7月28日,來自中科院上海生命科學研究院植物生理生態研究所李軒研究組、上海巴斯德研究所郝沛研究組以及密歇根州立大學王紅兵教授,在國際著名遺傳學期刊《PLOS Genetics》發表一項合作研究,題為“The Landscape of A-to-I RNA Editome Is Shaped by Both Positive and Purifying Selection”。這項研究通過對多生物物種RNA編輯事件的系統發現和分析,首次揭示了RNA編輯表觀遺傳學位點的系統進化規律,以及其在動物神經功能和神經發育中發揮的主要作用。 自從20年前第一次被發現以來,RNA編輯已經成為多種生命形式的遺傳編碼變異的重要來源。RNA編輯的一個突出機制是,前體mRNA分子中腺苷的去氨基。脫氨基的事件,即A-to-I編輯,將特殊的腺苷(A)轉換為肌苷(I)。在翻譯中,肌苷被解碼為鳥苷(G),從而導致密碼子的變化,往往會引起蛋白質產物中的氨基酸......閱讀全文
提到基因編輯,我們可能首先想到的是著名學者張鋒和Jennifer Doudna博士共同發現的CRISPR基因編輯系統。而提到單堿基編輯系統,我們可能首先會想到Broad研究所著名科學家David Liu和張鋒博士等人共同創建的Beam Therapeutics公司,這家初創公司致力于使用基于CR
2018年,美國FDA和歐洲EMA批準了來自RNA藥物制造兩大巨頭Ionis Pharmaceuticals公司的反義寡核苷酸療法藥物Tegesedi(Inotersen)和Alnylam Pharmaceuticals公司的siRNA療法藥物Onpattro(Patisiran),用于治療遺傳
前 言 基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外, DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用,且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此,對RNA進行功能研究和錯誤RNA
基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外, DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用,且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此,對RNA進行功能研究和錯誤RNA的糾正,成為了
前 言基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外, DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用,且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此,對RNA進行功能研究和錯誤RNA的糾
章魚、魷魚和烏賊經常并不嚴格地遵循其DNA中的遺傳指令,相反,它們利用酶清除RNA中的特定堿基A(腺苷),并且利用一種不同的堿基I(肌苷)替代它們。大多數動物很少使用這種被稱作RNA編輯的過程重新編碼蛋白,但章魚等頭足類動物在超過半數的轉錄基因中編輯RNA。在一項新研究中,當研究人員定量和描述頭
5月31日,國際學術期刊Nucleic Acids Research 在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所李軒研究組合作完成的題為Implementation of the CRISPR-Cas13a system in fission yeast and its r
國際學術期刊《Nucleic Acids Research》在線發表了中科院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所李軒研究組合作完成的題為“Implementation of the CRISPR-Cas13a system in fission yeast and its repurp
7月28日,PLOS Genetics 雜志發表了中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所李軒研究組題為The landscape of A-to-I RNA editome is shaped by both positive and purifying selection 的研究論文。
10月25日Science發表了CRISPR技術先驅張鋒研究組的最新成果:RNA editing with CRISPR-Cas13,咋一看這個標題還以為是張鋒一稿多投,因為實在是與本月初他們研究組發表在Nature的論文標題太像了(Nature論文:RNA targeting with CRI
7月28日,PLOS Genetics 雜志發表了中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所李軒研究組題為The landscape of A-to-I RNA editome is shaped by both positive and purifying selection 的研究論文。
使用工程核酸酶的基因組編輯技術,比如鋅指核酸酶(ZFN)、轉錄激活因子樣效應物核酸酶(TALEN)和CRISPR系統中的Cas蛋白已被用于操縱許多有機體的基因組。最近,科學家們已將胞苷脫氨酶或腺苷脫氨酶與CRISPR-Cas9融合在一起,構建出可編程的DNA堿基編輯器,從而為校正致病性突變提供新
如果一些編碼位點的RNA編輯受損,就會引起嚴重的疾病。因此,一些人認為編碼性RNA編輯是對人體有利的。 近年來的基因組研究顯示,人類基因組中有超過一千個編碼位點受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)編輯。許多這樣的RNA編輯事件屬于非同義替換。 現在
