2019年11月，頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，徹底顛覆了人們對癌基因的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生
eccDNA新型生物標志物的多種應用
新年伊始，eccDNA（染色體外環狀DNA）的相關研究成果不斷。2019年11月同期Nature、Cell報道了環狀DNA通過高度開放染色質、復雜的拓樸異構特征增強表達的顛覆性發現，2019年12月Nature Genetics也剛剛揭示了eccDNA能夠驅動神經母細胞瘤基因重排的全新功能。這一
eccDNA新型生物標志物的多種應用
新年伊始，eccDNA（染色體外環狀DNA）的相關研究成果不斷。2019年11月同期Nature、Cell報道了環狀DNA通過高度開放染色質、復雜的拓樸異構特征增強表達的顛覆性發現，2019年12月Nature Genetics也剛剛揭示了eccDNA能夠驅動神經母細胞瘤基因重排的全新功能。這一
癌基因的關鍵——染色體外環狀DNA（eccDNA）
實驗方法：環狀DNA-seq,?RNA-seq（云序生物提供以上服務）1.?ecDNA是環狀結構為了了解ecDNA的結構，作者通過環狀DNA-seq（云序生物提供以上服務）方法研究了三種人類癌細胞系和來自于TCGA的臨床腫瘤樣品。通過這種方法檢測到了GBM39細胞中的圓形擴增子游離于染色體之外，并且
Nature－Communications：發現神經母細胞瘤癌基因
神經母細胞瘤占兒童癌癥死亡總數的15%。高危神經母細胞瘤患者的生存率為50%。 澳大利亞兒童癌癥研究所的研究人員首次發現，一種名為JMJD6的基因在最具侵襲性的癌癥中扮演著重要角色。這項研究于近日發表于Nature Communications。這一發現為治療神經母細胞瘤開辟了一條新途徑。圖片
Nature子刊：基因組測序揭示腦瘤驅動基因
通過大規模基因組測序，來自Dana-Farber癌癥研究所和Broad研究所的科學家們揭示了兩個DNA突變，其似乎驅動了15%的腦膜瘤。這一研究發現有可能促成針對這類腫瘤的第一個有效藥物治療。 腦膜瘤是一種形成于腦膜及腦膜間隙，生長緩慢的腫瘤，通常為良性。但當腦膜瘤長到極大時，可導致癲癇發
再登Nature－GeneticsecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良...2
3.與線性DNA相比，ecDNA擴增導致的ai基因轉錄水平更高環狀ecDNA擴增的轉錄結果發現，在所有擴增子類別中觀察到DNA CN和ai基因表達水平高度明顯相關(圖3a)。然而，DNA CN歸一化后，環狀擴增子上的ai基因表達明顯高于非環狀擴增子。轉錄活性中不依賴于CN的增加現象可能部分是因為
神經母細胞瘤的簡介
不同神經母細胞瘤患者預后差別很大，也即神經母細胞 瘤間存在廣泛的腫瘤異質性。根據高危因素的不同，神經母細胞瘤可以分為低危組、中危組和高危組。對于低危組神經母細胞瘤患者（最常見于嬰幼兒），靠單純的觀察或者是手術治療往往可以取得很好的效果；但是高危組神經母細胞瘤患者，即使綜合各種強化的治療方案，預
什么是神經母細胞瘤
神經母細胞瘤是一種兒童常見的實質性腫瘤。主要起源于腎上腺，但也可起源于腎上腺外的交感神經的其他部分，包括腹膜后或胸部。 約%的神經母細胞瘤患者在歲以下某些患者有家族傾向性大約%的腫瘤起源于腹部%~%起源于胸部其余%起源于不同的部位例如頸部骨盆等原發于中樞神經系統的神經母細胞瘤極少見許多神經母細胞瘤
嗅覺神經母細胞瘤治療
由于嗅覺神經母細胞瘤這種疾病的罕見性，觀察性研究通常只有有限的患者數量。此外，疾病的自然病史需要長時間觀察才能充分評估治療效果。目前，關于嗅神經母細胞瘤的遺傳和分子改變的信息不足以指導治療決策。原發腫瘤手術治療、放射治療（RT）或化療都已用于治療原發性嗅神經母細胞瘤。觀察性研究通常表明，與手術或單獨
NatureGenetics揭示兒童癌癥致病基因
