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  • 兩篇Nature子刊發表基因組測序成果為新藥開發提供新線索

    科學家們對造成盤尾絲蟲病的寄生蟲進行基因組測序,揭示了這種寄生蟲的活動方式,鑒定了可以被現有藥物靶標的蛋白,為新藥和疫苗開發提供了線索。這項研究以兩篇文章的形式發表在本周的Nature Microbiology雜志上。 據世界衛生組織(WHO)統計,全世界有一千八百萬人受到盤尾絲蟲病的影響,主要集中在撒哈拉以南的區域。這種疾病通過在河流邊生活的蚊蟲在人群中傳播,這些蚊蟲叮咬會帶來致病的盤尾絲蟲。盤尾絲蟲進入人體就會開始繁殖,其后代遷移到皮膚會引起劇烈瘙癢和皮疹,遷移到眼睛會造成眼部癥狀甚至失明。目前人們普遍用抗寄生蟲藥物伊維菌素進行治療,但完全治愈可能需要數十年時間。一些研究者認為,伊維菌素的廣泛使用會使寄生蟲對藥物發展出抗性。 美國NIH過敏與傳染病研究所(NIAID)的研究人員收集厄瓜多爾、烏干達和西非的盤尾絲蟲(O. volvulus),對其完整基因組進行了測序,還重建了盤尾絲蟲體內共生菌Wolbachia的基因組......閱讀全文

    兩篇Nature子刊發表基因組測序成果為新藥開發提供新線索

      科學家們對造成盤尾絲蟲病的寄生蟲進行基因組測序,揭示了這種寄生蟲的活動方式,鑒定了可以被現有藥物靶標的蛋白,為新藥和疫苗開發提供了線索。這項研究以兩篇文章的形式發表在本周的Nature Microbiology雜志上。  據世界衛生組織(WHO)統計,全世界有一千八百萬人受到盤尾絲蟲病的影響,主

    基因組測序

    如果樓主指的是人類基因組計劃,那時用的方法叫做雙脫氧終止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中,DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸)來作為原料,但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的,但與普通PCR不同,它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的

    全基因組重測序技術揭示綿羊尾脂形成的分子生物學機制

      近日,中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所肉羊遺傳育種科技創新團隊揭示了中國地方綿羊品種在適應性馴化過程中,如何通過基因組層面的選擇和重組來影響綿羊尾型的遺傳進化機制。相關研究成果已發表在《BMC Genomics》上。圖片來源于網絡  綿羊的尾型是一個重要的經濟性狀,可以為綿羊提供能量抵御惡劣環境

    解碼“基因組學之父”桑格:測序,測序,測序

      “桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’,他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎,徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、   有一天,65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗,轉身走出實驗室,宣布自己正式退休。那一年是1983

    Science子刊:神秘的點頭綜合征可能是盤尾絲蟲導致的

      在1990年到2013年之間,在飽受戰爭蹂躪的南蘇丹和烏干達北部,上千名兒童突然患上一種神秘的重度癲癇癥。當接觸食物或者低溫時,受影響的兒童不受控制地點頭,也因此這種疾病被稱作為點頭綜合征(nodding syndrome)。隨著時間的推移,這種癲癇癥經常會惡化,讓這些兒童遭受嚴重殘疾。很多兒童

    認識泛基因組測序

    什么是泛基因組?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome,pan源自希臘語‘παν’,全部的意思),泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年,Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接,發現了個體獨有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

    PNAS:甜瓜基因組測序

      甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值,日前西班牙的九個研究中心通力合作,利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組,科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組,文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。   聯合國糧農組織2009年

    基因組測序儀簡介

      基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器,于2012年12月19日啟用。  技術指標  個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。  主要功能  樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫,從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道,以節約試劑用量。

    服用的不良反應有哪些

      1.有關歷史資料說明抗絲蟲藥物[例如乙胺嗪枸櫞酸鹽(DEC-C)可引起盤尾絲微絲幼蟲病人皮膚和(或)全身嚴重的變態反應(Mazzotti反應)及眼科反應。這些反應可能是由于死亡的微絲幼蟲尸體引起的過敏與炎癥反應。用伊維菌素治療盤尾絲微絲幼蟲病人在臨床上可能出現這些反應,也許或肯定與藥物本身有關。

    伊維菌素膠囊的注意事項

      1.有關歷史資料說明抗絲蟲藥物[例如乙胺嗪枸櫞酸鹽(DEC-C)可引起盤尾絲微絲幼蟲病人皮膚和(或)全身嚴重的變態反應(Mazzotti反應)及眼科反應。這些反應可能是由于死亡的微絲幼蟲尸體引起的過敏與炎癥反應。用伊維菌素治療盤尾絲微絲幼蟲病人在臨床上可能出現這些反應,也許或肯定與藥物本身有關。

    關于全基因組測序的測序指標介紹

      一、全基因組測序的測序指標— 深度  測序深度(Sequencing depth)是指測序得到的堿基總量(bp)與基因組大小的比值,它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系,測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體,如果采用的是雙末端或Ma

    伊維菌素膠囊的適應癥

      適用于盤尾絲蟲病和類圓線蟲病及鉤蟲、蛔蟲、鞭蟲、蟯蟲感染。

    454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目

      一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代,其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1,科學家通過454全基因組測序,掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因,包括抗病能力、牛奶產量,這些性狀已通過北美的當

    新冠治療新希望?2天新冠病毒減少5000倍!

