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    上海生科院《GenomeRes》生物信息學新成果

    十月十三日,國際基因組研究權威刊物《Genome Research》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所(中國科學院—馬普學會計算生物學伙伴研究所)的一項最新研究,題為“A probabilistic method for testing and estimating selection differences between populations”。該研究介紹了一種新的群體遺傳學數據分析方法,這種概率統計方法可用于檢測和估算群體間的選擇差異。延伸閱讀:序列分析/生物信息學的十個手機應用程序。 本文第一作者兼通訊作者是中科院—馬普學會計算生物學伙伴研究所的何云剛研究員,他主要從事人類群體遺傳學和計算基因組學研究,并著重于基因組多態性的群體遺傳學, 計算基因組學和疾病研究中的計算生物學問題。部分相關工作發表在PNAS、Cell Research等雜志。中科院院士、教育部長江學者講座教授、國家“千人計劃”金......閱讀全文

    遺傳發育所揭示DNA甲基化在大豆馴化改良中的變異機制

      作物馴化是農業發展中最重要的事件之一。通過對野生作物的不斷馴化改良,人類才得以獲得符合生產生活需要的現代作物。馴化改良過程就是對作物群體基因組多樣性進行選擇的過程。目前對作物馴化改良的研究主要集中在對遺傳變異的選擇,在DNA水平鑒定到了大量的馴化選擇區間。然而,除了遺傳變異,表觀遺傳也在植物的生

    達爾文加拉馬克,可能才是完整的進化論

      隨著科學的進一步發展,達爾文理論也顯示出了一些不足之處。  所謂物競天擇,適者生存,現代生物學的許多主流研究方向都以查爾斯·達爾文(Charles Darwin)“自然選擇”的進化論為基礎:只有最能適應環境的生命體才能在物種演化的洪流中獲得生存和繁衍的權利。這個自然選擇的過程也被稱為適應,而最容

    哺乳類實驗動物的遺傳質量控制(國家標準信息發布)

    GB 14923-2001                      哺乳類實驗動物的遺傳質量控制            &nbs

    研究揭示樹木遺傳多樣性對功能性狀和群落生產力的影響

      大部分關于生物多樣性與生態系統功能(BEF)的研究表明物種多樣性能夠促進群落生產力,這是由于物種之間的功能差異帶來的物種多樣性效應的作用結果。而生物多樣性是多尺度的,除物種多樣性外,種內遺傳多樣性及其與物種多樣性的潛在交互作用對BEF關系的影響還知之甚少,特別是關于種內基因型之間的功能差異和對生

    干細胞牛人Science:iPSC為疾病研究插上翅膀

      誘導多能干細胞(iPSC)技術為我們提供了超乎預想的可能性在培養皿中模擬人類疾病。將來自患者的體細胞重編程至胚胎干細胞樣狀態,隨后再分化為疾病相關的細胞類型,生成的人類組織攜帶著可引起或促進疾病形成的遺傳變異,由此為我們提供了無限的人類疾病組織資源。然而,盡管這種“培養皿中的疾病”(diseas

    從達摩的眼皮到DNA尋蹤,茶的馴化史不簡單

      傳說在公元500年左右,菩提達摩坐在一個洞穴里,清醒而專注地冥想,這一冥想就是9年。但最后,他還是打了個瞌睡。醒來之后,達摩對自己十分生氣,于是扯掉自己的眼皮,厭惡地扔在了地上。誰想,從這被丟掉的眼皮中竟長出一株植物來,達摩的信徒用它泡水喝,既能活躍思維,又能安神鎮心。這就是第一株茶樹,茶水成為

    醫療器械境外臨床試驗數據技術指導原則意見稿出爐

      為了更好滿足公眾對醫療器械的臨床需要,促進醫療器械技術創新,依據《關于深化審評審批制度改革鼓勵藥品醫療器械創新的意見》關于接受境外臨床試驗數據的要求,我中心組織起草了《接受醫療器械境外臨床試驗數據技術指導原則(征求意見稿)》。  為使該指導原則更具有科學合理性及實際可操作性,即日起在我中心網上公

    CFDA:接受醫療器械境外臨床試驗數據

      昨天,CFDA發了一則消息,金花特地查詢了媒體圈,好像沒看到有什么反應。   但這其實是一個非常重大的落地政策。這個政策的發布:   意味著我國醫療器械臨床試驗徹底與國際接軌,我國承認國外的臨床試驗數據,也允許醫療器械公司同時在境外和我國同時開展臨床試驗,現在具體的原則都已經出來了!   

