水生所完成模式硅藻的蛋白質組精細圖譜
硅藻是一類重要的單細胞光合真核生物，分布廣泛，提供了地球上約20%的初級生產力，對整個地球生物圈意義重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物，其基因組序列于2008年公布，但目前基因組的注釋仍很不完善。蛋白基因組學(Proteogenomics)是利用蛋白質組學數據，尤其是高精度的串聯質譜數據，結合基因組和轉錄組數據對基因組進行深度注釋。中國科學院水生生物研究所研究員葛峰學科組前期采用蛋白基因組學的研究策略和方法，完成了模式藍細菌的基因組深度解析 (PNAS，2014，111（52）：E5633-E5642)并開發了針對原核生物的蛋白基因組學專業分析軟件GAPP（Molecular & Cellular Proteomics. 2016；15(11):3529-3539）。在這些工作的基礎上，葛峰學科組對三角褐指藻的基因組進行了深度解析并構建了蛋白質組精細圖譜。 該......閱讀全文
水生所完成模式硅藻的蛋白質組精細圖譜
硅藻是一類重要的單細胞光合真核生物，分布廣泛，提供了地球上約20%的初級生產力，對整個地球生物圈意義重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物，其基因組序列于2008年公布，但目前基因組的注釋仍很不完善。蛋白基因組學(Proteogenomics)
迄今最精細黑猩猩腦圖譜——黑猩猩腦網絡組圖譜發布
近期，中國科學院自動化研究所腦網絡組研究團隊聯合國內外科研機構，發布了迄今為止最精細的黑猩猩腦圖譜——黑猩猩腦網絡組圖譜（ChimpBNA）。這一成果為比較神經科學研究提供了重要工具，并為探討人腦演化提供了新視角。黑猩猩是人類最親近的靈長類親戚之一，與人類共享約600萬至800萬年前的共同祖先。盡管
科學家完成糜子全基因組精細圖譜
1月25日，《自然-通訊》（Nature Communications）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心張蘅研究組和朱健康研究組題為The genome of broomcorn millet 的研究論文。該研究完成了糜子基因組精細圖
研究團隊合作發布白木香基因組精細圖譜
近日，中國熱帶農業科學院熱帶生物技術研究所和中國農業科學院深圳農業基因組研究所崔鵬團隊合作發布了白木香基因組精細圖譜，相關研究結果已發表在GigaScience期刊。該基因組精細圖譜的發布將為野生白木香種群保護生物學、沉香結香機制和香味基因及樹種的進化研究奠定良好基礎，也為進一步基于基因組的白木
我國科學家完成扇貝基因組精細圖譜繪制
日前，中國海洋大學教授包振民團隊完成了扇貝基因組精細圖譜繪制，探究原始動物祖先染色體核型進化、軀體結構多樣性產生、眼睛起源及其調控機制等，在動物宏觀進化研究領域取得重要進展。相關成果日前發布于《自然.生態學與進化》。 動物界99%的物種隸屬于雙側對稱動物，進化學家推測這些雙側對稱動物可能起
科學家繪制褐牙鲆全基因組精細圖譜
近日，中國水產研究院黃海水產研究所研究員陳松林領導的研究組與上海海洋大學、德國維爾茨堡大學、葡萄牙阿爾加夫大學、深圳華大基因研究院等單位合作，破譯了褐牙鲆全基因組序列，通過與半滑舌鰨全基因組比較分析，初步揭示了比目魚變態發育的分子機制。該研究成果發表于《自然—遺傳學》。 通過與半滑舌鰨全基因組
科學家繪制褐牙鲆全基因組精細圖譜
近日，中國水產研究院黃海水產研究所研究員陳松林領導的研究組與上海海洋大學、德國維爾茨堡大學、葡萄牙阿爾加夫大學、深圳華大基因研究院等單位合作，破譯了褐牙鲆全基因組序列，通過與半滑舌鰨全基因組比較分析，初步揭示了比目魚變態發育的分子機制。該研究成果發表于《自然—遺傳學》。 通過與半滑舌鰨全基因組
云南怒江草果全基因組精細圖譜繪制成功
??從20世紀70年代開始，云南省怒江州就開始種植草果，到2020年，種植面積已達111萬畝，不僅是全國草果的核心產區，也是當地群眾脫貧致富的重要經濟作物。 為了加快提高草果遺傳改良效率，培育高產、抗病、優質、安全新品種，對從源頭創新保障草果產業健康可持續發展，2019年9月，怒江州聯合華南農業
Genome－Biology：普通小麥精細表觀組圖譜繪制成功
