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  • 轉錄組的重編寫:RNA編輯

    前 言基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外, DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用,且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此,對RNA進行功能研究和錯誤RNA的糾正,成為了科學界的新一大熱點。特別是前2個月,北京大學和MIT分別在Nature Biotechnology與Science上發文,提出了名為“LEAPER”的A-to-I RNA編輯工具[1]和名為“RESCUE”的C-to-U RNA編輯器[2],被Nature Reviews Genetics和Nature Reviews Drug Discovery兩篇雜志分別點評是“拓寬了RNA單堿基編輯器的選擇”[3]和“拓展了RNA編輯的工具箱”[4],在業內引起了廣泛的關注與討論,進一步打開了我們深入認識RNA的大門。......閱讀全文

    RNA編輯主要類型

    ①簡單編輯,單堿基轉變的轉錄后調節;②插入編輯,插入單個核苷酸或少量核苷酸的丟失,其機制是轉錄鏈的跳格;③泛編輯,插入或缺失多個尿嘧啶核苷酸或轉錄后插入多個胞嘧啶,其機制是編輯序列由外源反義引導RNA( gRNA)提供,gRNA在編輯體(editosome)核蛋白顆粒中與前編輯mRNA配對,鑒別作為

    什么是RNA編輯?

    RNA編輯(RNA editing)是指轉錄后的RNA在編碼區發生堿基的加入、丟失或轉換等現象。RNA編輯產生的“基因”可稱為隱蔽基因( cryptogene),其產物的結構不能從基因組DNA序列中推導獲得。早在1986年發現錐蟲線粒體mRNA轉錄加工后,其mRNA的多個編碼位置上加入或丟失尿苷酸。

    概述RNA編輯的現象

      RNA編輯(RNA editing)是新發現的在mRNA水平上遺傳信息改變的過程。由于RNA編輯使mRNA中的編碼序列與它的基因中的編碼序列不一致。研究證明,mRNA中個別堿基的取代和加減,造成mRNA的堿基序列與它的基因的堿基序列不一致,使其仍能參與翻譯,所有這一系列的改變不是發生在基因水平上

    RNA編輯領域前世今生

      提到基因編輯,我們可能首先想到的是著名學者張鋒和Jennifer Doudna博士共同發現的CRISPR基因編輯系統。而提到單堿基編輯系統,我們可能首先會想到Broad研究所著名科學家David Liu和張鋒博士等人共同創建的Beam Therapeutics公司,這家初創公司致力于使用基于CR

    簡述RNA編輯的機制

      編輯一般發生在mRNA的3’端而不在5’端,1988年Kenneth等首次報道了編輯在3'端的現象。他們合成了2種編輯引物和2種未編輯引物。完全編輯的成熟RNA僅能同編輯引物雜交,用PCR檢測到了雜交帶,它不能雜交到未編輯mRNA上。相反,未編輯RNA僅能同未編輯引物反應。如果編輯是從轉

    簡述RNA編輯的意義

      RNA編輯的生物學意義主要有:  ①校正作用,因4個核苷酸的插入移碼,使其肽鏈的序列和其他生物的相似;  ②調控翻譯,通過編輯可以引入或去除起始密碼子或終止密碼子;  ③擴充遺傳信息,經編輯后增加了肽鏈的編碼信息量

    關于RNA編輯的基本介紹

      RNA編輯(RNA editing)是指轉錄后的RNA在編碼區發生堿基的加入、丟失或轉換等現象。RNA編輯產生的“基因”可稱為隱蔽基因( cryptogene),其產物的結構不能從基因組DNA序列中推導獲得。 早在1986年發現錐蟲線粒體mRNA轉錄加工后,其mRNA的多個編碼位置上加入或丟失尿

    RNA編輯如何促進腫瘤生長?