來自約翰霍普金斯大學Kimmel癌癥中心和費城兒童醫院(CHOP)的科學家們在對74個兒童神經母細胞瘤進行全基因組測序后，發現ARID1A和ARID1B兩個基因發生改變的患兒相比無此基因改變的患兒生存期縮短了四分之三。這一發現有可能最終導致早期確認患有侵襲性神經母細胞瘤的兒童，他們或許需要接受其
《Nature－Genetics》：癌癥的基因組結構研究
癌癥的基因組結構研究發表《Nature Genetics》 B細胞通過一系列精心控制的染色體重排和“良好”突變產生抗體，這些突變使細胞能夠產生大量不同的抗體。“盡管變化對產生大量多樣的抗體至關重要，但仍有可能發生‘壞’突變并導致B細胞源性癌癥，”研究負責人、哥倫比亞大學內科醫師和外科醫生學院微
Nature－Genetics：多種技術解析草莓基因組
近日，美國密歇根州立大學和加州大學戴維斯分校的研究人員組裝出近乎完整的栽培草莓基因組，并揭示了這種復雜的異源多倍體的起源和進化過程。 一轉眼又到了草莓上市的季節。這種小巧可愛的果實有著酸甜可口的味道，可搭配出各種各樣的美妙滋味。不過，對于草莓的基因組，你又了解多少？ 世界各地廣泛種植的鳳梨草
Nature－Genetics：揭示腸癌早期轉移最新證據
根據傳統的癌癥分期方法，癌癥可以籠統地被分為早期、中期和晚期。這個分類方法不僅很好地概括了癌癥的特點，還通俗易懂地向大眾傳遞了癌癥的嚴重程度。然而近日發表于Nature Genetics的研究對上述分類提出質疑。 來自美國斯坦福大學醫學院的醫學和遺傳學助理教授Christina Curtis聯
國自然研究熱點——eccDNA的前世今生（二）
(3)?形成特征早期的研究發現eccDNA是基因擴增的產物，是基因組不穩定性的一種表現形式。腫瘤基因擴增往往以兩種方式，一種是在染色體上進行基因的擴增，另一種則是形成eccDNA。目前關于腫瘤中eccDNA的形成機制還沒有定論。早期的研究認為短重復序列是介導eccDNA形成的因素，主要通過基因重組機
神經母細胞瘤的臨床癥狀
神經母細胞瘤的初發癥狀不典型，因此在早期診斷有 所困難。比較常見的癥狀包括疲乏，食欲減退，發燒以及關節疼痛。腫瘤所導致的癥狀取決于腫瘤所處的器官以及是否發生轉移。 腹腔的神經母細胞瘤一般表現為腹部膨隆以及便秘；胸腔神經母細胞瘤一般表現為呼吸困難；脊髓神經母細胞瘤一般表現為軀干與肢體力量減退，
關于神經母細胞瘤的診斷
最終的診斷依賴于術后的病理，但同時也要綜合考慮患者的臨床表現以及其他的輔助檢查結果。 生化檢查 將近90%的神經母細胞瘤患者，其血液或尿液里兒茶酚胺及其代謝產物（多巴胺，高香草酸、香草扁桃酸）的濃度較正常人群有顯著升高。 影像檢查 另外一個檢測神經母細胞瘤的手段是間位腆代芐胍（meta-
神經母細胞瘤的生化檢查
將近90%的神經母細胞瘤患者，其血液或尿液里兒茶酚胺及其代謝產物（多巴胺，高香草酸、香草扁桃酸）的濃度較正常人群有顯著升高。
神經母細胞瘤的影像檢查
另外一個檢測神經母細胞瘤的手段是間位腆代芐胍（meta-iodobenzylguanidine，mIBG）掃描。該檢查的分子機理為，間位腆代芐胍是去甲腎上腺素的功能類似物（analog），并可被交感神經元所攝取。當間位腆代芐胍與放射性物質如碘-131或者是碘-123耦聯后，即可作為放射性藥物而用
Nature－Genetics公布又一大規模癌癥基因組分析結果
超過20個研究機構的63位研究人員公布了一項包括30,000多人血液樣本的大規模研究成果，通過這項分析，研究人員確定了13種膠質瘤新遺傳危險因素，這揭示了增加膠質瘤易感性的個體DNA的特殊差異，同時也首次為臨床醫師提供了一種能區分成膠質細胞瘤和非膠質母細胞瘤等膠質瘤類型的新方法。 這一研究成果
Nature－Genetics：全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查
Nature－Genetics：全基因組測序的診斷價值
根據《Nature Genetics》上發表的一項新成果，全基因組測序有望用于臨床上的遺傳病診斷。這項研究評估了影響全基因組測序在臨床診斷中取得成功的因素。 這個國際研究小組由英國的研究人員領導，對156個病例或家庭開展了臨床基因組測序。這些病例有著遺傳疾病的特征，但無法通過之前的篩查檢測來解