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  • 張啟發院士Nature子刊發表水稻基因組成果

    9月13日,在Nature旗下的開放獲取雜志《Scientific Data》發表的一項研究中,來自華中農業大學和美國亞利桑那州大學的研究人員,用PacBio的long read測序數據和Illumina雙末端測序數據,構建了兩個秈稻參考基因組。 我國著名的植物遺傳和分子生物學家,華中農業大學作物遺傳改良重點實驗室主任張啟發院 士,以及亞利桑那大學的Rod A. Wing教授是這篇論文的共同通訊作者。張啟發院士課題組長期致力于水稻基因組研究,旨在通過植物基因組分析、重要基因的分離克隆、雜種優勢的遺傳和分子 基礎、作物品種資源的分子評估及應用分子生物學技術進行水稻改良。Rod Wing博士是基因組學研究領域的國際知名專家,目前為亞利桑那大學教授,亞利桑那大學基因組研究所所長,近十幾年來共發表論文100多篇,參編專著7 部。Rod Wing教授領導的亞利桑那大學基因組研究所是國際聞名的基因組研究機構,在BAC文庫構建、末端測序......閱讀全文

    我國完成世界首張-西瓜基因組序列圖譜

      由北京市農林科學院蔬菜平臺牽頭,聯合了中國農業科學院、深圳華大基因科技有限公司、美國康奈爾大學、荷蘭瑞克斯旺等優勢單位,共同完成了世界首張西瓜基因組序列圖譜繪制與破譯,獲得了高質量的西瓜基因組序列圖譜,成為由中國主導完成的世界第一張西瓜基因組序列

    我國完成世界首張西瓜基因組序列圖譜

      我國主導完成世界首張西瓜基因組序列圖譜的繪制與破譯,相關研究成果于北京時間11月26日凌晨在國際學術頂級刊物《自然·遺傳學》上在線發表。   西瓜是全球重要的經濟作物和夏季消暑水果,但就是這樣一種常見的水果,人們卻始終未能從內到外了解它。過去,各國科學家雖然知道栽培西瓜遺傳多樣性狹窄是制約西瓜

    所有開花植物同類的基因組秘密

      一個無油樟花。   據科學家們報告,代表最古老開花植物世系——一種有著乳白色花的小灌木——的單一物種的基因組序列終于被找到了,這讓人們對開花植物是如何演化的提供了關鍵性的見解。研究當今地球上植物多樣化的進化生物學家對無油樟(Amborella trichopoda)——該植物代表了被子植物

    首個蕨類植物基因組測序完成

    蕨類植物是地球上最多樣化的植物種群之一,也是僅有的沒有完成基因組測序的主要植物種群。2018年7月18日,美國康奈爾大學研究人員在《自然-植物》期刊上發表了其完成蕨類植物基因組測序的結果。 蕨類植物的基因組較大,可以擁有多達720對染色體,包含多達1480億個堿基對的DNA序列(Gb)。相比之

    植物所等破譯構樹基因組

      構樹(Broussonetia papyrifera)又稱紙皮樹、肥豬樹,為桑科構屬多年生闊葉喬木,自然分布于我國大部分地區和東南亞,是一種典型的鄉土樹種和先鋒植物。構樹雌雄異株,種子數量多,易繁殖,生長快,表型性狀和遺傳多樣性豐富,基因組緊湊,可作木本植物研究的模式材料。同時,構樹有著悠久的開

    利用CTAB法提取植物基因組DNA

    一、實驗原理 CTAB(十六烷基三甲基溴化銨)是一種去污劑,可溶解細胞膜并能與核酸形成復合物,該復合物在高離子強度(0.7mol/L)的溶液里是可溶的,通過離心可將復合物同蛋白質、多糖類物質分開。在酚仿變性的條件下,去除殘留的CTAB和蛋白質等雜質,然后利用異戊醇或無水乙醇將DNA分

    新型發酵罐設計啟發

    新型發酵罐設計啟發  這種新型發酵罐解決了氣升式內環流反應器的缺乏,或許可以帶給我新鮮的啟發。如果上圖單一使用球形分布器,則培養基的高度很難以控制,降低了效率。為了克服這些缺點,上圖采用機械消泡而不用消泡劑,并進行部分改進,使之具有容納泡沫的空間,促進培養液有效地循環為了降低氣泡量,增強培養基的循環

