Cell:“暗物質”DNA影響大腦發育
十多年來,由基因組中的“暗物質”片段(沒有明顯功能的纏繞在一起的DNA長鏈)帶來的謎題一直困擾著科學家。如今,一個團隊最終破解了這個謎題。 這個謎題集中在不編碼蛋白質但在很多動物中保持相同的DNA序列。通過刪除其中一些“超保守元素”,研究人員發現,這些序列能微調編碼蛋白質的基因表達,進而指導大腦發育。 這項日前發表于《細胞》雜志的研究,或許能幫助研究人員更好地了解諸如阿爾茨海默氏癥等神經系統疾病。同時,它還驗證了科學家提出的所有超保守元素對生命至關重要的假設,盡管研究人員對于它們的功能知之甚少。 編碼蛋白質的基因通常擁有相對較少的突變,因為如果這些改變干擾了相應的蛋白質,并且動物在繁殖前死去,那么突變的基因就不會被傳給后代。基于該邏輯,一些基因組學家懷疑自然選擇能以類似方式清除超保守區域的突變。他們認為,即便這些序列沒有編碼蛋白質,它們的功能肯定也非常重要。 不過,這一假設在2007年遇到“路障”。當時,一個團隊報告......閱讀全文
分子遺傳學詞匯dna基因
中文名稱:dna基因英文名稱:dna gene定 義:與細菌DNA復制直接相關的基因。應用學科:遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
DNA基因探針的克隆方法介紹
對于基因探針的克隆尚有更快捷的途徑。這也是許多重要蛋白質的編碼基因的克隆方法。該方法的第一步是分離純化蛋白質,然后測定該蛋白的氨基或羥基末端的部分氨基酸序列,然后根據這一序列合成一套寡核苷酸探針。用此探針在DNA文庫中篩選,陽性克隆即是目標蛋白的編碼基因。值得一提的是真核細胞和原核細胞DNA組織有所
基因組DNA的快速純化
第 1 天1. 大約 1.5 cm 長的尾部活檢樣品放在一個 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部緩沖液的小離心管中,加 35 μl 10 mg/ml蛋白酶 K,在 55℃ 振搖溫育過夜。尾部緩沖液(配 25 ml)50 mmol/L Tris,pH 8??????????????????????
植物基因組DNA的RFLP
實驗概要本實驗介紹了植物基因組DNA的RFLP多態性分析的原理及操作步驟。通過本實驗可了解不同植物或同一植物不同個體之間基因組DNA順序的差異性,掌握DNA限制性酶切片段長度多態性研究的基本方法。實驗原理DNA多態性是指DNA堿基順序的差異性。這種差異性不僅存在于不同的植物之間,也存在于同一種植物的
血基因組DNA提取實驗——血基因組DNA大量試劑盒提取法
實驗方法原理本試劑盒采用獨特的兩相分離技術,結合DNA 制備膜選擇性地吸附DNA 的方法達到純化基因組DN的目的。適合從5 ml 的抗凝人或哺乳動物全血,或500 ul 抗凝鳥類或兩棲動物全血中獲得多至250 ug 的基因組DNA。實驗材料抗凝全血試劑、試劑盒血基因組DNA大量試劑盒儀器、耗材DNA
DNA微陣列檢測基因表達水平及識別基因序列
Schena等1996年用擬南芥光調基因微陣列,以不同器官中的mRNA為探針,檢測其基因表達水平,結果表明葉mRNA的表達水平是根的500倍。Shelon等1996年將釀酒酵母基因組DNA克隆制成微陣列,用6條最大染色體和10條最小染色體DNA探針分別標記上紅,綠熒光標記進行雜交檢測,結果表明9
分離基因組DNA和質粒DNA有哪些不同之處
分離質粒時,可以將質粒去得很干凈。方法為:先用TE之類的試劑將菌液懸浮起來,再用NaOH和SDS將菌液裂解(起裂解作用的主要是NaOH,但此時,SDS可以與蛋白很好的結合)。第三步,加入酸中合第二步中的堿,并且將SDS沉淀下來,同時,SDS和蛋白也一起沉淀下來,而基因組上面有很多的蛋白,這樣基因組就
提取基因組dna后,怎樣判斷dna的純度和質量
用紫外分光光度計測od值a260/a280正常1.8左右如果制備的dna樣品a260/a2802,說明樣品中rna過高,可用rnase消化后,用酚、氯仿、異戊醇抽提,再用乙醇沉淀dna
Nature:缺乏Dna2會導致基因跳躍到DNA斷裂處