    哺乳類實驗動物的遺傳質量控制(一)

    1 范圍本標準規定了哺乳類實驗動物的遺傳分類及命名原則、繁殖交配方法和近交系動物的遺傳質量標準。   本標準適用于哺乳實驗動物的遺傳分類、命名、繁殖及近交系小鼠、大鼠的遺傳純度檢測。2 哺乳類實驗動物的遺傳分類及命名   根據遺傳特點的不同,實驗動物分為近交系、封閉群和雜

    哺乳類實驗動物的遺傳質量控制(一)

    1 范圍本標準規定了哺乳類實驗動物的遺傳分類及命名原則、繁殖交配方法和近交系動物的遺傳質量標準。本標準適用于哺乳實驗動物的遺傳分類、命名、繁殖及近交系小鼠、大鼠的遺傳純度檢測。2 哺乳類實驗動物的遺傳分類及命名根據遺傳特點的不同,實驗動物分為近交系、封閉群和雜交群。2.1 近交系 ired stra

    武漢植物園瀕危植物殘存居群數量性狀遺傳分化研究獲進展

      自然選擇以及遺傳漂變是決定植物居群的遺傳與表型分化的重要進化力量。在一些常見的動植物中,自然選擇(selection)以及遺傳漂變(genetic drift)如何影響物種的適應性表型性狀分化的研究已有大量的報道,然而對于片斷化分布的瀕危物種而言,小且相互隔離的居群的數量性狀如何響應自然選擇

    瀕危植物殘存居群數量性狀遺傳分化研究獲進展

      自然選擇以及遺傳漂變是決定植物居群的遺傳與表型分化的重要進化力量。在一些常見的動植物中,自然選擇(selection)以及遺傳漂變(genetic drift)如何影響物種的適應性表型性狀分化的研究已有大量的報道,然而對于片斷化分布的瀕危物種而言,小且相互隔離的居群的數量性狀如何響應自然選擇

    分子標記

    內容:一、遺傳標記 二、DNA分子標記 三、染色體原位雜交 四、DNA分子標記的應用 長期以來,植物育種中選擇都是基于植株的表型性狀進行的,當性狀的遺傳基礎較為簡單或即使較為復雜但表現加性基因遺傳效應時,表型選擇是有效的。但水稻的許多重要農藝性狀為數量性狀,如

    科研人員發現青藏高原冰川湖泊裂腹魚的遺傳和表達模式

      生物對環境的適應是進化生物學研究的基礎問題,也是生態學研究的熱點。然而,飽受爭議的科學問題是:生活在同一區域內的物種能否在演化過程中分化出新的物種(同域分化)?盡管一些證據表明物種的分化是以這種方式發生的,但是關于分化過程中基因的表達模式和種群遺傳學特征知之甚少。  為了探討上述科學問題,中國科

    微衛星DNA分子標記及其應用

      微衛星(Microsatellite,MS)又稱短串聯重復(Short Tandem Repeats,STR)或簡單序列重復(Simple Sequnce Repeat,SSR),是指基因組中以少數幾個核苷酸(多數為2-4個)為單位多次串聯重復組成的長達幾十個核苷酸的序列。其中最常見的是雙核苷酸

    微衛星DNA分子標記及其應用(二)

    3. 微衛星分子標記技術的應用 微衛星DNA 作為遺傳標記具有很大的優越性。近年來隨著研究的不斷深入,對微衛星標記的研究不僅具有重要的理論意義, 而且還具有較好的應用前景。3.1 微衛星多態性分析在自然界中,生物個體表現出來的各種遺傳變異,在本質上就是DNA 的差異,因此通過研究DNA的變異來分

    首次揭秘“個體之間衰老速度不同”的遺傳基礎!

       2017年11月9日,《自然》(Nature)雜志以長篇研究論文(Article)形式發表了中國科學院神經科學研究所、腦科學與智能技術卓越創新中心、神經科學國家重點實驗室蔡時青研究組題為《膠質細胞-神經元信號的遺傳多態性調節衰老速度》的研究工作。  衰老是有機體生理功能隨時

    科學家發現歐亞人群復雜疾病遺傳基因差異

      記者4月11日從中科院昆明動物研究所獲悉,日前,該所科學家通過國際合作,在復雜精神疾病——雙向情感障礙的遺傳學分析上取得成果,鑒定了個歐洲人群中新的雙向情感障礙易感基因。此外,該研究也揭示了在復雜病癥的遺傳方面,不同種族人群的進化差異是導致易感基因差異的重要原因之一。   復雜疾病,也被稱為多

    張鋒教授Nature子刊發文:編輯人類基因組需謹慎!