    植物所發現植物細胞器基因組新的演化模式

      質體和線粒體是內共生起源的細胞器,在高等植物中有不同的遺傳特征,相較于動態復雜的線粒體基因組,質體基因組的結構和序列更保守。在基部維管植物石松類卷柏科植物中,這兩種細胞器基因組表現出相似的特征,但是造成二者趨同演化的機制尚不清楚。?  中國科學院植物研究所研究員張憲春研究組從事石松類和蕨類植物的

    上海植物逆境中心建立植物基因組精確定點修飾技術

      中科院上海植物逆境生物學研究中心朱健康課題組近日通過模仿和改造微生物中的一種抵御外源侵染的防護機制,成功開發出一種能對植物基因組進行精確定點修飾的技術,從而使高效植物分子改良性狀成為可能。這一適用于植物的CRISPR/Cas技術就像一把剪刀可以對基因組任意感興趣的位置進行編輯,它的成功開發將革命

    昆明植物所破譯稻屬植物5個物種全基因組

      亞洲栽培稻(一般稱為水稻)是世界上最重要的糧食作物之一,是中國第一大糧食作物,養活了80%以上的中國人口。在水稻與其它約23個物種共同組成的稻屬植物中,它和7個稻種(普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展穎野生稻、長雄蕊野生稻和南方野生稻)都是AA基因組類型,這些水稻近緣物種間斷分

    植物基因組“剪刀”-被成功打造-可編輯基因組任意位置

    中科院上海植物逆境生物學研究中心朱健康課題組通過模仿和改造微生物中的一種抵御外源侵染的防護機制,成功開發出能對植物基因組進行精確定點修飾的技術,從而使高效植物分子改良性狀成為可能。這一適用于植物的CRISPR-Cas技術就像一把剪刀,可以對基因組中任意感興趣的位置進行編輯,它的成功開發將革命性地改變

    張明永等研究發現氫氣可調節植物激素

      近日,中科院華南植物園科學家研究發現,氫氣對植物激素效應具有調節功能。相關研究在線發表于《公共科學圖書館—綜合》上。   氫氣長期以來被認為是沒有生理效應的氣體分子,其在高等植物中的作用很少得到研究。盡管早在1947年就有人發現分離的葉綠體中有氫氣釋放,但在高等植物中是否存在氫化酶則一直沒有找

    張鋒Cell:新一代CRISPR基因組編輯系統

      在發表于《細胞》(Cell)雜志上的一項研究中,哈佛-麻省理工Broad研究的張鋒(Feng Zhang)及其同事們報告稱發現了一種不同的CRISPR系統,其有潛力實現更簡單、更精確的基因組工程操作。他們描述了這一新系統一些出乎意外的生物學特征,證實可以操控它來編輯人類細胞基因組。  人類基因組

    蔬菜中心:繪成世界首張西瓜基因組序列圖譜

      我國是世界第一西瓜生產與消費大國,但是人們卻始終未能從外到內了解它,直到2013年1月,國際學術頂級刊物《自然·遺傳學》發表了世界首張西瓜基因組序列圖譜(影響因子35.532),標志著人類成功破譯了西瓜遺傳“密碼”。這項由蔬菜中心主任許勇的研究團隊牽頭進行的科研創新,為高效培育兼具優質、高產、抗

    首張拓撲異構酶II全基因組剪切圖譜

      DNA切割酶對基因結構調節起著關鍵作用。研究人員發現,它在導致癌癥的(如白血病和實體瘤)易位(translocations)異常重排中表現活躍。  II型拓撲異構酶(type II topoisomerase, TOP2)通過斷裂DNA雙鏈磷酸二酯鍵,來更正DNA連環數,使細胞DNA正常轉錄、復

    張鋒等人Cell發表空間基因組學最新成果

      如果要觀察細胞,我們常常需要顯微鏡。現在,科學家已經開發出一種方法,可通過細胞自身的遺傳物質對細胞進行“拍攝”,進而生成獨特的可視化圖像。雖然當前該方法生成的圖像比傳統顯微鏡圖像要模糊,但這種方法或許可以幫助科學家們改進癌癥治療,并探索人類神經系統的形成過程等。  在今日發表于Cell雜志的重磅

    版納植物園揭示殼斗科植物的基因組大小進化

      物種的基因組大小是物種形成和多樣化中最近處的性狀。通過測定物種的基因組大小,有助于了解物種的染色體倍性和基因組進化,為全基因組測序提供基礎數據,提高基因組多樣性的生物信息學研究的效率。前人對植物基因組大小進化的研究多集中于溫帶草本類群,并且未與系統發育和地理分布相關聯,對熱帶木本植物的基因組大小

