心理所成功開發國際首個注意缺陷多動障礙遺傳學數據庫
隨著科學技術的發展，復雜疾病，尤其是精神疾病的研究引起了越來越多的重視。近日，中國科學院心理健康重點實驗室王晶研究員課題組成功開發了國際上首個注意缺陷多動障礙遺傳學數據庫(ADHDgene)，致力于為全世界的科研工作者提供關于注意缺陷多動障礙（ADHD）研究的遺傳學數據，在呈現其遺傳學研究現狀的基礎上，通過進一步的生物信息學分析，為后續ADHD的遺傳學研究提供重要基礎。 該數據庫的成功開發填補了我國精神疾病遺傳學數據庫領域的空白，自2011年8月15日上線以來受到了國內外研究者的廣泛關注，目前頁面總訪問量已達五萬余次。該數據庫可以通過http://adhd.psych.ac.cn/自由訪問。 注意缺陷多動障礙（ADHD）是兒童/青少年期常見的一種行為障礙，主要表現為長時間持續的、明顯的注意力不集中和活動過度，常伴有學習困難或品行障礙，患病率在5%左右。一般認為，ADHD是由多種生物因素、心理和社會因素所致的一種綜合征。來......閱讀全文
生物信息學數據庫和軟件的搜索實驗
實驗方法原理熟練掌握上網搜索生物信息學數據庫和軟件的方法及技能。實驗材料電腦實驗步驟一、搜索生物信息學數據庫或者軟件數據庫是生物信息學的主要內容，各種數據庫幾乎覆蓋了生命科學的各個領域。核酸序列數據庫有GenBank，?EMBL，?DDB等，蛋白質序列數據庫有SWISS-PROT，?PIR，OWL，
中國科學家構建首個創傷后應激障礙遺傳學數據庫
創傷后應激障礙(Posttraumatic stress disorder，PTSD)發生在創傷事件暴露后，是具有復雜病因的綜合征。美國2013年公布的第五版《精神障礙診斷與統計手冊》中，PTSD已從“焦慮障礙”組移到新的分組“創傷和應激相關障礙”中。經歷創傷事件是罹患PTSD的必要條件之一，關
心理所成功開發國際首個注意缺陷多動障礙遺傳學數據庫
隨著科學技術的發展，復雜疾病，尤其是精神疾病的研究引起了越來越多的重視。近日，中國科學院心理健康重點實驗室王晶研究員課題組成功開發了國際上首個注意缺陷多動障礙遺傳學數據庫(ADHDgene)，致力于為全世界的科研工作者提供關于注意缺陷多動障礙（ADHD）研究的遺傳學數據，在呈現其遺傳學研究現狀的
生物信息學教程
Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethes
蘇州大學醫學院周哲敏教授為中國疾控中心作學術報告
2023年12月13日，應中國疾控中心傳染病所的邀請，蘇州大學醫學院周哲敏教授作了題為“基于遺傳大數據的流行病主動防御技術研究”的科技學術報告，重點是微生物群體遺傳學、生物信息學及微生物組學等領域的最新成果和創新方法，中心總部和相關直屬單位的科研人員、研究生等參加學術活動。 周教授長期從事微生
生物信息學技術的原理
生物信息學在生命科學研究中起著越來越重要的作用。利用生物信息學對蛋白質組的各種數據進行處理和分析，也是蛋白質組研究的重要內容。生物信息學是蛋白質組學研究中不可缺少的一部分。生物信息學的發展，已不僅是單純的對基因組、蛋白質組數據的分析，而且可以對已知的或新的基因產物進行全面分析。在蛋白質組數據庫中儲存
生物信息學新進展
計算機技術和人類基因組計劃的發展，應運而生了一門新興的學科——生物信息學，該學科包含了兩個交叉領域的工作：用于建立現代生物學所需信息系統框架（支持生物學的信息管理系統、分析工具和通訊網絡）的研究開發工作，即傳統意義上的生物信息學（bioinformatics）；旨在理解基本生物學問題的基于計算的研究
生物信息學—促動BT與IT雙贏
? 無論是與結構基因組學對應的“基因時代”，還是與功能基因組學、蛋白質組學相應的“后基因時代”；無論你稱呼21世紀是“信息時代”、“后信息時代”，還是“生物時代”，所有這一切，都將BT(生物技術)與IT(信息技術)緊密結合起來。而這其中，無疑“生物信息學”占據了天時地利、出盡了風頭，雖然它自身及其相
生物信息學技術的技術原理
生物信息學在生命科學研究中起著越來越重要的作用。利用生物信息學對蛋白質組的各種數據進行處理和分析，也是蛋白質組研究的重要內容。生物信息學是蛋白質組學研究中不可缺少的一部分。生物信息學的發展，已不僅是單純的對基因組、蛋白質組數據的分析，而且可以對已知的或新的基因產物進行全面分析。在蛋白質組數據庫中儲存
生物芯片用于生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
Cystatin基因家族的生物信息學分析
實驗概要半胱氨酸蛋白酶抑制劑(cystatin)基因廣泛存在于植物物種中。該類基因能夠起到抑制某些病原微生物和昆蟲體內半耽氨酸蛋白酶的作用，在植物的防衛體系中起到重要作用。我們利用已經分離出植物cystatin基因的cystatin結構域為檢索序列在基因組水平上對擬南芥和水稻中的cystatin基因
生物信息學中的HSP的含義
熱休克蛋白（英文：heat shock protein ）又稱應激蛋白，是機體細胞在一些理化因素刺激后高效表達的一組蛋白質，因最先發現于果蠅唾液腺的熱應激反應中而得名，此后的研究表明，熱休克蛋白廣泛存在于人、動物、微生物和植物的細胞中，是一類在遺傳上高度保守的分子，能保護細胞并促進細胞對各種刺激所造
Science：生物信息學，神秘的新職業
今天的生物信息學家迎來了好時候。由于各個部門生成了幾乎無窮無盡的生物數據，因此形成了對于生物、統計學和計算機科學交叉領域中有經驗的專業人才的高度需求。科學家如果能夠分析大量信息并將其清晰地展示給決策制定者，就會發現自己的工作和職業生涯前途無量，尤其是在大型制藥和生物技術部門。 “在大數據時代，
美國政府停擺給中國生命科學界的警示
美國政府停擺給中國生命科學界的警示：中國需要自主的“國家生物信息學中心“ 10月1日，由于美國民主、共和兩黨尚未解決新財年的政府預算分歧，聯邦政府的非核心部門被迫關門了兩個多星期。其中醫學、藥學及生命科學從業者及研究者依賴度甚高的NCBI(美國國立生物技術信息中心)網站在此期間處
中國本土期刊《基因組蛋白質組與生物信息學報》被SCIE收錄
