10月,國際知名學術期刊《自然-方法(Nature Methods)》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院/上海交通大學醫學院健康科學研究所常興研究組題為“Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic diversification in mammalian cells”的最新研究成果,報道了利用靶向性胞嘧啶脫氨酶在體內實現高效率和高通量的DNA堿基編輯的新方法。單核苷酸的多樣性是遺傳多樣性的主要來源,是分子進化的動力和很多疾病的直接誘因。然而由于哺乳動物基因組的高度穩定性,在哺乳動物細胞內很難高效和高通量地誘導單核苷酸的突變,進而研究這些突變的功能。雖然通過CRISPR等基因編輯技術,可以實現較高效的DNA切割和基因敲除,但由于同源重組(HDR)的效率低下,現有的CRISPR技術對于體內構建單核苷酸突變仍處于低效階段。靶向性AID介導的核苷......閱讀全文
10月,國際知名學術期刊《自然-方法(Nature Methods)》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院/上海交通大學醫學院健康科學研究所常興研究組題為“Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic div
10月10日,國際學術期刊《自然-方法》(Nature Methods)在線發表了中國科學院上海生命科學研究院/上海交通大學醫學院健康科學研究所常興研究組題為Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic div
CRISPR已經應用于包含人類,小鼠,酵母,水稻等各個物種中,取得了空前的成功。就在近期,Nature Biotechnology 雜志連續推出了4篇CRISPR技術的進一步升級應用,同時也進一步拓寬了CRISPR技術應用范圍,尤其是為臨床的應用做了非常好的鋪墊。 這4篇文章分別是:美國伊利
近年來涌現出不少DNA甲基化的檢測技術,少說也有十幾種。大致可以分為兩類:特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析,后者也稱為甲基化圖譜分析(methylation profiling)。下面大家介紹一些常用的方法。一、特異位點的甲基化檢測1. 甲基化特異性PCR(MS-PCR)這種方法經濟實用,
近年來涌現出不少 DNA 甲基化的檢測技術,少說也有十幾種。大致可以分為兩類:特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析,后者也稱為甲基化圖譜分析 (methylation profiling)。下面大家介紹一些常用的方法。 特異位點的甲基化檢測 甲基化特異性 PCR (MS-PCR)
近年來涌現出不少DNA甲基化的檢測技術,少說也有十幾種。大致可以分為兩類:特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析,后者也稱為甲基化圖譜分析(methylation profiling)。下面大家介紹一些常用的方法。一、特異位點的甲基化檢測1. 甲基化特異性PCR(MS-PCR)這種方法經濟實用,
近年來涌現出不少DNA甲基化的檢測技術,少說也有十幾種。大致可以分為兩類:特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析,后者也稱為甲基化圖譜分析(methylation profiling)。下面生物通給大家介紹一些常用的方法。 全基因組的甲基化分析 基于芯片的甲基化圖譜分析
為了促進斑馬魚的高通量的基因分型,我們開發了一種新的技術——用高通量熔解分析(HRMA)區分野生、雜合、純合突變。這種耗時一個小時的技術不需要進行限制性內切酶酶切和瓊脂糖凝膠電泳的操作。此技術生成的熔解圖的敏感性高,可以檢測不明確的PCR產物。我們可以對斑馬魚的三種類型的突變進行可靠的基
基因修飾動物是研究在發育和疾病中基因功能的重要工具。CRISPR/Cas9系統有效的應用于構建基因敲除和敲入小鼠。而楊輝團隊正好專注于該領域。 楊輝,30歲時,就成為中科院上海生科院神經所研究員;2015年,入選國家“青年千人計劃”;2019年,楊輝博士獲得國家杰出青年基金資助。 由楊輝創辦
3.楊輝/李亦學/Lars M. Steinmetz等團隊建立新型脫靶檢測技術,基因編輯工具安全性評估或迎來新突破 CRISPR/Cas9是廣泛關注的新一代基因編輯工具,自從2012年被發明以來,它一直以其高效性和特異性備受世人的期待,然而值得注意的是,CRISPR/Cas9從問世以來,其脫靶風險
在RNA分子中鑒定出超過150種RNA修飾。轉錄組分析是解碼這些化學修飾的潛在功能的關鍵步驟之一。N7-甲基鳥苷(m7G)是tRNA,rRNA和mRNA 5'cap中存在的最豐富的修飾之一,并且在調節RNA加工,代謝和功能中具有關鍵作用。除了其在mRNA中的帽位置外,還在內部mRNA區域
相關專題1 甲基化敏感性限制性內切酶 (methylation-sensitive restriction Endonuclease,MS-RE)-PCR/Southern法這種方法利用甲基化敏感性限制性內切酶 對甲基化區的不切割的特性,將DNA消化為不同大小的片段后再進行分析。常使用的甲基化敏感的
經過特殊的算法,我們得到了2018年前10個月中國生物醫學風云榜人物及最火爆的3個重大學術界事件,能夠上榜的風云人物/事件,都曾長時間占據過100多個公生物醫學公眾號的頭版頭條。 在此,我們精選了其中的3個事件及16位風云榜人物。我們對其進行了劃分,分別是:6星級的3個事件,分別位諾貝爾獎,國
2016年,David Liu團隊在 Nature 期刊上首次報道了基于胞嘧啶脫氨酶APOBEC1(能催化C脫氨基變成U,而U在DNA復制過程中會被識別成T)和尿嘧啶糖基化酶抑制劑UGI(能防止尿嘧啶糖基化酶將U糖基化引起堿基切除修復)的單堿基編輯工具(BE3)首次實現可以在不引入DNA雙鏈斷裂
人們已經發現了大量與人類疾病有關的單核苷酸變異,其中許多是功能獲得性突變,會導致蛋白質的氨基酸置換或者形成轉錄因子的新結合位點。然而現有篩選方法(包括CRISPR、CRISPRi和RNAi)只能破壞一個基因或者改變其表達水平,難以引入一系列功能獲得性突變進行高通量篩選,亟需能有效作用于哺乳動物細胞的
3月1日,《科學》(Science)雜志發表了一篇名為《胞嘧啶單堿基編輯會導致大量單核苷酸突變的脫靶》的研究論文,該研究由中國科學院神經科學研究所(中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心)、上海腦科學與類腦研究中心、神經科學國家重點實驗室、中國科學院靈長類神經生物學重點實驗室楊輝研究組與中國科學