復旦權威期刊發表乳腺癌新成果
乳腺癌是女性中最常見、也最嚴重的惡性腫瘤之一。40-60歲之間、絕經期前后的婦女發病率較高，僅約1-2%的乳腺患者是男性。這種惡性腫瘤通常發生在乳腺上皮組織，會嚴重影響女性的身心健康乃至危及生命。三陰乳腺癌是乳腺癌中最兇險的一種，大約占乳腺癌的16%。 復旦大學附屬腫瘤醫院的研究團隊對三陰乳腺癌進行了轉錄組分析，揭示了一個綜合性的mRNA-lncRNA預后指標。這項研究于二月二十九日發表在十大腫瘤學期刊之一的Cancer Research雜志上，文章的通訊作者是復旦大學附屬腫瘤醫院的邵志敏教授。 邵志敏教授的研究團隊希望為TNBC患者開發RNA指標，以便更好的評估癌癥風險，選擇更合適的輔助療法。他們通過轉錄組芯片對TNBC和正常乳腺組織進行了分析，鑒定了與乳腺癌復發有關的腫瘤特異性mRNA和長非編碼（lncRNA）。 研究人員在此基礎上開發了一個mRNA-lncRNA綜合指標，mRNA包括FCGR1A、RSAD2和 C......閱讀全文
Arraystar－lncRNA芯片應用于乳腺癌研究
德克薩斯大學安德森癌癥中心的華人學者楊柳青博士主要從事腫瘤轉移及信號傳導方面的基礎研究。近期，楊柳青博士應用美國Arraystar公司的lncRNA芯片分析了乳腺癌組織的長鏈非編碼RNA（lncRNA）表達情況，并且發現部分lncRNA可以直接和脂質（磷脂酰肌醇三磷酸PIP3、卵磷脂PC等）發生相互
Nature子刊：Arraystar－lncRNA芯片應用于乳腺癌研究
德克薩斯大學安德森癌癥中心的華人學者楊柳青博士主要從事腫瘤轉移及信號傳導方面的基礎研究。近期，楊柳青博士應用美國Arraystar公司的lncRNA芯片分析了乳腺癌組織的長鏈非編碼RNA（lncRNA）表達情況，并且發現部分lncRNA可以直接和脂質（磷脂酰肌醇三磷酸PIP3、卵磷脂PC等）發
外泌體LncRNA幫助免疫細胞“叛變”乳腺癌惡化新機制
外泌體是細胞間傳遞信號的媒介，直徑在30-200nm，表面具有磷脂雙分子層，內部具有豐富內含物的小囊泡，其內含物包括miRNA，環狀RNA，LncRNA和mRNA等。以不久前發表于Nature Cell Biology（影響因子：19）的文章為例，看一看外泌體中LncRNA的功能機制是如何研究的。
外泌體LncRNA幫助免疫細胞“叛變”乳腺癌惡化新機制！
文章導讀： 外泌體是細胞間傳遞信號的媒介，直徑在30-200nm，表面具有磷脂雙分子層，內部具有豐富內含物的小囊泡，其內含物包括miRNA，環狀RNA，LncRNA和mRNA等。以不久前發表于Nature Cell Biology（影響因子：19）的文章為例，看一看外泌體中LncRNA的功
髓系特異性lncRNA調節乳腺癌細胞的有氧糖酵解
有氧糖酵解，也稱為Warburg效應，是癌細胞葡萄糖代謝的一個普遍特征，因為葡萄糖主要被加工成乳酸。盡管有氧糖酵解在ATP生成中的效率較低，但有氧糖酵解能增加生物合成，抑制細胞凋亡，產生信號代謝物，從而提高癌細胞的存活率。有趣的是，在各種惡性腫瘤中，包括非小細胞肺癌和乳腺癌，固體腫瘤不同區域葡
外泌體LncRNA幫助免疫細胞“叛變”——乳腺癌惡化新機制－2
5.腫瘤缺氧微環境中乳酸在TAM中上調LncRNA通過生信軟件預測LncRNA HISLA基因啟動子區域與轉錄因子PU.1有典型結合位點。接著，借助ChIP qPCR實驗證實兩者是直接結合的。作者又發現LncRNA HISLA在TAM中的表達量遠高于其他巨噬細胞MDM，已有研究表明MDM“策
外泌體LncRNA幫助免疫細胞“叛變”——乳腺癌惡化新機制－1
文章導讀：外泌體是細胞間傳遞信號的媒介，直徑在30-200nm，表面具有磷脂雙分子層，內部具有豐富內含物的小囊泡，其內含物包括miRNA，環狀RNA，LncRNA和mRNA等。以不久前發表于Nature Cell Biology（影響因子：19）的文章為例，看一看外泌體中LncRNA的功能機制是如何
調控免疫的lncRNA
當過度活化或脫靶時，免疫系統中正常對抗感染的一些細胞會轉而攻擊個體自身的組織。這一過程會推動作為自身免疫性疾病組成部分的炎癥。現在，來自紐約大學Langone醫學中心的一項新研究揭示出了抑制這些機制的一種新方法，有可能會影響未來的藥物設計。相關論文 ? ?發布在12月16日的《自然》（Natur
lncRNA功能機制研究（二）
