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  • 天然RNA文庫篩選與蛋白特異性結合的RNA序列實驗

    實驗方法原理 細胞中,蛋白質與 RNA 結合參與多種生理調控和發育過程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外運,翻譯起始及降解等過程中都存在著蛋白質與 RNA 的直接相互作用。在發育的各個階段,RNA 結合蛋白可以通過與 mRNA 的相互作用調控基因的表達。實驗材料 mRNA寡核苷酸試劑、試劑盒 工具酶二硫蘇糖醇無核酸酶去離子水乙酸鉀PCI 溶液NT2 緩沖液KNET 緩沖液儀器、耗材 微離心管及加樣器吸頭Sephadex G-50 柱實驗步驟 一、材料與設備1. mRNA(購自 Clontech 公司,也可自行純化獲取)。2. 工具酶:Superscript Ⅱ 反轉錄酶和緩沖液(Life Technologies 公司),E.coli RNase H(Life Technologies 公司),未端脫氧核糖核酸轉移酶(Td Tase)和緩沖液(Life Technologies 公司),RNasin R......閱讀全文

    DNA和RNA靶序列的原位PCR擴增實驗

    實驗材料 樣品試劑、試劑盒 雙氧水PBS蛋白酶KRNA酶DTTdNTPKClMgCl2Tris·Cl儀器、耗材 加濕盒熱循環儀實驗步驟 1. ?將載有固定樣品的載玻片置105℃加熱塊上5~120 s。?2. ?載玻片放入含0.3%H2O2中,于37℃或室溫溫育過夜,以滅活內源性過氧化物酶活性,然后以

    DNA和RNA靶序列的原位PCR擴增實驗

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    天然RNA文庫篩選與蛋白特異性結合的RNA序列實驗

    細胞中,蛋白質與 RNA 結合參與多種生理調控和發育過程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外運,翻譯起始及降解等過程中都存在著蛋白質與 RNA 的直接相互作用。在發育的各個階段,RNA 結合蛋白可以通過與 mRNA 的相互作用調控基因的表達。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛

    天然RNA文庫篩選與蛋白特異性結合的RNA序列實驗

    ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 細胞中,蛋白質與 RNA 結合參與多種生理調控和發育過程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外運,翻譯起始及降解等過程中都存在著蛋白質與 RNA 的直接相互作用。在發育的各個階段,RNA 結合蛋白可以通過與 m

    天然RNA文庫篩選與蛋白特異性結合的RNA序列實驗

    實驗方法原理 細胞中,蛋白質與 RNA 結合參與多種生理調控和發育過程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外運,翻譯起始及降解等過程中都存在著蛋白質與 RNA 的直接相互作用。在發育的各個階段,RNA 結合蛋白可以通過與 mRNA 的相互作用調控基因的表達。實驗材料 mRNA寡核苷酸試劑、

    核酸序列分析實驗

    實驗方法原理針對核酸序列的分析就是在核酸序列中尋找基因,找出基因的位置和功能位點的位置,以及標記已知的序列模式等過程。在此過程中,確認一段 DNA 序列是一個基因需要有多個證據的支持。一般而言,在重復片段頻繁出現的區域里,基因編碼區和調控區不太可能出現;如果某段 DNA 片段的假想產物與某個已知的蛋

    核酸序列的檢索實驗

    實驗方法原理掌握核酸序列檢索的操作方法;熟悉GenBank數據庫序列格式及其主要字段的含義;了解EMBL數據庫序列格式及其主要字段的含義;熟悉GenBank數據庫序列格式的FASTA序列格式顯示與保存;實驗材料電腦儀器、耗材筆記本筆實驗步驟1. ?使用Entrez信息查詢系統檢索核酸序列BC0608

    RNA干涉實驗

    RNA 干涉(RNA1) 是指在真核細胞中引入雙鏈 RNA ( doubt-stranded RNA,dsRNA ) 分子從而導致具有序列同源性的基因產生特異件基內沉默(gene silencing ) 的現象。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理當確定了靶基因上的 siRN

    純化RNA實驗

    從培養的細胞中純化總RNA 從組織中純化總RNA ? ? ? ? ? ? 實驗材料 細胞

    RNA干涉實驗

    實驗方法原理 當確定了靶基因上的 siRNA 分子作用位點以后,根據靶位點的序列可以很方便地推導得到相應的 siRNA 分子的正義與反義 RNA 鏈序列。它們包含 19 bp 的互補雙鏈區和兩側的不配對區(每側為 2 個 U 成 2 個 T ),在合成時用 T 替代 U 可以降低成本并可以提

    RNA干涉實驗

    化學合成siRNA分子實驗 體外轉錄合成siRNA分子實驗 采用RNA聚合酶Ⅲ啟動子表達siRNA分子 采用RNaseⅢ制備siRNA分子實驗 ? ? ? ? ? ? 實驗方法

