突破性單細胞表觀基因組與轉錄組分析新技術
由英國及比利時的研究人員開發出的一種新方法，使得在單細胞中同時研究表觀基因組及轉錄組成為可能。發布在《自然方法》（Nature Methods）上的實驗方案，可幫助科學家們精確描繪出DNA甲基化改變與基因表達之間的關系。 近年來單細胞測序技術發展迅速，被廣泛用于研究細胞間的基因表達譜（轉錄組）差異。近期的一些單細胞實驗方案也使得研究人員能夠探索基因表達改變背后的驅動力——諸如DNA甲基化一類的DNA化學修飾。然而直到現在，都只能夠分別研究單細胞轉錄組和表觀基因組。 EMBL歐洲生物信息學研究所(EMBL-EBI)的Oliver Stegle說：“這一新的實驗方案讓你可以并行分析同一單細胞中的DNA甲基化和RNA。我們的方法提供了有關單細胞DNA甲基化異質性與特定基因表達差異之間關系的首個直觀視圖。” Wellcome Trust Sanger研究所及比利時天主教魯汶大學的Thierry Voet解釋說：“這種方法結合了......閱讀全文
靶向深度測序和單細胞基因測序的區別
1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序，有效降低了測序成本，提高了測序深度，能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序
靶向深度測序和單細胞基因測序的區別
1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序，有效降低了測序成本，提高了測序深度，能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序
Science：新型單細胞基因表達檢測技術
發表在最新一期《科學》(Science)雜志上的一篇研究論文，證實了一種新型的大規模平行測序技術可借助于新一代測序(NGS)在單細胞水平上檢測基因表達。 論文作者、來自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fo
《細胞》：單細胞測序助力基因重組圖譜
來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章，首次公布了來自一個成人男子91個
當宏基因組遇上單細胞測序
日前，科學家們通過宏基因組測序和單細胞測序鑒定了一類新細菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成為了微生物檢測和分類鑒定的強有力工具。這種方法為科學家們揭示了微生物群體的高度復雜性，但它還是有所遺漏。美國能源部聯合基因組研究所上周的一次會議上，研究者人員向人們展示了在四個溫泉樣本
研究開發單細胞測序分析TEs表達的工具包
??中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院（以下簡稱廣州健康院）陳捷凱課題組和南方科技大學Andrew Hutchins課題組合作開發出單細胞測序分析轉座元件表達的工具包scTE。相關研究3月5日發表于《自然—通訊》。據悉，生物島實驗室副研究員何江平為該論文第一作者，陳捷凱、Andrew Hutchin
Science：人腦單細胞基因表達地圖訴說驚人發現
人類大腦被稱為世上最復雜的物質，里面有860億錯綜復雜的、相互連接的神經元和數量同樣龐大的膠質細胞。 有史以來人們對這一神秘器官一直充滿好奇：它能生產浪漫的愛情詩歌，也能生產嚴謹的科學公式。由最初小小的胚胎和一點干細胞出發，成熟的大腦從何而來？ 根據今天發表的《Science》，加州大學舊金
基因是否表達：cfDNA全基因組測序可揭曉
《Nature Genetics》雜志上的研究表明，血循環游離DNA（cfDNA）可提供線索來預測基因的表達。 全基因組測序就能知道基因是否表達 基因表達(gene expression)是指細胞在生命過程中，把儲存在DNA順序中的遺傳信息經過轉錄和翻譯，最后轉變成具有生物活性的蛋白質分子的
對瘧原蟲的單細胞基因組測序
美國圣安東尼奧，2014年5月8日——美國德克薩斯生物醫學研究所的科研人員和他們的同事開發出了一種分離單個瘧原蟲細胞然后對其基因組測序的新方法。這一進展將讓科學家能夠改進他們識別病人感染的多種類型的瘧原蟲的能力，而且還可帶來最佳的經設計的藥物何疫苗以應對這種主要的全球性殺手。瘧疾仍然是全世界最致
單細胞基因表達分析解密血液早期發育調控網絡
近日，著名國際期刊nature biotechnology發表了英國科學家的一項最新研究成果，他們應用單細胞基因表達分析與計算方法描述了血液發育的轉錄調控網絡。這項研究為分析器官發育的調控網絡提供了一種可行的方法。 研究人員指出，重建調控器官發育的分子途經受限于缺少對胚胎祖細胞進行研究的方法，
單細胞基因表達譜揭示小腦細胞分化機制
盡管小腦（Cerebellum）體積僅為全腦的十分之一左右, 但其神經元數量大約占全腦的一半以上。近來研究表明，小腦不僅對運動的調節和維持有著重要作用，而且影響情緒、認知等高級功能。小腦發育異常和功能障礙與許多神經和精神疾病有關，例如共濟失調，震顫，自閉癥障礙和精神分裂癥等。了解疾病相關基因在小