    多個秋海棠屬植物基因組被破譯

    秋海棠屬植物葉型與葉斑的多樣性 ? ?仙湖植物園供圖近日,由深圳市仙湖植物園與深圳華大生命科學研究院牽頭完成的秋海棠屬植物基因組研究成果在植物學領域國際權威刊物《新植物學家》(New Phytologist)正式發表。最新發布的研究成果中,研究團隊完成了桑寄生狀秋海棠、鐵十字秋海棠、黑武士秋海棠、和

    植物葉綠體基因組基因表達調控的研究

    葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉

    使用離心機提取植物基因組DNA

    植物基因組DNA提取使用什么樣的離心機做?具體步驟怎么樣?植物組織提取基因組DNA 一、材料 幼嫩葉子。 二、設備 移液器,冷凍高速離心機,臺式高速離心機,水浴鍋,陶瓷研缽,50ml離心管(有蓋)及5ml和1.5ml離心管,彎成鉤狀的小玻棒。(這時選擇設備的時候注意選擇那種通用性強的,可以一機配多種

    現存最原始種子植物蘇鐵基因組發布

    近日,科學家完成蘇鐵基因組解析工作,發布蘇鐵完整基因組圖譜,這意味著種子植物基因組演化研究中的最后一塊拼圖已順利完成。4月18日,《自然-植物》(Nature Plants)以封面文章發表該研究成果。據悉,該研究成果數據公開共享,全球科學家可免費下載使用。蘇鐵是地球上現存最古老的種子植物,是著名的“

    植物葉綠體基因組基因表達調控的研究

      葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式

    植物葉綠體基因組基因表達調控的研究

    葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉

    買麻藤類植物全基因組破譯

      近日,由深圳市中國科學院仙湖植物園,中科院中-非聯合研究中心、武漢植物園、植物研究所,英國皇家植物園邱園等10余家國內外知名院所聯合開展的“裸子植物——買麻藤全基因組計劃”取得重要進展。  裸子植物和被子植物的起源、分歧及演化,是現代植物學科的基礎熱點領域。現存35萬余種種子植物被分成蘇鐵類、松

    中國植物葉綠體基因組研究顛覆學界認知

      中國科學家一項歷時五年的研究成果顛覆了學界對植物葉綠體基因組的認知——科學家發現整個葉綠體基因組都是可以轉錄的。該研究成果已于近日發表在了《自然》出版集團的《科學報告》上。  《科學報告》的審稿專家一致認為,“這一成果首次發現了我們從來沒有想象過的現象,顛覆了傳統遺傳學上認為的只有葉綠體編碼基因

    植物葉綠體基因組基因表達調控的研究

      葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式

    植物基因組總DNA的分離———SDS法

    實驗方法原理SDS(十二烷基磺酸鈉)是一種強去污劑,可使細胞膜及核膜破裂,因此被用來分離DNA。該分離過程的第一步是用熱的去污劑(SDS)進行抽提,然后將抽提物置于0℃并加入高摩爾濃度的乙酸鉀,離心去除不溶物,以去除蛋白和多糖類雜質。實驗材料植物新鮮葉片試劑、試劑盒液氮提取緩沖液(用前加入)20%S

    植物葉綠體基因組基因表達調控的研究

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    植物組織制備基因組DNA實驗——CTAB法

    實驗方法原理加入一定量的異丙醇或乙醇,基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中, 可用玻棒將其取出,而小分子DNA則只形成顆粒狀沉淀附于壁上及底部, 從而達到提取的目的。實驗材料植物組織試劑、試劑盒CTAB液2-疏基乙醇TE高鹽TE氯仿異戊醇儀器、耗材研缽離心機培養箱實驗步驟1. ?在所需量

    植物基因組總DNA的分離———SDS法

    實驗方法原理 SDS(十二烷基磺酸鈉)是一種強去污劑,可使細胞膜及核膜破裂,因此被用來分離DNA。該分離過程的第一步是用熱的去污劑(SDS)進行抽提,然后將抽提物置于0℃并加入高摩爾濃度的乙酸鉀,離心去除不溶物,以去除蛋白和多糖類雜質。實驗材料 植物新鮮葉片試劑、試劑盒 液氮提取緩沖液(用前加入)2

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