7月15日，Genome Biology期刊在線發表中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所張一婧研究組與南京農業大學張文利研究組等合作完成的研究論文。該工作生成并繪制普通小麥精細的表觀組圖譜，以此為基礎針對性開發整合計算流程對全基因組順式調控元件進行了系統的挖掘與鑒定，并初步探索
中國啟動十萬人基因組計劃：繪制國人精細基因組圖譜
科學家們希望通過繪制中國人精細基因組圖譜，來研究疾病健康和基因遺傳的關系。 此次啟動的“中國十萬人基因組計劃”覆蓋地域包含我國主要地區，涉及人群除漢族外，還將選擇人口數量在500萬以上的壯族、回族等9個少數民族。 基因是DNA上有遺傳效應的片斷，人類的生、老、病、死等都與基因有關。而基因組和
科研人員首繪小黃魚全基因組精細圖譜
17日，記者從浙江省農科院獲悉，該院水生生物研究所小黃魚科研團隊與美國奧本大學、廈門大學合作，首次完成小黃魚全基因組組裝注釋與精細圖譜繪制，為建立小黃魚基因組選擇育種、培育高產抗病優質良種提供了基因資源和技術手段，相關研究論文近日在線發表于學術期刊《分子生態學資源》上。 小黃魚是中國重要的海產經
首個水稻全景定量蛋白質組圖譜發布
中國農業科學院生物技術研究所近日聯合國內多家單位，共同繪制了水稻全景定量蛋白質組圖譜，為水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白質表達量資源，也為基因組學、蛋白質組學等多組學數據支撐作物智能設計育種提供了新思路。相關研究成果發表在國際期刊《自然植物》上。 植物的所有組織、器官中都富含蛋白質，它是構成
首個水稻全景定量蛋白質組圖譜發布
中國農業科學院生物技術研究所近日聯合國內多家單位，共同繪制了水稻全景定量蛋白質組圖譜，為水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白質表達量資源，也為基因組學、蛋白質組學等多組學數據支撐作物智能設計育種提供了新思路。相關研究成果發表在國際期刊《自然植物》上。植物的所有組織、器官中都富含蛋白質，它是構成細胞和生
Cell重要成果：繪制凋亡蛋白質組圖譜
斯克里普斯研究所的科學家們同時繪制出了細胞中兩種最重要的蛋白質修飾類型的圖譜，揭示了在凋亡這一重要細胞過程中它們之間廣泛的協同作用。相關論文發表在7月20日的《細胞》(Cell)雜志上。 磷酸化(Phosphorylation)和蛋白質水解(proteolysis)幾乎總是被獨立開展研究。
斜紋夜蛾精細基因圖譜繪出
28日，記者從西南大學獲悉，該校家蠶基因組生物學國家重點實驗室聯合法國、日本、美國等多國研究機構，在全球首次繪制出斜紋夜蛾精細基因圖譜，并于25日發表于國際權威期刊《自然·生態學與進化》上。該研究成果揭示了斜紋夜蛾的高質量基因組精細圖譜，以及群體變異圖譜和基因表達圖譜，可為其防治提供科學依據。
我國學者成功完成小麥A基因組的測序和精細圖譜繪制
小麥是全球最重要的糧食作物，養活了世界上40%的人口，提供了人類所需熱能和蛋白質的20%。我國是世界上小麥生產和消費大國，常年種植面積為2,400萬公頃左右，年產量近1.3億噸。生產上廣泛種植的普通小麥是一個經兩次自然雜交而形成異源六倍體，含有A、B和D三個亞基因組，其基因組大（約17 Gb，是
蛋白質組學牛人利用新技術分析蛋白質圖譜
蛋白質組(proteomics)分析是針對不同條件下細胞中蛋白的功能和特性進行研究的統稱，這一領域的研究一直以來都落后于基因組研究，后者在技術創新方面取得了不少成果，一些令人眼花繚亂的快速基因組圖譜繪制技術，還有無需借助核心實驗室設備就能完成實驗的技術，都令我們印象深刻。 但是與基因組研究
首個大豆全景定量蛋白質組圖譜發布
近日，中國農業科學院生物技術研究所聯合多家單位，繪制出大豆全景定量蛋白質組圖譜，揭示了RNA甲基化在調控大豆蛋白表達量中的作用，并利用蛋白質組數據挖掘出調控大豆發育的新表觀因子MTBa。相關研究成果發表在《細胞—基因組學》（Cell Genomics）上大豆基因組數據盡管可以提供大量信息，但不足以闡
單細胞蛋白質組學：讓細胞個體研究更加精細
????細胞是生命活動的基本單元。對細胞的精確認知是理解細胞在生理和病理過程中功能的先決條件。????在組織、器官或個體中，細胞具有非常大的異質性，而傳統的研究手段針對大量細胞進行分析，得到的是大量細胞的平均結果，無法區分不同細胞個體對于大量樣品結果的具體貢獻值，從而忽視或掩蓋了單細胞的個體差異，不