    隨機序列庫的純化實驗

    實驗方法原理 實驗材料 DNA 庫試劑、試劑盒 氫氧化銨正丁醇TE 緩沖液 尿素上樣緩沖液NaCl 乙醇儀器、耗材 熒光薄層層析板(VWR)紫外燈剃刀刀片小孔注射器能耐受極端溫度的 13 ml 離心管(Sarstedt) 90℃水浴旋轉混合器實驗步驟 實驗所需「材料」、「試劑」、「耗材」具體見「其他

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    實驗方法原理實驗材料DNA 庫試劑、試劑盒氫氧化銨正丁醇TE 緩沖液尿素上樣緩沖液NaCl乙醇儀器、耗材熒光薄層層析板(VWR)紫外燈剃刀刀片小孔注射器能耐受極端溫度的 13 ml 離心管(Sarstedt)90℃水浴旋轉混合器實驗步驟實驗所需「材料」、「試劑」、「耗材」具體見「其他」1. 寡核苷酸

    隨機序列庫的純化實驗

    ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 實驗材料 DNA 庫 試劑、試劑盒 氫氧化銨

    氨基酸序列測定實驗

    實驗方法原理 實驗材料 分離膠和積層膠溶液還原型谷胱甘肽干粉試劑、試劑盒 4 × 凝膠緩沖液10 × 下槽緩沖液10 × 上槽緩沖液甲醇轉移緩沖液0.1%(V/V)考馬斯亮藍的 50%甲醇溶液10%(V/V)乙酸的 50%甲醇溶液儀器、耗材 微量注射器或凝膠加樣吸頭PVDF 膜小型電轉裝置自動蛋白質

    氨基酸序列測定實驗

    基本方案 測定通過 SDS-PAGE 轉移到 PVDF 膜上樣品的氨基酸序列 輔助方案 準備SDS-PAGE蛋白質樣品 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理

    RNA分離與分析實驗_分離RNA

    實驗材料標記細胞試劑、試劑盒乙酸緩沖液儀器、耗材漩渦器實驗步驟1. 收獲標記細胞。2. 小心處置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸緩沖液懸浮細胞沉淀,每 1 ml 壓積細胞用 10 ml 緩沖液。3. 于室溫用漩渦器振蕩裂解細胞。4. 加等體積的水飽和酚,充分混勻,于 60

    RNA干擾主體實驗

    siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準

    RNA實驗方法

    Solublization of RNA in Formamidecontributed by James McCaughern-Carucci, Yale UniversityResuspending RNA in Formamide (as reported by Chomczynski et

    動物RNA提取實驗

    實驗方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 總RNA 純化系統)可在1小時內從組織、培養細胞和白細胞中提取純化完整總RNA,方法簡單、快速。該系統以膜為基礎,根據組織類型的不同,每次最多可純化60 mg 組織。系統包含DNase 處理步驟,直接在小離

    RNA干擾回復實驗

    RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce

    病毒RNA提取實驗

    實驗方法原理 大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。實驗材料 TMV病毒液試劑、試劑盒 TE-飽和酚:氯仿氯仿NaAc乙醇TE緩沖液雙菌水儀器、耗材 冷凍臺式離心機低溫真空干燥儀電泳儀電泳槽實驗步驟 一、實驗

    病毒RNA提取實驗

    病毒RNA提取可以:(1)用于RNA病毒復制機制研究;(2)用于反向遺傳學研究;(3)用于分子病毒學其他研究。實驗方法原理大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。實驗材料TMV病毒液試劑、試劑盒TE-飽和酚:氯

    動物RNA提取實驗

    SV總RNA試劑盒提取法 Trizol試劑提取法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 總RNA

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    RNA干擾回復實驗

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    細菌RNA制備實驗

    革蘭氏陰性細菌中提取 革蘭氏陽性細菌中提取 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 RNA 試

    真菌RNA提取實驗

    液氮研磨法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚

    細菌RNA制備實驗

    實驗材料 RNA試劑、試劑盒 STET氯仿乙酸鈉氯化銫無水乙醇EDTA儀器、耗材 離心機分光光度計搖床實驗步驟 1. ?培養100 ml 大腸桿菌或500 ml 藍細菌至對數生長期,加入1/20體積終止緩沖液,置于冰上。2. ?于4℃用JA-10轉子17 700 g 離心5 min 收集細胞。3.

    真菌RNA提取實驗

    真菌RNA的提取可以:(1)用于真菌RNA干擾機制研究;(2)用于cDNA文庫構建等研究;(3)用于真菌分子生物學相應研究。實驗方法原理液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA進入水相,離心后可形成

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