      最近一項新的研究,對于RNA(核糖核酸)編輯在癌癥中可能發揮的作用,提供了新的見解。這項研究結果發表在《Scientific Reports》雜志,可以讓我們進一步了解參與腫瘤發生和發展的一種新機制,并因此可能在未來帶來更好的治療方案。  在每一個健康的人體細胞中,連接到DNA中的遺傳信息,被轉

    CRISPR的新前沿:編輯RNA

      基因編輯工具CRISPR令科學家們修改DNA的能力發生了革命性的變化,如今,該工具的一種新的版本能對RNA進行靶向修改。編輯RNA而不是DNA有若干優點,例如,它能減輕與DNA相關的在倫理方面的顧慮,它能為科學家在活體生物中提供更為精確的編輯時間框架(如在關鍵性的發育期中)。在這里,David

    關于RNA編輯的分類介紹

      RNA編輯主要類型有:  ①簡單編輯,單堿基轉變的轉錄后調節;  ②插入編輯,插入單個核苷酸或少量核苷酸的丟失,其機制是轉錄鏈的跳格;  ③泛編輯,插入或缺失多個尿嘧啶核苷酸或轉錄后插入多個胞嘧啶,其機制是編輯序列由外源反義引導RNA( gRNA)提供,gRNA在編輯體(editosome)核蛋

    大腦RNA編輯位點“辭典”發布

    美國西奈山伊坎醫學院研究人員對大腦中的數千個位點進行了編目,在這些位點中,RNA在整個人類生命周期中被修飾,這個過程被稱為腺苷到肌苷(A-to-I)編輯,其為理解大腦發育的細胞和分子機制以及它們如何影響健康和疾病提供了重要的新途徑。在《細胞報告》上發表的論文中,研究團隊描述了大腦中RNA編輯的速率如

    轉錄組的重編寫:RNA編輯

      前 言   基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外, DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用,且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此,對RNA進行功能研究和錯誤RNA

    轉錄組的重編寫:RNA編輯

      基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外, DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用,且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此,對RNA進行功能研究和錯誤RNA的糾正,成為了

    RNA編輯技術治療嚴重罕見病

      肌肉萎縮癥目前還沒有治愈的方法,患有這種疾病的兒童在早年失去了重要的肌肉力量。根據來自美國西北大學醫學院和芝加哥大學的一項最新研究,一種被稱為“外顯子跳躍(exon skipping)”的RNA編輯技術,在治療一種罕見而嚴重形式的肌肉萎縮癥的過程中,已經取得初步成效。相關研究結果發表在十月十二日

    轉錄組的重編寫:RNA編輯

    前 言基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外, DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用,且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此,對RNA進行功能研究和錯誤RNA的糾

    RNA編輯的生物學意義

    RNA編輯的生物學意義主要有:①校正作用,因4個核苷酸的插入移碼,使其肽鏈的序列和其他生物的相似;②調控翻譯,通過編輯可以引入或去除起始密碼子或終止密碼子;③擴充遺傳信息,經編輯后增加了肽鏈的編碼信息量。

    浙大:RNA編輯阻止RISC識別靶標mRNA

      MicroRNAs(miRNAs)結合Ago形成RNA誘導沉默復合體,通過沉默靶mRNA調控基因表達。miRNA的RNA編輯可能影響miRNA的加工,Ago復合物的組裝,以及靶mRNA的結合。然而,組裝進Ago復合物的被編輯的miRNA的功能,還沒有被深入研究過。  浙江大學生命科學學院章曉波教

    Cancer-Research:RNA編輯與食管癌

      科學家們首次在食管鱗狀細胞癌中發現,負責編輯RNA的酶發生過表達,促進了癌癥的發展。   食管鱗狀細胞癌ESCC(Esophageal Squamous Cell Carcinoma)是食管癌的一種主要類型。新加坡國立大學NUS的科學家們發現,RNA 腺苷脫氨酶1(ADAR1)可以作為

    張建之教授PNAS解析RNA編輯

      如果一些編碼位點的RNA編輯受損,就會引起嚴重的疾病。因此,一些人認為編碼性RNA編輯是對人體有利的。   近年來的基因組研究顯示,人類基因組中有超過一千個編碼位點受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)編輯。許多這樣的RNA編輯事件屬于非同義替換。   現在

    新型腺嘌呤堿基編輯器可讓細胞RNA編輯最小化

      在一項新的研究中,來自美國布羅德研究所和哈佛大學的研究人員發現有證據表明使用堿基編輯器會導致細胞中出現意想不到的RNA編輯。相關研究結果發表在2019年5月8日的Science Advances期刊上,論文標題為“Analysis and minimization of cellular RNA