       過去的幾天里,CRISPR領域又帶來了一波吸引眼球的新聞。上周,MIT科技評論發布了一項重磅消息,俄勒岡健康與科學大學的Shoukhrat Mitalipov使用了CRISPR基因編輯技術首次在美國進行胚胎基因編輯(附:原文鏈接)。而緊接著,CRISPR技術先驅張鋒便在Nature Medic

    玉米品種容重的簡要分析

         玉米種子的容重是我們檢測玉米品種質量好壞的主要參考標準,在最近這幾年里我們已經將這指數納入了我們評價商品的指標中了。目前我們都是使用玉米容重器來對其進行檢測的,但是目前的檢測技術還是存在著一些漏洞,這樣就需要我們在技術方面要不斷的更新。為此,摸清玉米

    常用的幾種分子標記

    RAPD利用 10 個堿基的一個或幾個隨機引物非定點地擴增 DNA 片段,一般一個引物可擴增 6-12 條 DNA 片段,利用凝膠電泳分開擴增的片段,從而進行基因多態性研究。 RAPD 是一種能快速進行基因多態性研究的技術,并且由于不涉及印跡雜交、放射性自顯影等技術,因此簡便易行。 SSR

    借助電子容重器研究吉林省玉米品種容重特點

    玉米籽粒容重是玉米商品品質的重要指標,近年來才納入到玉米商品品質的評價指標中。目前對提高玉米容重的研究已引起人們的重視,但是對吉林省目前生產中應用的玉米品種容重的概況還缺乏系統研究。因此借助電子容重器,摸清吉林省玉米品種子粒容重的底數,為生產中正確選擇高容重的玉米品種,提高玉米容重的研究都有著現實意

    北京基因組所等揭示Y染色體表觀信息遺傳機制

      表觀遺傳學是與傳統遺傳學相對應的概念。遺傳學以基于DNA序列的中心法則來傳遞遺傳信息,在人群中,遺傳信息在世代之間穩定遺傳,那么表觀遺傳信息是否像遺傳信息一樣可被子代繼承,尚缺少相關有力證據。DNA甲基化是非常重要的表觀遺傳信息,是表觀遺傳學研究的重要內容。目前,鮮少有DNA甲基化在人群中的繼承

    Nature:男人存在的意義是什么?

      來自英國東英吉利亞大學的一項新研究表明,稱作“性選擇”的一種進化動力可以解釋,性作為繁衍后代的主導機制延續下來的原因。  生物學家們長期以來感到困惑:以無情追求效率而著稱的進化選擇,是如何允許雄性存在的——在那么多的物種中他們對于生殖的唯一貢獻就是提供了精子。  發表在5月18日《自然》(Nat

    Nature揭示男人存在的意義

      來自英國東英吉利亞大學的一項新研究表明,稱作“性選擇”的一種進化動力可以解釋,性作為繁衍后代的主導機制延續下來的原因。  生物學家們長期以來感到困惑:以無情追求效率而著稱的進化選擇,是如何允許雄性存在的——在那么多的物種中他們對于生殖的唯一貢獻就是提供了精子。  發表在5月18日《自然》(Nat

    Science、Nature聚焦人類基因組研究

      生物通報道 兩項研究探究了被認為是人類起源的撒哈拉以南非洲狩獵采集者和牧民的遺傳學,研究結果揭示盡管南非click語言人群居住地相互靠近,但他們屬于不同的遺傳群體。   為了評估遺傳差異程度,兩個研究小組均檢測了不同種群DNA中的單核苷酸多態(SNPs)。由瑞典烏普薩拉大學Carina

    基因敲除技術簡介

    動物實驗和實驗動物都要求達到實驗室操作規范(good laboratory practice, GLP)和標準操作程序(standard operating procedure, SOP)這些規范和操作對實驗動物和實驗室條件,工作人員素質,技術水平和操作方法都要求標準化。所有藥物的安全評價試

    『珍藏版』瘦素的那些事兒

      1950年,Ingalls發現了一種“肥胖基因”(ob),它的突變可以導致肥胖和糖尿病。Kennedy和Hervey分別于1956年和1958年發現了脂肪分泌的一種“飽感因子”,它能通過下丘腦控制動物攝食量,調節體重。歷經幾十年的研究與發展,科學家通過定位克隆技術得到 ob 基因。ob 基因編碼

    實驗動物的選擇

    動物實驗和實驗動物都要求達到實驗室操作規范(good laboratory practice, GLP)和標準操作程序(standard operating procedure, SOP)這些規范和操作對實驗動物和實驗室條件,工作人員素質,技術水平和操作方法都要求標準化。所有藥物的安全評價試

    選擇實驗動物的原則

      當前,動物實驗和實驗動物都要求達到實驗室操作規范(good laboratory practice, GLP)和標準操作程序(standard operating procedure, SOP)這些規范和操作對實驗動物和實驗室條件,工作人員素質,技術水平和操作方法都要求標準化。所有藥物

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