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    Nature:掌上測序儀表現令人驚艷

    今年四月份,伯明翰大學的Joshua Quick在行李中裝了三個測序儀(MinION)然后登上了去幾內亞的飛機。這在過去是難以想象的,因為絕大多數測序儀又大又重。在幾內亞,Quick只用12天就測序了14名埃博拉患者的病毒基因組,收集樣本之后48小時就能得到結果。 這對于流行病學家來說,是一個前所未有的機遇。研究者們已經在幾內亞的治療中心建立了一個專門的MinION實驗室,用這種測序儀分析患者的DNA,追溯病毒感染的源頭。“這是測序的民主化,”Quick說。“我們不再依賴于昂貴的設施和儀器。” MinION是英國Oxford Nanopore Technologies公司推出的一種掌上測序儀,方便攜帶也很便宜。它能讀取較長的基因片段,這有助于理解基因組的復雜區域。MinION還可以插入筆記本電腦的USB接口,在屏幕上顯示數據生成的過程。 Oxford Nanopore Technologies公司去年春天啟動了MinI......閱讀全文

    MinION測序儀再次開放試用

      英國Oxford Nanopore Technologies公司近日宣布,它重新開放了MinION測序儀的早期試用計劃,希望吸納更多用戶來參與。同時,越來越多的計劃參與者開始展示和發表他們的結果。  在上周舉行的AGBT 2015大會上,英國基因組分析中心和美國冷泉港實驗室的研究人員就介紹了利用

    MinION測序儀有望在極端環境中檢查人類疾病

      MinION測序儀登上太空,科學家們不是為了證明基因測序的飛速發展,而是想利用其來幫助人類在極端環境中診斷疾病。  對于該試驗,Rubins宇航員有自己的一些期望,她說,"目前,我們不能實時分析太空中發生在人類以及細胞中的事情。我們的空間站擁有一個具有15年歷史的干凈水源,但是這些水源是否存在微

    Nature:掌上測序儀表現令人驚艷

      今年四月份,伯明翰大學的Joshua Quick在行李中裝了三個測序儀(MinION)然后登上了去幾內亞的飛機。這在過去是難以想象的,因為絕大多數測序儀又大又重。在幾內亞,Quick只用12天就測序了14名埃博拉患者的病毒基因組,收集樣本之后48小時就能得到結果。  這對于流行病學家來說,是一個

    Nature:實時、便攜式基因組測序

      埃博拉病毒(EBOV)感染人類會引起致命的出血熱,發病率和病死率極高。2014年這種病毒在西非造成了嚴重的疫情,死亡人數已經超過11,000人。今年一月份,就在人們以為這場疫情正式結束之際,塞拉利昂又出現了新的病例。  本期Nature雜志發表的一項新研究展示了便攜式基因組測序儀在這次疫情中起到

    基因測序儀

    原理編輯abi prism 310型基因分析儀采用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳,應用該公司專利的四色熒光染料標記的ddntp(標記終止物法),因此通過單引物pcr測序反應,DNA測序儀生成的pcr產物則是相差1個堿基的3''''末端為4種不同熒光染料

    全面解讀第四代測序技術

    納米孔測序技術(又稱第四代測序技術)是最近幾年興起的新一代測序技術。目前測序長度可以達到150kb。這項技術開始于90年代,經歷了三個主要的技術革新:一、單分子DNA從納米孔通過;二、納米孔上的酶對于測序分子在單核苷酸精度的控制;三、單核苷酸的測序精度控制。目前市場上廣泛接受的納米孔測序平臺是Oxf

    U盤大小的DNA測序儀證實可用于檢測病原體

      由華大基因和生物醫學中心(BioMed Central)聯合創辦的大數據期刊《GigaScience》3月26日報道了掌上手持型DNA測序儀的最新成果,這種測序儀可以在短短6個小時時間里區分細菌和病毒的種類。  去年,由英國Oxford Nanopore公司開發的,僅4英寸長、普通U盤大小Min

    測序簡史(四)

    三、三代全長轉錄本分析工具三代全長轉錄本在輔助基因注釋,可變剪接分析,融合基因檢測方面可以說大顯身手,下面小編列了幾個工具及對應的下載地址,供大家參考。大家有好的最新的工具歡迎留言補充!1. 可變剪接鑒定(3個工具)1)網址:https://github.com/liuxiaoxian/IsoSeq

    掌上測序儀新玩法:空氣微生物實時測

    近日,英國基因組分析中心(TGAC)的研究團隊分享了利用MinION掌上測序儀,進行創造性研究。作為MinION首批試用者,TGAC摒棄以往需要把樣本帶回實驗室的做法,使用了微型測序設備對環境中成百上千種不同生物樣本進行現場物研究,以便研究人員能夠對實驗基因數據進行實時分析。   該研究的目標是

    Nature子刊首次展示掌上測序儀的巨大潛力

      納米孔測序也被稱為第三代測序,而Oxford Nanopore公司則是這一領域的先行者。去年11月,該公司啟動了掌上測序儀MinION的早期試用計劃。這個備受關注的測序儀只有USB大小,可以實現即插即用。   East Anglia大學和Public Health England的研究團隊十

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