第一張人類器官蛋白質組圖譜
在廣州南方醫科大學舉行的第五屆中國蛋白質組學大會暨首屆粵港蛋白質組學學術交流會上，由中國科學家領銜的“人類蛋白質組計劃”有望實現肝癌診治突破性進展。 據了解，該計劃實施3年來，圍繞人類肝臟蛋白質組的表達譜等九大科研任務，我國科學家成功測定出6788個高可信度的中國成人肝臟蛋白質，系統構建了國際上
破解了香氣之謎－蠟梅的染色體水平精細基因組圖譜公布
“一花香十里，更值滿枝開。”凌寒怒放的蠟梅，是萬花凋零的寒冬里一道亮麗的風景，其香味濃郁而獨特，成為歷代文人墨客揮筆高歌的對象。蠟梅為何冬季開花？其獨特香味由何而來？蠟梅 華中農大供圖 近日，華中農業大學劉秀群、趙凱歌研究組和金雙俠研究組聯合西南林業大學陳龍清研究組，在《基因組生物學》在線發表
B染色體精細圖譜和功能研究
早在一個多世紀前發現B染色體在很多植物、動物和真菌基因組中廣泛存在。B染色體對于個體的生命活動來說不是必需的，但它們仍然通過不同的機制存在于種群中。例如玉米B染色體不與任何A染色體配對，其傳遞不遵循孟德爾遺傳定律，花粉第二次有絲分裂B染色體會發生不分離 (nondisjunction)，包含B染
豬胚胎骨骼肌染色精細圖譜開放
? 豬胚胎骨骼肌染色體開放區分布及其對基因表達的影響 中國農科院供圖 近日，中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所豬遺傳育種科技創新團隊成功繪制了豬胚胎發育全期骨骼肌基因組染色質開放區域精細圖譜，鑒定出了調節肌肉發育的順式調控元件及相關基因，為進一步研究豬胚胎骨骼肌發育相關基因的調控動力學奠定了基
科學家全面繪制人類健康與疾病蛋白質組圖譜
復旦大學附屬華山醫院教授郁金泰、毛穎團隊與復旦大學類腦智能科學與技術研究院研究員程煒、教授馮建峰團隊合作，全面繪制了人類健康與疾病蛋白質組圖譜，并結合人工智能大數據分析方法構建了疾病診斷預測模型以及發現了26個藥物治療新靶點，為精準醫學的實施提供了重要科學依據。11月22日，相關研究發表于《細胞》。
用蛋白質組學方法繪制磷酸化位點圖譜
方案1 用帶有 Fe(Ⅲ) 和 Ga(Ⅲ)的 IMAC 純化磷酸化多肽 方案2 在 MALDI 分析之前或之后對磷酸化多肽進行堿性磷酸酶處理 方案3 結合固定化金屬離子親和介質和 MALDI-TOF-MS 直接分析方法對磷酸化多肽進行特征分析實驗 方
最大動物基因組圖譜——南極磷蝦基因組圖譜破譯
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ??? Cell官網截圖。黃海水產研究所供圖 ? 日前，由中國水產科學研究院黃海水產研究所聯合青島華大基因研究院、德國阿爾弗雷德?魏格納研究所、澳大利亞聯邦科學
迄今為止最精細的黑猩猩腦圖譜發布
1月14日，《中國科學報》從中國科學院自動化研究所（以下簡稱自動化所）獲悉，該研究所腦網絡組研究團隊聯合國內外多個科研機構，發布了迄今為止最精細的黑猩猩腦圖譜——黑猩猩腦網絡組圖譜（Chimpanzee Brainnetome Atlas, ChimpBNA）。為了促進全球科研人員的合作研究，研究團
人類血漿蛋白質組遺傳圖譜公開－有助鑒定新的治療靶點
英國《自然》雜志6月6日發表了一項遺傳學最新成果：劍橋大學研究團隊量化了人體血漿中的3000多種蛋白質，成功繪制出人類血漿蛋白質組遺傳圖譜，其中89%前所未知。該研究發現的遺傳變異與個體蛋白水平之間的聯系，或意味著可以借此鑒定出新的治療靶點，并將現有藥物用于治療新的疾病。 血漿蛋白是指血漿中的
十年大型項目，繪制人類蛋白質組圖譜
由瑞典皇家理工學院的Mathias Uhlén領導的一項長達十年之久的研究項目——人類蛋白質圖集（Human Protein Atlas，HPA）項目，在本周發布了1300萬張全身人類蛋白質“圖像”。通過制備出熒光標記抗體，將其應用于保存組織的薄切片，觀察組織的顏色以及附著在組織上的抗體，研究人
高紹榮Cell－Reports：小鼠植入前胚胎蛋白質組動態圖譜
近日，同濟大學高紹榮課題組與華東師范大學廖魯劍課題組合作在Cell子刊《Cell Reports》雜志在線發表題為“Protein Expression Landscape of Mouse Embryos during Pre-implantation Development”的文章。首次報道