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  • 能源所發明簡易高效的單細胞分選與測序對接技術

    為了滿足考察自然界中細胞“原位功能”這一共性科學需求,“現場”、“實時”的單細胞分選與測序已成為生命科學裝備研制領域的一個重要發展趨勢。盡管第三代測序技術已實現儀器微型化,但與測序對接的單細胞精準分選裝備卻仍然相當笨重和昂貴,難以支撐各種科學考察中針對微生物組功能的現場分析。最近,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心研究員馬波帶領的微流控系統團隊,通過設計簡易高效的單細胞分選與測序對接裝置,實現了每個試管有且只有一個細胞(One-Cell-One-Tube),有望服務于“現場”、“實時”乃至“便攜式”的單細胞分選與測序。 與人體和高等動植物細胞相比,微生物細胞通常更小(0.1-10 微米),更加難于精準操縱,因此分離獲取目標單細胞、并且實現測序反應要求的“One-Cell-One-Tube”是一個關鍵難點。目前的自動單細胞分離方法大多依賴于昂貴且體積龐大的熒光流式細胞分選儀(FACS),而現有的手動單細胞分離和......閱讀全文

    能源所發明簡易高效的單細胞分選與測序對接技術

      為了滿足考察自然界中細胞“原位功能”這一共性科學需求,“現場”、“實時”的單細胞分選與測序已成為生命科學裝備研制領域的一個重要發展趨勢。盡管第三代測序技術已實現儀器微型化,但與測序對接的單細胞精準分選裝備卻仍然相當笨重和昂貴,難以支撐各種科學考察中針對微生物組功能的現場分析。最近,中國科學院青島

    青島能源所發明簡易高效的單細胞分選與測序對接技術

      為了滿足考察自然界中細胞“原位功能”這一共性科學需求,“現場”、“實時”的單細胞分選與測序已成為生命科學裝備研制領域的一個重要發展趨勢。盡管第三代測序技術已實現儀器微型化,但與測序對接的單細胞精準分選裝備卻仍然相當笨重和昂貴,難以支撐各種科學考察中針對微生物組功能的現場分析。最近,中國科學院青島

    青島能源所發布首臺單細胞拉曼分選及測序耦合系統

      10月20日,在第二十屆全國分子光譜學學術會議暨2018年光譜年會上,中國科學院青島生物能源與過程研究所發布了自主研發的單細胞拉曼分選及測序耦合系統(RACS-SEQ)。該系統無需標記即可獲知細胞種系發生、生理狀態及所處的微環境變化等關鍵表型,并在單細胞水平精度對接表型組與基因組。  RACS-

    單細胞分選效率的分析

    引言在單克隆細胞培養時,手動有限稀釋法是最經典的分離單細胞手段之一。這種方式分離單細胞,每個孔中落進去的細胞數目符合泊松分布。依靠單細胞分選儀器分離單細胞的效率,無論從分選能力還是重復性都要明顯優于手動的有限稀釋方法。測定一款設備分選效率的標準方法,是用熒光校準微球來分選檢驗。實驗方法Namocel

    新型單細胞分選有哪些優勢?

     單細胞分選摒棄一貫以來通過微珠實現液滴延遲的做法,這樣可減少因噴嘴堵塞而重新計算液滴延遲時間時需要取出無菌樣品的情況,從而確保分選過程中無菌狀態不會中斷。此外還能監測及保持液滴斷點的穩定以實現無間斷無菌分選,確保分選的完整性。  雙前向角散射光檢測技術可實現同時在三個數量級上測量散射光信號的特性,

    中科院青島生物能源所發布單細胞拉曼分選測序耦合系統

      2018年10月20日,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心在第二十屆全國分子光譜學學術會議暨2018年光譜年會,發布了自主研發的單細胞拉曼分選及測序耦合(RACS-SEQ)系統。  RACS-SEQ系統通過拉曼組(Ramanome)分析原理、拉曼光鑷液滴單細胞分選(RAGE)、流式微液

    如何實現高通量的單細胞分選?

     單細胞分選通過集成基于介電的單細胞捕獲釋放和電磁閥吸吮技術,實現了高速流動狀態下單細胞的捕獲、采集、釋放和分選,通量達~60個細胞/分鐘。? ? 為了進一步提高通量,研究人員提出,單細胞經液滴包裹后,通過耦合介電可實現高通量分選。  首先,液滴表面凸/凹的形狀會產生透鏡效應,影響激光聚焦,降低空間

    高通量測序技術核酸片段分選

    近年來,高通量測序技術已經日漸成為基因組學研究項目的標準。從樣品制備到文庫制備及最終測序,大多步驟都要求精確高效化、易于自動化操作,并且許多高通量測序應用都要求核酸片段在特定范圍內緊密分布,因此精準快速的進行片段選擇步驟更具挑戰性。在進行核酸片段分選的過程中,傳統的瓊脂糖凝膠回收法不適于安全、高通量

    單細胞測序需要準備什么再去測序

    DNA測序的測序原理: DNA測序是指分析特定DNA片段的堿基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)與鳥嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。

    單細胞分選整體結構設計合理

      單細胞分選全體結構設計合理   單細胞分選可完結一起在三個數量級上測量散射光信號的特性,適當的波長挑選則可將檢測規模擴展至405–640 nm,然后可對較小和較大的顆粒進行檢測,憑借該儀器,研討人員可對品類繁多的生物樣本進行研討工作,從微粒體到巨噬細胞,從星型膠質細胞到異種移植體,全都能夠進行