早在1989年研究人員就在植物中發現了RNA編輯的現象。2005年,第一個參與RNA編輯的蛋白因子被鑒定出來,發現它是一個PLS-type的PPR蛋白。近期來自華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室的研究人員報道了RNA編輯關鍵因子MORF蛋白可以和PLS-type PPR蛋白相互作用形成復報道
哈佛醫學院著名遺傳學家George Church教授是基因編輯技術的鼻祖之一:2年前張鋒使用CRISPR技術完成了多重基因組編輯,Church則使用CRISPR技術完成了RNA介導的人類基因組編輯。 自此之后,CRISPR/Cas9技術持續火爆,方便快捷的方式迅速風靡科研界,不論是醫學研究,農
在一項新的研究中,來自美國麻省總醫院、哈佛醫學院和哈佛大學陳曾熙公共衛生學院的研究人員報道近期開發的幾種在單個DNA堿基中產生靶向變化的堿基編輯器能夠在RNA中誘導廣泛的脫靶效應。他們還描述了對堿基編輯器變體進行基因改造可顯著降低RNA編輯的發生率,這同時也會增加在靶DNA編輯的精確度。相關研究
作為農業領域實力最強的高校之一,華中農業大學在作物遺傳育種、微生物學、果樹學、分子化學與分子生物學、遺傳學、細胞生物學等學科領域一直很有優勢。 近幾年,華中農業大學的這些優勢學科發展也都非常迅速。繼上個月一周連發3篇Nature子刊后,4月11日,華中農業大學3個研究團隊又同時發表了3篇頂尖論
2月24日,國際學術期刊《細胞研究》(Cell Research)在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組和計算生物學研究所楊力研究組的最新研究論文ADAR1 is required for differentiation and neural inducti
四吡咯代謝途徑廣泛存在于動物、植物和微生物中,如人體內的血紅素以及植物的葉綠素都經該途徑合成,對包括呼吸作用和光合作用在內的生命活動具有不可缺少的作用。RNA編輯是真核生物的一種重要調控方式,可在基因序列不變的情況下產生蛋白質的多樣性。之前,人們尚不清楚四吡咯代謝途徑與RNA編輯兩個迥然不同的過
如果說所有癌癥都有一個共同點的話,那就是無共同性。 因此這造成了癌癥難以治療的一個根本原因。近期來自德州大學MD安德森癌癥中心的研究人員發現了為什么作為許多癌癥的“孵化器”的蛋白質,會出現癌癥類別的差異,甚至患者之間的差異。這一發現為科學家們提供了新思路,對于開發更有效的癌癥精確治療方法十分重
向導RNA(guide RNA,gRNA),也稱為小向導RNA(small guide RNA,sgRNA)。是作用于動質體(kinetoplastid)體內一種稱為RNA編輯(RNA editing)的后轉錄修飾過程中。也是一種小型非編碼RNA。可與pre-mRNA配對,并在其中插入一些尿嘧啶
來自鄭州大學、中山大學癌癥中心及新加坡國立大學等處的研究人員證實,在食管鱗狀細胞癌(Esophageal Squamous Cell Carcinoma,ESCC)中腺苷脫氨酶ADARs介導了腺苷(A)至肌苷(I)RNA編輯。這一研究發現發表在12月的《癌癥研究》(Cancer research
最近一項新的研究,對于RNA(核糖核酸)編輯在癌癥中可能發揮的作用,提供了新的見解。這項研究結果發表在《Scientific Reports》雜志,可以讓我們進一步了解參與腫瘤發生和發展的一種新機制,并因此可能在未來帶來更好的治療方案。 在每一個健康的人體細胞中,連接到DNA中的遺傳信息,被轉
最近,美國《實驗生物學聯合會會刊》 (The FASEB Journal)發表了中科院上海生命科學研究院營養所劉勇研究組在RNA編輯與細胞分泌功能研究方面所取得的最新進展——Deficiency in RNA editing enzyme ADAR2 impairs regula
由布朗大學領導的一個研究小組編譯出了一份最大型、經最嚴格驗證的果蠅RNA編輯位點列表。該研究生成了關于這一模式生物基礎生物學的一些新見解,研究結果發表在9月29日的《自然結構和分子生物學》(Nature Structural & Molecular Biology)雜志上。 這
來自香港大學、新加坡國立大學、中山大學癌癥中心等處的研究人員發表了題為“Recoding RNA editing of AZIN1 predispose to hepatocellular carcinoma”的研究論文,證實ADAR 介導的AZIN1基因 A至I RNA編輯是誘發肝癌的
2017年3月,國際知名學術期刊PLOS Genetics在線發表了斯坦福大學Jin Billy Li課題組和中山大學生命科學學院張銳課題組共同研究的題為“Evolutionary analysis reveals regulatory and functional landscape of c
圖片來源于網絡 CRISPR技術日新月異,研究人員不僅為這種精確且相對易于操作的基因編輯技術尋找新的應用,而且也在進一步的完善這種技術,賦予它更多新的功能,今年CRISPR引人注目的技術突破包括: RNA編輯 雖然人體很多疾病是來自于DNA,但是由于基因承載著生命最根源的信息,因此直接對D
單堿基編輯技術是一種是自2012年CRISPR/Cas9技術被發現以來最寄予厚望的高精度基因編輯技術,其中一種單堿基編輯技術BE3可以在不切斷DNA雙鏈的情況下精確地引入由C/G到T/A的點突變,另外一項單堿基編輯技術ABE7.10可以由T/A突變成C/G的技術,對于基因突變導致的遺傳疾病的治療
核糖核酸(RNA)編輯是RNA水平一種常見的修飾,是增加基因轉錄和功能多樣性的重要形式。17日,來自中科院昆明動物研究所的消息,由張亞平院士領導的、多個研究機構加盟的團隊,在等位基因特異的RNA編輯研究上取得了重要進展。 中科院昆明動物研究所周中銀博士介紹,對二倍體生物來說,雖然兩個等位基因的