由中國科學院主管、中國科學院北京基因組研究所和中國遺傳學會主辦的英文期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics（簡稱GPB，中文名《基因組蛋白質組與生物信息學報》，ISSN 1672-0229，CN 11-4926/Q）于2017年8月被科睿唯安旗下的Scie
期刊數據庫更新
圖片來源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影響因子多年來備受批評，認為其扭曲了學術出版。近日，美國賓夕法尼亞州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用報告（JCR）數據庫的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受眾的背景信息。 影響因子代表期刊文章的引用次數，除以其兩年間發表
期刊數據庫更新
圖片來源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影響因子多年來備受批評，認為其扭曲了學術出版。近日，美國賓夕法尼亞州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用報告（JCR）數據庫的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受眾的背景信息。 影響因子代表期刊文章的引用次數，除以其兩年間發表的文章數量，
生物芯片技術用于生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
特征選擇在生物信息學中的應用
隨著生物信息學的發展，許多模式識別技術無法滿足處理大量不相關特征的需求，因此特征選擇技術（FS techniques）在生物信息學中的應用就變得越來越重要了。在過去的幾年里，應用特征選擇技術已經從僅僅作為一個說明性的例子發展到了建立模型所需要的先決條件了。特征選擇技術最重要的目的有3點：（1）避免過
成都生物所開發新型生物信息學軟件
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm????? ?近年來，隨著測序技術的快速發展，動物（尤其是非模式動物）全基因組數據（WGS）獲取變得簡單、便宜，這使得數據庫中全基因組數據量呈指數態勢增長。全基因組測序數據往往同時包含
生物芯片技術用于生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
－距離中國生物信息中心還有多遠
10月1日，由于美國民主、共和兩黨尚未解決新財年的政府預算分歧，聯邦政府的非核心部門被迫關門。其中就包括醫學、藥學及生命科學從業者及研究者依賴度甚高的NCBI(美國國立生物技術信息中心)網站。 NCBI 是由美國參議員Claude Pepper于上世紀80年代后期發起成立。旨在發展新的
著名遺傳學家表觀遺傳學新成果
可卡因成癮性的一個主要挑戰在于，在戒斷期之后的高復發率。但新的研究表明，在藥物戒斷過程中，我們DNA的變化可能為更有效的成癮療法開發，提供了有希望的方法。 加拿大麥吉爾大學和以色列巴爾依蘭大學的研究人員，將這項研究結果發表在最近的《Journal of Neuroscience》。他們指出，戒
生物芯片技術應用與生物信息學研究
人類基因組計劃是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計劃。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正體現HGP計劃的價值--破譯人類基因這部天書。后基因組計劃、蛋白組計劃、疾病基因組計劃等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的
德國生物信息學家發現新冠病毒新弱點
??近日，德國的生物信息學家通過計算機模型識別出人體中一種對新冠病毒繁殖至關重要的酶，如果抑制這種酶，病毒就會停止繁殖而不影響宿主細胞。該研究有助于找到對抗新冠病毒感染的新方法。 除了疫苗，尋找有效的治療新冠病毒感染的藥物也是戰勝疫情的重要手段之一。現在，來自德國感染研究中心和蒂賓根大學的德爾格
生物信息學應用：序列分析，電子克隆等初探
生物信息學可指利用信息技術管理和分析生物學數據。這就意味著生物信息學所涉及的范圍相當廣泛，從人工智能、機器人一直到基因組(genome)分析。就基因組分析這一角度來看，生物信息學主要是指核酸和蛋白質序列數據的計算機處理和分析。近年來，蛋白質結構數據的快速增長，使蛋白質三維結構的處理分析也歸入到生物信
第五屆全國生物信息學大會召開
第五屆全國生物信息學與系統生物學學術大會日前在哈爾濱召開，來自海內外的600余位生物信息學專家、學者出席會議。與會專家以“高通量時代的生物信息學與系統生物學”為主題，分別就利用基因組信息學分類細菌的新方法、細菌基因組組織形式、系統生物學在醫學發展中的應用和研究策略以及基因組非編碼
北京大學PLOS生物信息學新成果
近日，北京大學分子醫學研究所李川昀課題組與何愛彬研究員合作，在國際著名遺傳學雜志《PLOS Genetics》發表一項重要研究成果，題為“Emergence, Retention and Selection: A Trilogy of Origination for Functional De
上海生科院《Genome－Res》生物信息學新成果
十月十三日，國際基因組研究權威刊物《Genome Research》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所（中國科學院—馬普學會計算生物學伙伴研究所）的一項最新研究，題為“A probabilistic method for testing and estimating sele
癌遺傳學
Serial Analysis of Gene Expression?(SAGE)?SAGE is a powerful tool that allows the analysis of overall gene expression patterns with digital analysis.?