    單細胞分選可應對各種復雜生物樣本

    單細胞分選與傳統的流式細胞分選技術相比,該技術不對細胞進行任何“修飾”即可實現精準分選,可保持細胞本來的狀態,對不同類型和尺寸的細胞具有良好的普適性,可應對各種復雜生物樣本,特別適用于微生物單細胞分選。  細胞分選可從血液、尿液等成分復雜的臨床樣本中,快速定位并分離病原微生物,從而指導用藥,為患者特

    單細胞分選的使用方法和應用

     單細胞分選控制臺可通過計算機USB接口控制流體閥和顯微LED照明光源,同時也可以自由地控制顯微鏡熒光快門,并且整合了高速控制閥實現流體快速、精密控制。  一、使用方法  細胞分選儀配備高精度微移液管支架,控制臺始終保證微量吸液管位于視場的正中心,并且微移液管控制臺可非常容易地安裝在物鏡上,同時軟件

    單細胞分選方式利弊以及難易程度介紹

     單細胞分選是對細胞(或微粒)的物理、生理、生化、免疫、遺傳、分子生物學性狀及功能狀態等進行定性或定量檢測的一種現代細胞分析技術。  如果對通量要求較高,同時目標細胞有適宜的熒光標記,可利用流式細胞儀完成分選。經熒光染色或標記的單細胞懸液,被高壓壓入流動室內,在鞘液的包裹和推動下,細胞被排成單列,以

    Nature:單細胞測序(下)

      隨著技術的飛速發展,成本大大降低,使得基因組測序成為常規技術。然而,大多數的人類基因組、癌癥或其他仍然是通過從多個細胞中抽提DNA來進行測序,它所忽略的細胞間的差異對于控制基因表達、細胞行為和藥物反應卻有可能是至關重要的。   該研究小組也觀測了其他類型的乳腺癌。將腫瘤作為一個整體測序,研究小

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。

    Nature:單細胞測序(上)

      Nicholas Navin所需要的就只是一個細胞――問題是如何得到它。這是在2010年,冷泉港實驗室的博士后研究員正在探究驅動乳腺癌的遺傳改變。此前的大部分癌癥基因組研究都是碾碎少量的腫瘤組織,一并將這些DNA進行測序,生成的是一張癌癥基因組的一致圖像。但Navin想要解析來自單個細胞的序

    單細胞測序方法匯總

    單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題,而且-前沿的領域就是單細胞RNA測序了(scRNA-seq)。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序,并給出平均差異,但并沒有兩個細胞是完全一樣的,而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變,甚至這種技術還能夠闡明完整

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。

    單細胞測序方法介紹

    單細胞RNA測序(scRNA-seq)作為一種全基因組測序的方式,在單細胞層面廣泛用于確定細胞類型和細胞變異的鑒定。Namocell單細胞分離儀可以通過細胞標記CD27以及一種細胞活性的染料,來分選出單個活的B細胞。通過分析分離后的單細胞基因表達情況,對比靜息記憶B細胞,可以從單細胞層面研究基因表達

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。

    什么是單細胞測序?

    單細胞測序是一種能夠在單個細胞水平上對基因組、轉錄組、表觀遺傳組等進行分析的技術。通過單細胞測序,可以:揭示細胞的異質性:了解即使是看似相同的細胞群體中,每個細胞在基因表達、染色質可及性等方面的獨特特征。發現新的細胞類型和狀態:識別出傳統方法難以區分的稀有細胞類型以及細胞在不同生理或病理條件下的特殊

    Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序

    2018年11月,Namocell與CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞,并且將其進行單細胞測序,為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序(scRNA-s

    時空分辨單細胞測序技術與其他單細胞測序技術的差異

    時空分辨單細胞測序技術與其他單細胞測序技術主要在以下方面存在區別:空間信息獲取普通單細胞測序技術:通常不提供細胞在原始組織中的空間位置信息。時空分辨單細胞測序技術:能夠同時獲取細胞的基因表達等信息以及它們在組織內的空間位置。細胞間相互作用分析普通單細胞測序技術:難以直接推斷細胞間基于空間位置的相互作

    時空分辨單細胞測序技術和傳統單細胞測序技術的區別

    時空分辨單細胞測序技術和傳統單細胞測序技術主要有以下區別:空間信息獲取傳統單細胞測序:通常無法獲取細胞在組織中的空間位置信息,只是對分離出的單細胞進行獨立分析。時空分辨單細胞測序:能夠在測定單細胞基因表達等信息的同時,明確細胞在原始組織中的具體空間位置。細胞互作研究傳統單細胞測序:難以直觀地揭示基于

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

    時空分辨單細胞測序技術與傳統單細胞測序技術有何不同?

    時空分辨單細胞測序技術與傳統單細胞測序技術主要有以下幾個方面的不同:空間信息獲取傳統單細胞測序技術通常無法提供細胞在組織中的空間位置信息,只是對分離的單細胞進行獨立分析。時空分辨單細胞測序技術能夠在獲取單個細胞基因表達等信息的同時,明確細胞在組織中的具體位置。細胞間相互作用研究傳統技術難以直接揭示細

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