細胞具有許多保護基因組完整性的機制,包括修復在DNA復制過程中可能發生的錯誤的過程。酶Dna2參與DNA修復,但是人們對它的缺失對染色體不穩定性的影響知之甚少。在一項新的研究中,來自美國貝勒醫學院等多家研究機構的研究人員揭示出當Dna2缺失時,較小的DNA片段從整個基因組跳躍到染色體斷裂處。這種
基因組DNA的得率較低或者無基因組DNA原因及解決方法
1 ) 樣品材料老化或者反復凍融導致 DNA 含量下降: 應選擇新鮮的材料樣品,如新鮮血液、新鮮菌液、剛離體的動物組織或幼嫩的植物組織等,不能立即處理的樣品應放入液氮或-70℃低溫保存,以免DNA降解。 2 ) 樣品破壁或者裂解不完全, DNA 未充分釋放: 動植物樣品應在液氮中充分研磨
新基因篩選工具能繪制“垃圾DNA”
據英國《每日郵報》官網報道,美國科學家近日開發了一種新的基因篩選工具,能繪制引起癌癥、糖尿病和癡呆癥的基因突變,或有助于開發新療法,進而拯救每年因此喪生的數百萬人。新成果發表在《公共科學圖書館》雜志上。 領導這次研究的哥倫比亞大學教授大衛·戈爾茨坦說,現在的基因測序只能在不超過三分之一的
華大基因攜手阿里云打造DNA商店
今日,華大基因宣布其在阿里云計算平臺部署的服務產品BGI Online國內beta版本正式上線。 隨著生命科學領域數據爆炸式的增長,如何及時獲取、快速分析、安全儲存這些龐大的數據是研究者們急需解決的問題。華大基因推出的BGI Online集成了高性能計算,大規模存儲及安全網絡互聯等基礎設施,支
-Nature:DNA講述歷史-基因中發掘細節
英德研究人員在14日出版的美國《科學》雜志上報告說,絲綢之路的貿易、成吉思汗的西征乃至歐洲的殖民擴張等重大歷史事件的影響,都反映在現代人類的基因中。 研究人員利用世界各地95個民族近1500人的DNA(脫氧核糖核酸)數據,繪制出一幅過去4000年中的人類基因交流地圖,為人類通過基因分析的方
細菌中制備基因組DNA實驗
小量制備 氯化銫法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 提取DNA的一般過程是將分散好的組織細胞在含SDS(十二烷基硫酸鈉)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白質,再用酚和氯仿
基因轉染技術的DNA的準備介紹
用于轉染的質粒DNA必須無蛋白質,無RNA和其它化學物質的污染,OD260/280比值應在1.8以上。DNA的質量和純度能影響某些細胞系的轉染效率,可以通過CsCl梯度法或標準柱層析法進行純化。
關于DNA重組的基因轉換的介紹
在基因轉換中,一條染色體上部分遺傳物質被復制到另一條染色體,而提供這部分遺傳物質的染色體序列并沒有被改變。在減數分裂DNA重組發生位點,基因轉換高頻率發生。通常在真菌雜交中研究基因轉化 [2] ,其中可以方便地觀察到單個減數分裂的4種產物。
PCR擴增樣本DNA的HLA基因片段
一、PCR擴增體系1. 1.0uM 引物2. 300ng待測樣本基因組DNA3. 2.0U Taq多聚酶4. 200uM 各種dNTP5. 用1 X PCR緩沖液(10mM Tris-HCl,pH8.3,50mM KCl,1.5mM MgCl2,0.01%明膠)調至總體積100ul,并用50ul礦物
細菌中制備基因組DNA實驗
實驗方法原理?提取DNA的一般過程是將分散好的組織細胞在含SDS(十二烷基硫酸鈉)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白質,再用酚和氯仿/異戊醇抽提分離蛋白質,得到的DNA溶液經乙醇沉淀使DNA從溶液中析出。實驗材料?細菌試劑、試劑盒?TE氯化銫溴化乙錠NaCl乙醇CTAB儀器、耗材?離心機搖床實驗步驟 1
PNAS解析CRISPR的DNA基因編輯機制
一個國際科學家小組促使我們朝著更深層次地了解一些酶“編輯“基因的機制邁出了重要一步,從而為糾正患者的遺傳疾病鋪平了道路。 來自布里斯托大學和立陶宛生物技術研究院的研究人員觀察了,一種叫做CRISPR的酶結合和改變DNA結構的過程。 發表在《美國國家科學院院刊》(PNAS)上的這些研究結果,為
從動物組織提取基因組DNA