實驗路線（1）LINC00346調控胃癌發展的上游機制結果：轉錄因子KLF5和MYC可與LINC00346啟動子結合，并增強其表達a. 轉錄因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析；b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的轉錄因子
lncRNA研究策略與技術
研究背景：長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一類不編碼蛋白的RNA分子，長度在200 bp以上，起初被認為是RNA聚合酶II轉錄的副產物，不具有生物學功能；近期的研究表明lncRNA具有保守的二級結構，可以與蛋白、DNA和RNA相互作用，參與多種生物學過程的調控
lncRNA功能機制研究（一）
文章導讀LncRNA是長度大于200nt的長鏈非編碼RNA，在調控不同的分子過程中發揮著重要作用。其主要功能不僅可以與功能蛋白結合，并在轉錄或轉錄后水平調控基因表達，而且lncRNA也可以作為誘餌，吸附miRNA，調節miRNA調控的靶基因表達。但是，目前關于lncRNA在胃癌中的表達譜和生物學功能
中美學者JBC解析lncRNA在EMT中的作用
長非編碼RNA（lncRNA）正成為各種生物學過程的一個關鍵調控因子，然而，lncRNA在上皮間質轉化（EMT）中所起的作用，尚不明確。2015年1月20日，美國H. Lee Moffitt癌癥中心和浙江腫瘤醫院的研究人員，在《Journal of Biological Chemistry》發表
【盤點】長鏈非編碼RNA的研究進展
非編碼RNA在生命調控過程中扮演著重要角色，近年來的研究成果常入選CNS年度十大科學突破。人類基因組轉錄區高達76％，但轉錄產物中只有不到2％是編碼蛋白質的mRNA，其他均為非編碼RNA，其中microRNA (miRNA)、長鏈非編碼RNA(lncRNA)、環狀RNA（circRNA）等調控
eLife：lncRNA調控癌癥關鍵基因
Salk研究所的科學家們發現，一種長非編碼RNA(lncRNA)是癌癥發展過程中的一個關鍵基因開關。這項研究于四月二十九日發表在eLife雜志上，為相關癌癥的治療提供了一條新的途徑。 研究人員將這種lncRNA命名為PACER(p50-associated COX-2 extragenic
lncRNA甲基化如何研究？
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能，這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能輕松的變廢為寶，竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章，你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化，作為最新的國自然熱點受到
lncRNA助力葉酸研究新成果
LncRNA研究發表的成果五花八門，然而借助于lncRNA芯片，挖掘其中的高通量數據，發表5分影響因子的文章，還是可行的。本研究是以葉酸處理肥胖模型為基礎，讓我們來看看到底怎么樣就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》（IF=5.104）上發表。研究背
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。 一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。 1. Genebank：https://www.ncb
如何快速查找LncRNA序列？
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。?Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov
lncRNA表達與RNA的延伸
LncRNA的火熱研究已經有幾年的時間了，關于lncRNA總歸是有說不完的話題。目前對lncRNA的基礎分析都已形成了一定的模式。然后，今年來lncRNA的相關文章依然如雨后春筍。 長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RN
lncRNA的概念及形成過程