單細胞基因表達分析的最新進展
將細胞培養板上的細胞放在顯微鏡下觀察。表面上，它們都一樣。實際上，它們一點都不相同。無論是DNA或RNA的水平，還是蛋白質或代謝物的水平，這些細胞相差甚遠，而這些差異可能對細胞行為產生深遠的影響。 多年來，研究人員一直缺乏工具，來高效拷問這些差異，不過今非昔比。有了新一代DNA測序儀和質譜儀，
基因是否表達，做個cfDNA全基因組測序就可揭曉
8月29日，《Nature Genetics》雜志上的研究表明，血循環游離DNA（cfDNA）可提供線索來預測基因的表達。 全基因組測序就能知道基因是否表達 基因表達(gene expression)是指細胞在生命過程中，把儲存在DNA順序中的遺傳信息經過轉錄和翻譯，最后轉變成具有生物活性的
單細胞測序需要準備什么再去測序
DNA測序的測序原理： DNA測序是指分析特定DNA片段的堿基序列，也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）與鳥嘌呤的（G）排列方式。快速的DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
Nature：單細胞測序（上）
Nicholas Navin所需要的就只是一個細胞――問題是如何得到它。這是在2010年，冷泉港實驗室的博士后研究員正在探究驅動乳腺癌的遺傳改變。此前的大部分癌癥基因組研究都是碾碎少量的腫瘤組織，一并將這些DNA進行測序，生成的是一張癌癥基因組的一致圖像。但Navin想要解析來自單個細胞的序
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。
單細胞測序方法匯總
單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題，而且-前沿的領域就是單細胞RNA測序了（scRNA-seq）。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序，并給出平均差異，但并沒有兩個細胞是完全一樣的，而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變，甚至這種技術還能夠闡明完整
Nature：單細胞測序（下）
隨著技術的飛速發展，成本大大降低，使得基因組測序成為常規技術。然而，大多數的人類基因組、癌癥或其他仍然是通過從多個細胞中抽提DNA來進行測序，它所忽略的細胞間的差異對于控制基因表達、細胞行為和藥物反應卻有可能是至關重要的。 該研究小組也觀測了其他類型的乳腺癌。將腫瘤作為一個整體測序，研究小
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
單細胞測序推進了基因組的發展領域
單細胞測序能夠幫助我們了解那些難以培養的微生物的基因組功能、了解遺傳鑲嵌功能在普通生物學功能或是疾病發生中的作用、腫瘤內在異質性對腫瘤發展以及耐藥性的影響、重新定義細胞亞型等等。 單細胞測序可以揭示出每個細胞獨特的微妙變化，甚至可以揭示全新的細胞類型，測序技術可謂是科技發展的一大創舉，它推進了基因
利用Ion半導體測序開展基因表達譜分析
???? 新一代測序技術的出現改變了基因表達譜分析和轉錄組研究。在其他方法還依賴預知信息進行雜交探針或qPCR引物設計時，RNA-Seq技術可直接對測序文庫中任一RNA分子進行無假設的分析。RNA-Seq技術不單能測定轉錄本數，研究表達水平差異 [1]，還能檢測序列特異的信息，如轉錄本的起始和終止位
首次揭示單細胞水平大豆根瘤基因表達的動態特征
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500742.shtm近日，中國農業科學院作物科學研究所大豆優異基因資源發掘與創新利用創新團隊與國內高校合作，首次在單細胞水平解析了大豆根瘤成熟過程中基因表達的動態變化，并在未成熟的根瘤侵染細胞中成功鑒定到
Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序
2018年11月，Namocell與CZ-Biohub（Chan Zuckerburg Biohub）合作，在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞，并且將其進行單細胞測序，為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序（scRNA-s
廣州生物院開發出單細胞測序分析轉座元件表達的工具包
3月5日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究員研究院陳捷凱課題組與南方科技大學研究員Andrew Hutchins課題組合作，開發出單細胞測序分析轉座元件表達的工具包scTE。相關研究成果以Identifying transposable element expression dynamics a
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。