科學家繪制出首幅小麥基因組物理圖譜
《科學》:有助于培育出更高產和抗旱的小麥新品種 一個由法國、美國、澳大利亞等國科學家組成的研究小組日前為小麥的一個基因組繪制出了首幅物理圖譜,這一成果將有助于科學家培育出更高產和抗旱的小麥新品種。 基因組物理圖譜是指有關構成基因組的全部基因的排列和間距的信息,它是通過對構成基因組的DNA分子進行測定而繪制的。繪制物理圖譜的目的是把有關基因的遺傳信息及其在每條染色體上的相對位置線性而系統地排列出來。 這項研究由法國國家農藝研究所專家克萊蒙·費朗牽頭完成。據介紹,小麥的基因組不但數量多,且結構復雜,因此對其進行測序被視為“不可能完成的任務”。小麥的染色體共含有170億對堿基,是水稻的約40倍,是人體的約5倍,因此測序工作進展相對緩慢。 研究人員介紹說,繪制基因組物理圖譜是為基因組測序的基礎,所以他們從小麥最大的染色體3B入手。這條染色體含有10億對堿基和1036個基因重疊組,科學家們通過對基因進行標記,......閱讀全文
基因組物理圖譜的主要構架途徑
基因組物理圖譜的構建不需要經過減數分裂的世代群體,可直接利用DNA分子分析,主要有以下三種構建途徑:限制性酶圖譜。利用限制性內切酶構建圖譜,對于DNA分子長度在50kb以下的片段,一般沒有什么困難。而對于大于50kb的DNA分子,可選用稀有切點的內切酶酶切DNA。(1)用識別較多核苷酸的內切酶,如N
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲,地理分布廣,感染率高,寄生于人體盲腸,導致人體慢性感染,對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
最新測序的完整的人類基因組圖譜
最新測序的完整的人類基因組圖譜。 圖片來源:英國《新科學家》網站 20年前,科學家宣布讀取了一個人的全部脫氧核糖核酸(DNA),其實,他們漏掉了少許。現在,由于讀取DNA方法的改進,科學家終于可以從頭到尾讀取人類的全部基因組了!據生物預印本網站(biorxiv)近日報道,美國科學家對全部
科學家繪制出首幅小麥基因組物理圖譜
《科學》:有助于培育出更高產和抗旱的小麥新品種 一個由法國、美國、澳大利亞等國科學家組成的研究小組日前為小麥的一個基因組繪制出了首幅物理圖譜,這一成果將有助于科學家培育出更高產和抗旱的小麥新品種。?基因組物理圖譜是指有關構成基因組的全部基因的排列和間距的信息,它是通過對構成基因組的DNA分子進行
科學家成功繪制-首幅小麥基因組物理圖譜
一個由法國、美國、澳大利亞等國科學家組成的研究小組日前為小麥的一個基因組繪制出了首幅物理圖譜,這一成果將有助于科學家培育出更高產和抗旱的小麥新品種。 基因組物理圖譜是指有關構成基因組的全部基因的排列和間距的信息,它是通過對構成基因組的DNA分子進行測定而繪制的。繪制物理圖譜的目的是把有關基因的遺傳
物理圖譜的定義
物理圖譜是指有關構成基因組的全部基因的排列和間距的信息,它是通過對構成基因組的DNA分子進行測定而繪制的。繪制物理圖譜的目的是把有關基因的遺傳信息及其在每條染色體上的相對位置線性而系統地排列出來。DNA物理圖譜是指DNA鏈的限制性酶切片段的排列順序,即酶切片段在DNA鏈上的定位。因限制性內切酶在DN
羅氏454測序用于野生雙峰駝基因組圖譜繪制
中國及中亞細亞溫帶荒漠地區的駱駝均為雙峰駱駝(Bactrian camel),中國的雙峰駝集中分布于內蒙古西部、寧夏、新疆、甘肅的溫帶荒漠和荒漠草原區,占全國總駝數的95%。且中國尚有數量比大熊貓還少的世界珍稀瀕危動物―野生雙峰駝存在。內蒙古阿拉善盟是中國駱駝最多的地區,擁有雙峰駝10萬峰以
最大動物基因組圖譜——南極磷蝦基因組圖譜破譯
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ??? Cell官網截圖。黃海水產研究所供圖 ? 日前,由中國水產科學研究院黃海水產研究所聯合青島華大基因研究院、德國阿爾弗雷德?魏格納研究所、澳大利亞聯邦科學
我國學者成功完成小麥A基因組的測序和精細圖譜繪制
小麥是全球最重要的糧食作物,養活了世界上40%的人口,提供了人類所需熱能和蛋白質的20%。我國是世界上小麥生產和消費大國,常年種植面積為2,400萬公頃左右,年產量近1.3億噸。生產上廣泛種植的普通小麥是一個經兩次自然雜交而形成異源六倍體,含有A、B和D三個亞基因組,其基因組大(約17 Gb,是
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃,那時用的方法叫做雙脫氧終止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中,DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸)來作為原料,但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的,但與普通PCR不同,它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
Sanger采用SMRT測序技術獲得-NCTC-3,000株細菌基因組圖譜
英國著名的Wellcome Sanger研究所與Pacific Biosciences(PacBio)合作已完成了對英國公共衛生部國家標準菌庫NCTC中 3,000多株細菌的基因組的測序工作,其中包括一些世界上最危險的細菌,如引起鼠疫、痢疾和霍亂的細菌。通過解碼DNA,研究人員能夠更好地了解細菌
我國完成桑蠶大規模基因組重測序和遺傳變異圖譜構建
北京時間8月28日凌晨2時,由深圳華大基因研究院與西南大學合作的研究成果“40個基因組的重測序揭示了蠶的馴化事件及馴化相關基因”在國際權威學術刊物《科學》上發表,這是科學家繼2003年在家蠶基因組研究領域取得進展后的又一重要成果。 據悉,科學家共獲得了40個家蠶突變品系和中國野桑蠶的全基因
Nature公布大麥基因組圖譜
大麥是世界上最重要的糧食作物之一,17日Nature公布了目前為止最完善的大麥基因組測序圖譜。這項由美國農業部主導的大工程,在德國、日本、芬蘭、澳大利亞、英國、美國和中國科學家們的共同努力下,歷經六年終于取得了重大進展。大麥基因組圖譜將成為人們提高大麥產量、增強大麥抗蟲抗病能力、增加大麥營養價值
解碼“基因組學之父”桑格:測序,測序,測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’,他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎,徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天,65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗,轉身走出實驗室,宣布自己正式退休。那一年是1983
