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    質譜和蛋白質組學:擊中目標

    Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者:Nathan Blow 分析測試百科 譯 近年來,質譜儀大幅提高了動態范圍和靈敏度,使研究者們在疾病生物標志物的發現和驗證方面,更從容地面對挑戰。 在2008年6月的美國質譜大會(ASMS)上,用于鑒定蛋白質生物標志物(指示了疾病或疾病狀態的蛋白質)的質譜儀,成為了在質譜制造廠商中反復出現的一個主題。 Waters公司(美國,馬薩諸塞州,Milford)推出了一款名為Xevo TQ MS的三重四極桿質譜儀,及其相應的軟件包,兩者都是為推動生物標志物從發現階段到目標蛋白的驗證階段而設計的。安捷倫科技(美國,加州,Foster市)推出了新的6400系列的三重四極桿液質聯用儀,并......閱讀全文

    蛋白質組最新研究進展

      蛋白質組(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一個基因組,或一個細胞、組織表達的所有蛋白質。 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別,它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變。 在轉錄時,一個基因可以多種mRNA形式剪接,一個蛋白質組不是一個基因組的直接產物,蛋白質組中蛋

    第六屆世界華人質譜會在美舉辦 共享質譜學術盛宴

      分析測試百科網訊 2016年6月4日,第六屆世界華人質譜會在美國德克薩斯州圣安東尼奧舉行,這是自第一屆世界華人質譜會以來第一次在海外舉辦的華人質譜會,并恰逢距2006年在新疆舉辦的第一屆世界華人質譜會10周年。會議由美國華人質譜協會(C

    SWATH為全球科學界提供蛋白質組學研究的突破性技術

    SWATH?采集模式為全世界科學界提供蛋白質組學研究的突破性技術  在TripleTOF? 5600系統上運行非數據依賴的SWATH?采集模式,能夠進行全面、完整的蛋白質定量,相關成果發表在《分子與細

    近期《自然》期刊系列中發揮關鍵作用的賽默飛質譜儀

       【導語】在2011年10-11月期間,在一級科學刊物Nature和Nature Methods上有14篇科研論文使用賽默飛世爾LTQ-Orbitrap或TSQ質譜儀產生數據,聚焦的主題包括:目標物發現與定量研究,Top-down蛋白質組研究繪制蛋白質異構體,同位素標簽方法的精度,提高糖蛋白質組

    Aebersold研究組發布用于全蛋白質組的高通量定量方法

      瑞士蘇黎世聯邦理工學院的研究人員領導的一個研究小組,已制定了一個質譜工作流,用于對整個蛋白質組進行高通量的絕對定量。  據ETH的研究者、該研究的領頭人Ruedi Aebersold說,對于多種形態,該技術實現了目標蛋白質組的重現性定量,提供用于

    Orbitrap Exploris 480:豐富的定量流程介紹(二)

    平行反應監控(Parallel Reaction Monitoring, PRM)是Orbitrap系列儀器上的高分辨靶向定量方法,類似于三重四極桿質譜上的選擇反應監控(Selected Reaction Monitoring, SRM),其是進行潛在標志物驗證的金標準方法之一。 但是PRM

    Cell雜志最受關注十篇文章(10月)

      Cell創刊于1974年,現已成為世界自然科學研究領域最著名的期刊之一,并陸續發行了十幾種姊妹刊,在各自專業領域里均占據著舉足輕重的地位。Cell以發表具有重要意義的原創性科研報告為主,許多生命科學領域最重要的發現都發表在Cell上。本月《Cell》前十名下載論文為:  Hallmarks of

    Cell雜志最受關注十篇文章

      Cell創刊于1974年,現已成為世界自然科學研究領域最著名的期刊之一,并陸續發行了十幾種姊妹刊,在各自專業領域里均占據著舉足輕重的地位。Cell以發表具有重要意義的原創性科研報告為主,許多生命科學領域最重要的發現都發表在Cell上。本月《Cell》前十名下載論文為:  Hallmarks of

    Cell雜志最受關注十篇文章:穩居年榜首的是哪篇文章?

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    一小時DDA鑒定DIA定量4000個Hela蛋白(二)

    Skyline 中嵌入的 mProphet 軟件會根據同一肽段的多個子離子峰的 feature 進行打分。 Feature 包括子離子共流出峰形、保留時間偏差、 dotp 值、信噪比等。為了區分假陽性的子離子峰, mProphet 可以建立 decoy 庫,也可以將打分排名第二的肽段作為decoy,

    一小時 DDA 鑒定 DIA 定量 4000 個 Hela 蛋白(二)

    500 ng Hela 細胞裂解液用相同的色譜柱,相同的色譜梯度,將 QE HF 切換至 DIA 掃描模式進行 3 次 DIA 數據采集。在一次掃描循環中,目標母離子質核比范圍 400–1000,四極桿的隔離窗口為 12 Da,包含 50 次 MS/MS 掃描。每一張 MS/MS 譜圖中

    HUPO見聞:SWATH對DDA將產生巨大沖擊

          近一段時間,一直不斷有Mann的新技術出現,THERMO的儀器基本上都是Mann首先發出的文章;而Aebersold自從回到瑞士以后在技術方面出的東西不多,今年ASMS質譜年會發

    QTRAP代表文獻回顧

     生物分子發表的代表性文獻 QTRAP:同時具有三重四極桿和線性離子阱性能的獨一無二的LC/MS/MS系統       QTRAP系統最早在ASMS 2002上,作為第一臺商用的線性離子阱發布,是世界上唯一的線性離子阱和三重四極桿的復合

    Cell雜志最受關注十篇文章:穩居一年榜首的是哪篇文章

      腫瘤異質性是指不同患者腫瘤之間和同一個腫瘤內不同細胞之間的差異。這種異質性的存在會影響對癌癥患者的診斷、治療和預后。為了解釋腫瘤的異質性科學家已提出了不同的機制,如上皮間質轉化(EMT),在該過程中上皮腫瘤細胞失去黏附力,并獲得間充質細胞的遷移特性,該過程與腫瘤轉移和耐藥性相關。為何有些腫瘤會發

    創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質...(三)

    對10 條肽段的分析結果匯總(表1),結果表明,3 種DIA 方法在fg ~ pg 數量級肽段范圍內均顯示出良好的線性、重現性和靈敏度。3 種方法的最低定量限均達到amol 級,其中肽段GEEMEEMVQSAR在DIA 中最低定量限達14 amol,超越了常規SRM 和PRM 的定量水平。比

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