    基因編輯大牛張鋒開發出RESCUE技術,可擴大RNA編輯能力

      基于CRISPR的工具徹底改變了我們靶向與疾病相關的基因突變的能力。CRISPR技術包括一系列不斷增長的能夠操縱基因及其表達的工具,包括利用酶Cas9和Cas12靶向DNA,利用酶Cas13靶向RNA。這一系列工具提供了處理突變的不同策略。鑒于RNA壽命相對較短,靶向RNA中與疾病相關的突變可避

    Nature重大突破:CRISPR也可編輯RNA

      一種用來編輯基因組中DNA指令的強大科學工具現在也可以應用于RNA。來自加州大學伯克利分校和勞倫斯伯克利國家實驗室的一個研究人員小組,證實借助于一種方法可以編程CRISPR/Cas9蛋白復合物在序列特異性的靶位點識別并切割RNA。這一研究發現有可能改變RNA功能研究的模式,為檢測、分析和操控RN

    中科院PLOS發表RNA編輯新成果

      7月28日,來自中科院上海生命科學研究院植物生理生態研究所李軒研究組、上海巴斯德研究所郝沛研究組以及密歇根州立大學王紅兵教授,在國際著名遺傳學期刊《PLOS Genetics》發表一項合作研究,題為“The Landscape of A-to-I RNA Editome Is Shaped by

    科學首次揭示“RNA編輯”生物學功能

      棲息在南極冰冷海水中的章魚并沒有給自己的觸手帶上手套,但它卻找到了另一種方式來抵御寒冷。   一項新的研究表明,這種海洋生物利用一種被稱為核糖核酸(RNA)編輯的手段來定制在低溫下工作的關鍵神經系統蛋白質。這篇論文同時也第一次揭示了RNA編輯——不僅僅是改變一個特定的基因——能夠導致適應。

    科學家提出“RNA編輯”新方式遭質疑

    Vivian G. Cheung   美國賓州大學Vivian G. Cheung課題組今年五月份在《科學》發表文章指出,人類細胞中有超過10000個外顯子位點存在轉錄RNA序列和模板DNA序列不匹配現象。此結論意味著可能存在“RNA編輯”新方式。然而,該結論遭到了其他科學家的

    PNAS:利用RNA控制CRISPR/Cas9基因編輯

      在過去的幾年里,研究人員找到了一種方法利用天然存在的細菌免疫系統CRISPR/Cas9來失活或糾正任何生物體內的特定基因。然而,CRISPR/Cas9持續地發揮基因編輯活性,帶來了額外編輯不必要位點的風險。  現在,來自加州大學圣地亞哥醫學院、Ludwig癌癥研究所和艾希司制藥公司(Isis P

    中山大學等開發RNA編輯新工具

      CRISPR-Cas9系統使用一段引導RNA(其與Cas9蛋白結合起來才能發揮作用)來靶定一段DNA,并裂解雙鏈DNA。這一現象提出了一個問題:由一個Dicer結合RNA元件和一段反義RNA組成的一種人造小RNA(asRNA,是否也能用來誘導Dicer處理和降解一段特定的RNA呢?  為此,5月

    基因編輯鼠的構建-Guide-RNA設計和篩選

    眾所周知,CRISPR/Cas9被業內譽為“基因剪刀”,它可以高效地實現靶基因的編輯,自問世以來就備受關注和青睞。CRISPR/Cas9系統是由CRISPR相關基因和Cas9組成,Cas9核酸酶會在向導RNA(Guide RNA, gRNA)的指引下,在完整基因組上的特定位點完成切割反應,同

    梁晗:RNA編輯為精確癌癥治療帶來新希望

      如果說所有癌癥都有一個共同點的話,那就是無共同性。  因此這造成了癌癥難以治療的一個根本原因。近期來自德州大學MD安德森癌癥中心的研究人員發現了為什么作為許多癌癥的“孵化器”的蛋白質,會出現癌癥類別的差異,甚至患者之間的差異。這一發現為科學家們提供了新思路,對于開發更有效的癌癥精確治療方法十分重

    孟山都CTO談基因編輯、RNA干擾與行業并購影響

      Fraley對兩公司的合并持樂觀態度,并認為這是一次積極健康的合并。通過合并,兩者可擴大規模,同時得到更多研發資金,繼續保持育種優勢。  記者:關于基因編輯的問題。之前有報道說孟山都已經在談基因編輯的專利問題,很多人猜測孟山都很可能已經有基因編輯的產品在研發,或者是將要推出來,能不能介紹一下基因

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