      隨著近期印度疫情再次加劇,當地大面積應用伊維菌素的消息引發關注,還有研究顯示,伊維菌素能在 48 小時內將新冠病毒 RNA 減少 5000 倍。  一個不少人關心的問題:伊維菌素要成為新冠治療的新希望嗎?  伊維菌素能治新冠嗎?  伊維菌素(Ivermectin)是上世紀七十年代發現的一種抗生素

    我國完成小麥A基因組測序

    ?? 5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征,對深入和

    白肉靈芝完成基因組測序

    ?在韶關產業園種植的白肉靈芝。吳清平團隊 供圖 近日,中國工程院院士、廣東省科學院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了第一個白肉靈芝全基因組測序。據悉,這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3:基因,基因組,遺傳學》(G3-Genes Genomes Genet

    什么是基因組測序技術

    自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來,人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開,分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中,他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法",人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法",其實是一種

    盤點最新基因組測序成果

      the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者:  種屬:非洲腔棘魚(Latimeria chalumnae)  基因組:~2.86 billion bp  人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕,直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年

    我國完成小麥A基因組測序

    本報訊(記者丁佳)5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和

    中國蓮基因組測序完成

      繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后,近日,中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作,順利完成中國蓮的基因組測序,構建了首張中國蓮全基因組圖譜,相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。   “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎,也標志著我國相關研究將對生物進

    人類全基因組測序計劃

      全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列,對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部(DOE)與美國國家衛生研究院(NIH),分別在1986年與1987年加入人類基

    簡化基因組測序好做嗎

    簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲芯片技術或其他實驗手段降低物種基因組復雜程度,進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing)。這些技

    基因組測序的具體過程

    講起來很復雜哈,簡單來說,就是邊合成邊測序,把所要測序的序列通過各種手段來建庫,然后加上5‘和3’都加上接頭,放在一個小玻璃片一樣的芯片上,上面一般是8個lane,把樣品加入到lane上之后和上面長好的接頭序列相結合(之前的建庫時加的接頭與之反向互補),然后再經過PCR擴增的過程形成一個DNA簇,然

    讓基因組測序繞過PCR

    ?在基因組測序中,PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而,PCR也帶來一些問題,包括不均勻擴增,導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序(NGS)平臺而言,測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR-

    Nature完成桉樹基因組測序

      一個橫跨五大洲的科學團隊宣布,巨桉(Eucalyptus grandis)的基因組測序已經完成,巨桉是世界上最廣泛種植的樹木之一。這一成果于六月十一日發表在Nature雜志上。  巨桉生長速度快,可以用作燃料和木材,是纖維、紙漿、生物燃料、藥物和工業用油的重要可再生原料。這種樹木原產于澳大利亞東

    測序解讀基因組,真的好嗎?

    測序解讀基因組,真的好嗎?   “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire,在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說,“尤其是對自己基因組信息的了解。”  雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年,但

    454用于西紅柿基因組測序

      最近,西紅柿基因組學會完成了一個農業種植西紅柿品系Solanum lycopersicum的基因組圖譜,以及一個野生型西紅柿品系S. pimpinellifolium的基因組圖譜,并將其與已知的土豆基因組以及其他植物比較,尋找與水果有些特性相關的基因,相關文獻在Nature雜志作為封面文章發

    測序基因組勘探食品污染

       上周,兩家公司因李斯特菌食品感染發令召回其所有產品。Sabra Dippin召回30,000例鷹嘴豆泥制成的食品,至今疾病防治中心未發現因食用該公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而,堪薩斯州的藍鈴冰激淋工廠(Blue  Bell Creameries)已確認有少量食品原料已感染李斯特菌,目

    Nature突破:香蕉基因組測序

      由法國的研究人員領導的一個國際小組近日完成了對香蕉品種小果野蕉(Musa acuminata)的基因組測序,并開始分析這一基因組草圖。相關研究成果發布在了7月11日的《自然》(Nature)雜志上。   研究人員采用Roche 454、Sanger和Illumina的測序方法繪制出了雙單倍

    基因組測序拯救鸮鸚鵡

      為了保護極度瀕危的新西蘭鸮鸚鵡kakapo,幾乎所有剩余個體的基因組都已被測序,這為其保護管理提供了重要信息。  新西蘭鸮鸚鵡kakapo(Strigops habroptila)有幾個特性。它是世界上最重的鸚鵡,有的雄性甚至超過3公斤,被認為有達90年的最長壽命。它是唯一一種不會飛的鸚鵡,通過

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