獼猴桃網狀進化與雜交物種形成機制研究獲進展
獼猴桃是原產我國的重要經濟果樹植物。除了現代農業生產中廣泛馴化育種利用的中華獼猴桃（Actinidiachinensis var. chinensis）和美味獼猴桃（A. chinensis var. deliciosa）兩個類群外，獼猴桃屬植物還包括其他50多個物種共計約76個分類單元。該屬植物在我國具有廣泛的地理分布，擁有極高的物種形態多樣性和相關于不同生態氣候環境的適應能力。獼猴桃為雌雄異株多年生藤本植物。長期以來，種內（間）自然雜交被認為是該屬植物進化和多樣化的主要原動力，但相關種間基因流的動態和方式一直缺乏清晰準確的研究和理解。 基于基因組測序和重測序技術，中國科學院華南植物園植物科學研究中心副研究員劉義飛等在研究員黃宏文的指導下與武漢植物園科研人員共同開展研究，對分屬于25個代表性獼猴桃類群的40個研究樣本進行了比較和系統基因組學研究。結果表明，在該屬植物中存在廣泛的網狀雜交基因流。有趣的是，一些獼猴桃類群間存......閱讀全文
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
中國科學家Nature子刊公布新基因組草圖
來自合肥工業大學、四川大學、四川省自然資源科學研究院、北京百邁客生物科技有限公司等10多家機構的研究人員組成的一個研究小組成功繪制出了獼猴桃(Actinidia chinensis)的全基因組序列草圖。相關成果發表在10月18日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志
武漢植物園在獼猴桃葉綠體基因組研究中獲得新進展
獼猴桃（Actinidia chinensis）是一種富含Vc的經濟水果，目前在全世界越來越受到消費者歡迎。盡管我國學者對中華獼猴桃的全基因組進行了測序，然而對獼猴桃葉綠體基因組并未進行組裝和注釋。 中國科學院武漢植物園獼猴桃資源與育種學科組副研究員姚小洪在研究員黃宏文的指導下，完成了不同倍性
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
再探獼猴桃基因奧秘
毛花獼猴桃 劉永勝供圖 這項研究不僅證實了獼猴桃進化過程中兩次近代基因組倍增歷史事件對物種分化和物種形成的影響，而且進一步揭示獼猴桃富營養成分諸如維生素C、類胡蘿卜素、葉綠素和類黃酮等的基因組學機制，為獼猴桃品質改良和遺傳育種奠定了堅實基礎。 獼猴桃起源于中國，大約100年前引入新西蘭開始馴化和
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目
一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代，其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1，科學家通過454全基因組測序，掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因，包括抗病能力、牛奶產量，這些性狀已通過北美的當
獼猴桃網狀進化與雜交物種形成機制研究獲進展
獼猴桃是原產我國的重要經濟果樹植物。除了現代農業生產中廣泛馴化育種利用的中華獼猴桃（Actinidiachinensis var. chinensis）和美味獼猴桃（A. chinensis var. deliciosa）兩個類群外，獼猴桃屬植物還包括其他50多個物種共計約76個分類單元。該屬植
我國完成小麥A基因組測序
本報訊（記者丁佳）5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和
測序解讀基因組，真的好嗎？
測序解讀基因組，真的好嗎？ “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire，在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說，“尤其是對自己基因組信息的了解。” 雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年，但
我國完成小麥A基因組測序
?? 5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征，對深入和
測序基因組勘探食品污染
上周，兩家公司因李斯特菌食品感染發令召回其所有產品。Sabra Dippin召回30,000例鷹嘴豆泥制成的食品，至今疾病防治中心未發現因食用該公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而，堪薩斯州的藍鈴冰激淋工廠（Blue Bell Creameries）已確認有少量食品原料已感染李斯特菌，目
454用于西紅柿基因組測序
最近，西紅柿基因組學會完成了一個農業種植西紅柿品系Solanum lycopersicum的基因組圖譜，以及一個野生型西紅柿品系S. pimpinellifolium的基因組圖譜，并將其與已知的土豆基因組以及其他植物比較，尋找與水果有些特性相關的基因，相關文獻在Nature雜志作為封面文章發
盤點最新基因組測序成果
the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者： 種屬：非洲腔棘魚（Latimeria chalumnae） 基因組：~2.86 billion bp 人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕，直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年
中國蓮基因組測序完成
繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后，近日，中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作，順利完成中國蓮的基因組測序，構建了首張中國蓮全基因組圖譜，相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。 “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎，也標志著我國相關研究將對生物進
什么是基因組測序技術
自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來，人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開，分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中，他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法"，人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法"，其實是一種
讓基因組測序繞過PCR
?在基因組測序中，PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而，PCR也帶來一些問題，包括不均勻擴增，導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序（NGS）平臺而言，測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR-
基因組測序的具體過程
講起來很復雜哈，簡單來說，就是邊合成邊測序，把所要測序的序列通過各種手段來建庫，然后加上5‘和3’都加上接頭，放在一個小玻璃片一樣的芯片上，上面一般是8個lane，把樣品加入到lane上之后和上面長好的接頭序列相結合（之前的建庫時加的接頭與之反向互補），然后再經過PCR擴增的過程形成一個DNA簇，然
簡化基因組測序好做嗎
簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲芯片技術或其他實驗手段降低物種基因組復雜程度，進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括RAD（Restriction site Associated DNA）和GBS（Genotyping By Sequencing）。這些技
白肉靈芝完成基因組測序
?在韶關產業園種植的白肉靈芝。吳清平團隊 供圖 近日，中國工程院院士、廣東省科學院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了第一個白肉靈芝全基因組測序。據悉，這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3：基因，基因組，遺傳學》（G3-Genes Genomes Genet
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列，對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛生研究院（NIH），分別在1986年與1987年加入人類基
基因組測序拯救鸮鸚鵡
為了保護極度瀕危的新西蘭鸮鸚鵡kakapo，幾乎所有剩余個體的基因組都已被測序，這為其保護管理提供了重要信息。 新西蘭鸮鸚鵡kakapo（Strigops habroptila）有幾個特性。它是世界上最重的鸚鵡，有的雄性甚至超過3公斤，被認為有達90年的最長壽命。它是唯一一種不會飛的鸚鵡，通過
Nature突破：香蕉基因組測序
由法國的研究人員領導的一個國際小組近日完成了對香蕉品種小果野蕉(Musa acuminata)的基因組測序，并開始分析這一基因組草圖。相關研究成果發布在了7月11日的《自然》(Nature)雜志上。 研究人員采用Roche 454、Sanger和Illumina的測序方法繪制出了雙單倍
Nature完成桉樹基因組測序
一個橫跨五大洲的科學團隊宣布，巨桉(Eucalyptus grandis)的基因組測序已經完成，巨桉是世界上最廣泛種植的樹木之一。這一成果于六月十一日發表在Nature雜志上。 巨桉生長速度快，可以用作燃料和木材，是纖維、紙漿、生物燃料、藥物和工業用油的重要可再生原料。這種樹木原產于澳大利亞東
“兩件事”讓獼猴桃變成“維C大王”
中國科學家發現，獼猴桃在進化過程中發生過兩次同源四倍體事件，這讓獼猴桃的一些關鍵功能基因得以大幅擴張拷貝數，其中就包括合成維生素C的基因。這或許揭示了“維C大王”背后的秘密。相關研究結果近日發表在細胞出版社最新創建的綜合性學術期刊iScience上。 “了解獼猴桃的基因家族和產生維生素C的通路
武漢植物園構建獼猴桃高密度遺傳圖譜
獼猴桃富含果實維生素C、膳食纖維和多種礦物營養，被譽為“水果之王”。獼猴桃屬具有 54 個種，21 個種下分類群，遺傳多樣性豐富，而商業栽培品種中主要為中華獼猴桃。隨著我國人民生活水平的迅速提高，對高品質、新品種獼猴桃的需求顯著增加。獼猴桃為功能性雌雄異株多年生果樹，在傳統育種中面臨著占地面積大
“兩件事”，讓獼猴桃變成“維C大王”
彌猴桃經歷兩次同源四倍體事件，每個細胞中的染色體組和所有基因加倍。（論文作者供圖） 中國科學家發現，獼猴桃在進化過程中發生過兩次同源四倍體事件，這讓獼猴桃的一些關鍵功能基因得以大幅擴張拷貝數，其中就包括合成維生素C的基因。這或許揭示了“維C大王”背后的秘密。相關研究結果于9月20日發表在細胞出
Cell公布最新基因組測序結果
去年夏天西非埃博拉爆發的早期階段，科學家們以空前的規模和速度測序了這種致命病毒的基因組，為人們揭示了許多疫情蔓延的關鍵信息，比如說病毒只通過人與人接觸傳播，病毒在多次傳播中獲得了許多新突變等等。 雖然埃博拉爆發最糟糕的時期已經過去，但這場疫情并未結束，還有許多問題需要人們去解答。為此，哈佛大學