實驗概要本實驗以哺乳動物新鮮組織為材料,學習基因組DNA提取的一般方法。實驗原理基因組DNA的提取通常用于構建基因組文庫、Southern雜交(包括RFLP)及PCR分離基因等。利用基因組DNA較長的特性,可以將其與細胞器或質粒等小分子DNA分離。加入一定量的異丙醇或乙醇,基因組的大分子DNA即沉淀
用DNA芯片技術檢測基因的表達
一、芯片制備基因芯片的制備主要有兩種基本方法,一是在片合成法,另一種方法是點樣法。在片合成法是基于組合化學的合成原理,它通過一組定位模板來決定基片表面上不同化學單體的偶聯位點和次序。在片合成法制備DNA芯片的關鍵是高空間分辨率的模板定位技術和固相合成化學技術的精巧結合。目前,已有多種模板技術用于基因
植物組織制備基因組DNA實驗
氯化銫法 CTAB法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 加入一定量的異丙醇或乙醇,基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中, 可用玻棒將其取出,而小分子DNA則
植物組織制備基因組DNA實驗
實驗方法原理?加入一定量的異丙醇或乙醇,基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中, 可用玻棒將其取出,而小分子DNA則只形成顆粒狀沉淀附于壁上及底部, 從而達到提取的目的。實驗材料?植物組織試劑、試劑盒?抽提緩沖液十二烷基肌氨酸鈉TE異丙醇溴化乙錠氯化銫儀器、耗材?離心機實驗步驟 ? 收取1
DNA斷裂修復增加基因突變風險
據美國物理學家組織網近日報道,美國印第安納大學與普渡大學印第安納波利斯聯合分校(IUPUI)和瑞典優密歐大學(Umea University)最近的一項聯合研究顯示,有一種細胞用于修復自身DNA斷裂的方法(稱為斷裂誘導復制),比正常合成DNA產生的基因變異要高出2800倍。
分子雜交基因所用DNA探針應用介紹
DNA探針是最常用的核酸探針,指長度在幾百堿基對以上的雙鏈DNA或單鏈DNA探針。現已獲得DNA探針數量很多,有細菌、病毒、原蟲、真菌、動物和人類細胞DNA探針。這類探針多為某一基因的全部或部分序列,或某一非編碼序列。這些DNA片段須是特異的,如細菌的毒力因子基因探針和人類Alu探針。這些DNA探針
產前DNA檢測走紅背后的基因江湖
經歷了2015年的熱捧,2016年的資本小幅理性回歸,2017年上半年的熱潮趨緩后,泛泛的基因測序將無法持續吸引資本的目光,未來行業熱點在于技術突破,或者商業模式的突破。 (做一次全基因檢測,會產生100多G海量數據,其中能被用于科研與臨床應用的,只是蛋白編碼基因與少量的非蛋白編碼基因,占整體
生物基因組DNA的種類介紹
1、蛋白編碼序列。以三聯體密碼方式進行編碼。編碼DNA在基因組中所占比例隨生物而異,在人類細胞基因組中,這一比例只有1.5%左右。這類編碼序列主要是非重復的單一DNA序列,一般在基因組中只有一個拷貝(單一基因),然而,也有可能有兩個或幾個拷貝甚至多達上千個拷貝的情況,這些都來自于從基因家族里派生出來
定向基因編輯改寫斑馬魚的DNA
斑馬魚是基因研究中一種常用的模式生物。現在科學家可以對它們的基因組進行定向的編輯。 據Nature近日報導,在對脊椎動物和人類疾病的研究中,斑馬魚是一種重要的模式生物。它的卵是透明的,在體外孵化,它的繁殖周期很短,生長速度快,這些都意味著,很適合在生物生存的條件下對它的胚胎進行密切研究。而
真核細胞基因組DNA的提取
實驗概要高等動物,高等植物的基因組相當龐大,如人類細胞基因組由30億個堿基對組成,果蠅基因組有1.4×108個堿基對,水稻基因組有1.4×109個堿基對。真核細胞基因組中,約1萬-1.5萬個可表達的結構基因,其它大量存在的是調控序列和內含子序列。可以說某特定物種的基因組,包含了該物種生長,發育,繁殖
基因組DNA-Southern雜交操作步驟
1)基因組DNA Southern印跡的制備 預備 1.用適當的限制性內切酶消化基因組DNA樣品(10μg)。 2.進行瓊脂糖凝膠電泳。一般用0.7~1.0%的瓊脂糖凝膠分離基因組DNA,它在1~15kb的范圍內有較好的分辨率,可選用TBE或TAE緩沖液。瓊脂糖凝膠電泳需在1V/cm的電