?lncRNA，即Long non-coding RNA，你可以把它理解為不表達蛋白的mRNA。它的很多特征與mRNA很類似。比如，它與mRNA一樣有啟動子、有polyA尾巴、有不同剪接、有動態表達水平。除了不表達蛋白這一點以外，僅從核苷酸水平上來看，可以說它與mRNA并無實質分別。所以對于設計PC
復旦權威期刊發表乳腺癌新成果
乳腺癌是女性中最常見、也最嚴重的惡性腫瘤之一。40-60歲之間、絕經期前后的婦女發病率較高，僅約1-2%的乳腺患者是男性。這種惡性腫瘤通常發生在乳腺上皮組織，會嚴重影響女性的身心健康乃至危及生命。三陰乳腺癌是乳腺癌中最兇險的一種，大約占乳腺癌的16%。 復旦大學附屬腫瘤醫院的研究團隊對三陰乳腺
華人學者Nature子刊揭示三陰性乳腺癌治療靶點
在癌癥中，一些細胞信號通路是能夠阻礙或加速疾病進展的一連串關鍵事件。由德克薩斯大學MD安德森癌癥中心的科學家們領導的一項多機構國際研究，揭示出了有關長鏈非編碼RNAs(lncRNA)與在許多癌癥中過度表達的一種信號通路HIF-1之間如何互作的新信息。 這項在線發表于《自然細胞生物學》（Natu
Genome－Biology：上海交大解析阿司匹林的抗結直腸癌機制
癌癥化學預防指利用天然或合成的化學物質來阻止、逆轉、減緩癌癥的發生發展過程。雖然阿司匹林的化學預防效果已經被廣泛研究，但人們還不完全清楚細胞組分在其中起到的作用，比如長非編碼RNA（lncRNA）。lncRNA是長達兩百個核苷酸以上的轉錄本，絕大多數位于細胞核內。 上海交大醫學院的研究團隊發現
Nature重要發現：調控免疫的lncRNA
當過度活化或脫靶時，免疫系統中正常對抗感染的一些細胞會轉而攻擊個體自身的組織。這一過 程會推動作為自身免疫性疾病組成部分的炎癥。現在，來自紐約大學Langone醫學中心的一項新研究揭示出了抑制這些機制的一種新方法，有可能會影響未來 的藥物設計。相關論文發布在12月16日的《自然》（Nature）
LncRNA芯片應用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范圍內，每年因肝癌死亡的病例超過50萬人，是主要的致死惡性腫瘤之一。在過去的十年中，隨著影像學的進步以及健康體檢的普及，越來越多的肝癌病人在患病早期被發現。但由于肝臟捐贈者的短缺，外科肝臟切除術仍然是治療早期肝癌病人的最主要方法。目前對于術后患者缺乏準確
國際知名學者綜述：LncRNA分類
美國St. Laurent Institute的Philipp Kapranov教授，是基因組學與系統生物學領域具有重要國際影響的專家，長期從事系統生物學和基因組功能方面的研究，其發現人類基因組能夠產生大量的有功能作用的非編碼RNA，在概念層次上重新定義了“基因”，這一發現被Science選為最
LncRNA芯片應用于胃癌研究
上海交通大學附屬仁濟醫院房靜遠教授主要從事消化系統腫瘤發生的分子機制、早期診斷和分子治療等相關研究。近期，該課題組應用美國Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌組織的lncRNAs表達情況，篩選到可預測胃癌發生的分子標志物GClnc1，并且闡明了GClnc1在胃癌的發生和發展中是如何發揮
Cell重要發現：調控免疫的lncRNA
由麻省大學醫學院Katherine A. Fitzgerald領導的研究小組證實，一種長鏈非編碼RNA lincRNA-EPS發揮轉錄剎車作用限制了炎癥。這一重要的研究發現發布在6月16日的《細胞》（Cell）雜志上。 細胞類型特異性的調控回路以復雜、動態和短暫調節的方式控制著基因表達。了解這
Science子刊專題：癌癥中的非編碼RNA
非編碼RNA（尤其是microRNA）是眾多細胞過程的關鍵調控子，與發育和癌癥進程密切相關。本期Science Signaling雜志通過專題“Noncoding RNAs in cancer”，介紹了這類分子的生理和病理學功能。 發現哺乳動物基因組中的非編碼RNA，不僅揭示了一類新的生物學調
Cancer－Cell：隱藏在“垃圾DNA”中的癌基因
科學家們一直致力于在基因組中尋找與癌癥有關的遺傳學改變。在此基礎上，人們對癌癥的理解以及癌癥治療都取得了巨大的進展。 這類研究大多關注基因組的編碼區域，但這一區域只占到人類DNA的2%，應該還有大量癌癥相關突變發生在非編碼DNA上。非編碼DNA曾被稱為“垃圾DNA”，雖然人們早已知道它們其實并