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器,于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫,從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道,以節約試劑用量。
認識泛基因組測序
什么是泛基因組?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome,pan源自希臘語‘παν’,全部的意思),泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年,Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接,發現了個體獨有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“
PNAS:甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值,日前西班牙的九個研究中心通力合作,利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組,科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組,文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
《細胞》:單細胞測序助力基因重組圖譜
來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了來自一個成人男子91個
首次繪制小麥表觀基因組圖譜
最近,英國利物浦大學的科學家們,對小麥中調節基因活性的遺傳性分子變化,進行了首次全基因組范圍的調查,這可能成為提高作物育種技術的一種新工具。相關研究結果發表在最新一期的《Genome Biology》。延伸閱讀:權威期刊發布首個小麥單體型圖譜。 表觀遺傳標記是一種化學標簽,將自己附著在DNA上
首個家雞基因組圖譜繪制完成
西南大學教授徐洛浩課題組以中國特有家雞品系胡須雞為材料,在國際上率先繪制出首個家雞全基因組圖譜。2月13日,相關研究成果以《家雞基因組完成圖的演化分析》為題,發表在美國《國家科學院院刊》上。這是繼去年人類基因組完成圖公布以來,首個發表的脊椎動物基因組完成圖,也是基因組完成圖譜繪制技術首次在經濟動物中
基因組圖譜的方法和意義
中文名稱基因組圖譜英文名稱genomic map定 義展示一種生物全基因組結構的圖譜。按建立圖譜的研究目的方法和精細程度,可以有不同的形式,包括以遺傳學方法建立的遺傳連鎖圖譜,按距離繪出基因位置分布的物理圖譜,經測定核酸序列建立的核苷酸序列圖譜,以及標記出可表達序列的轉錄圖譜等。應用學科生物化學與
揭秘:帝王蟹的基因組圖譜
科學家成功獲得高質量帝王蟹基因組圖譜 帝王蟹 唐伯平供圖 帝王蟹基因組染色體圖譜 唐伯平供圖 帝王蟹和其他泛甲殼動物的系統演化關系 唐伯平供圖 近日,《分子生態資源》發表了首個歪尾類螃蟹的高質量基因組圖譜,即一種重要經濟蟹類藍帝王蟹(Paralithodes platypus)的基因組
鳥槍法如何測序
全基因組鳥槍法測序(Whole Genome Shotgun Sequencing)無需構建各類復雜的物理圖譜和遺傳圖譜,采用最經濟有效基因組鳥槍法測序/鳥槍法Shotgun測序(Whole Genome Shotgun Sequencing)無需構建各類復雜的物理圖譜和遺傳圖譜,采用最經濟有效的實
454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目
一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代,其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1,科學家通過454全基因組測序,掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因,包括抗病能力、牛奶產量,這些性狀已通過北美的當
物理圖譜進行基因定位的方法介紹
原核生物 DNA分子上缺乏天然的容易識別的標記,可用限制圖譜和部分變性圖的測定來彌補這一不足。各種限制性核酸內切酶具有各自的識別順序。這些識別順序可以作為DNA部位的標記,用不同的限制酶處理同一DNA分子,通過對酶切產生的DNA片段的大小和位置的分析,可以繪制出某一 DNA分子的限制圖譜。此外,每一
我國完成小麥A基因組測序
本報訊(記者丁佳)5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和
測序解讀基因組,真的好嗎?
測序解讀基因組,真的好嗎? “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire,在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說,“尤其是對自己基因組信息的了解。” 雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年,但
白肉靈芝完成基因組測序
?在韶關產業園種植的白肉靈芝。吳清平團隊 供圖 近日,中國工程院院士、廣東省科學院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了第一個白肉靈芝全基因組測序。據悉,這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3:基因,基因組,遺傳學》(G3-Genes Genomes Genet
我國完成小麥A基因組測序
?? 5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征,對深入和
簡化基因組測序好做嗎
簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲芯片技術或其他實驗手段降低物種基因組復雜程度,進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing)。這些技