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  • 蛋白質組學實驗技術大全

    每一個領域的發展都是基于技術的進步和革新,蛋白質組學亦然。蛋白質的可變性和多樣性等特殊性質導致了蛋白質研究技術遠遠比核酸技術要復雜和困難得多,但正是這些特性參與和影響著整個生命過程。在開始實驗之前,先看看這篇技術簡介吧。一 蛋白質與DNA相互作用在許多的細胞生命活動中,例如DNA復制、mRNA轉錄與修飾以及病毒的感染等都涉及到DNA與蛋白質之間的相互作用的問題。隨著重組DNA技術的發展,人們已分離到了許多重要的基因。現在的關鍵問題是需要揭示環境因子及發育信號究竟是如何控制基因的轉錄活性的。為此需要:1. 鑒定分析參與基因表達調控的DNA元件;2. 分離并鑒定這些順式元件特異性結合的蛋白質因子。這些問題的研究都涉及到DNA與蛋白質之間的相互作用。研究DNA-蛋白質相互作用主要包括以下實驗方法:1 凝膠遷移實驗(EMSA)EMSA主要基于蛋白-探針復合物在在凝膠電泳過程中遷移較慢的原理。根據實驗設計特異性和非特異性探針,當......閱讀全文

    代謝組學樣本收集答疑解惑

      樣本收集是代謝組學研究的第一步,是保障代謝組學研究結果可靠性的最重要的環節之一。根據不同的研究目的該選取何種生物樣本?不同種類的生物樣本的規范收集流程是什么?有哪些注意事項(抗凝劑、凍融、抑菌劑等使用細節)?如何保存生物樣本?可保存多久等等?這些都是代謝組學實驗中小伙伴經常咨詢的問題,本文將針對

    空間轉錄組測序樣本準備指南

    現有空間轉錄組研究平臺是基于冰凍樣本進行研究,所以在樣本凍存前至少10分鐘,將異戊烷和液氮浴準備好(之所以用異戊烷而不直接用液氮進行速凍,是因為液氮沸點比較低,直接液氮處理可能在沸騰過程中使組織周圍形成空穴,導致不同區域降溫不同步而改變內部形態,甚至組織碎裂)。然后用鑷子或者刮刀將新鮮組織轉移到異戊

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      現有空間轉錄組研究平臺是基于冰凍樣本進行研究,所以在樣本凍存前至少10分鐘,將異戊烷和液氮浴準備好(之所以用異戊烷而不直接用液氮進行速凍,是因為液氮沸點比較低,直接液氮處理可能在沸騰過程中使組織周圍形成空穴,導致不同區域降溫不同步而改變內部形態,甚至組織碎裂)。然后用鑷子或者刮刀將新鮮組織轉移到

    不同標記與非標記蛋白質組學定量準確性分析研究

      通過質譜法進行定量蛋白質組分析為生物醫學探索研究提供非常重要的途徑。 然而,了解生物樣品中的定量限制對于準確判斷結果非常重要。通過使用加入已知濃度的蛋白質標準品的復雜樣本,科學家們研究了無標記(label free)和基于標記(TMT和iTRAQ)的肽定量的定量限制,包括前體混合的評估及其對同重

    蛋白質組與蛋白質組學簡介2

    3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合,然后將DNA從被修飾的堿基處切割,電泳分離,結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾,不能切斷,可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白

    蛋白質組與蛋白質組學簡介1

    一、蛋白質組概念:一個細胞、一個組織或一個機體全部基因所表達的全部蛋白質。 二、蛋白質組學研究范疇 1.蛋白質和蛋白質間 2.蛋白質和核酸之間 3.蛋白質及其組成質點的分離、分析、鑒定 4.蛋白質結構分析 5.生理、病理或不同發育狀態下蛋白質組表

    PLATO:革命性的高分辨率空間質譜蛋白質組學平臺

      空間蛋白質組學能夠在傳統蛋白質組學提供豐富分子信息的基礎上,進一步揭示分子在細胞或組織中的空間分布,對于系統性地理解生物功能、疾病機制和治療效果至關重要。《Nature Methods》選擇空間蛋白質組學作為2024年度方法[1],也反映了行業對這項技術應用前景的關注和認可。現有質譜空間蛋白質組

    外周血單個核細胞樣本的制備

    實驗方法原理 血液是天然的單個細胞分散的細胞懸液,血細胞在生理狀態下呈分散的游離狀態。它是流式細胞分析的理想樣品。血液中的主要細胞成分為白細胞、紅細胞和血小板;而其中白細胞主要成分又分為淋巴細胞、單核細胞和粒細胞。但在血細胞中一般檢測單個核細胞較為多見。實驗材料 外周血試劑、試劑盒 肝素生理鹽水實驗

    外周血單個核細胞樣本的制備

    實驗方法原理血液是天然的單個細胞分散的細胞懸液,血細胞在生理狀態下呈分散的游離狀態。它是流式細胞分析的理想樣品。血液中的主要細胞成分為白細胞、紅細胞和血小板;而其中白細胞主要成分又分為淋巴細胞、單核細胞和粒細胞。但在血細胞中一般檢測單個核細胞較為多見。實驗材料外周血試劑、試劑盒肝素生理鹽水實驗步驟一

    ELISA樣本制備及注意事項(二)

    七、ELISA 實驗中關節滑液的采集、處理和保存1、口腔關節:患者取坐位,常規消毒后,作皮下及關節后區局部浸潤麻醉。然后囑患者大張口,采用裝有2ml生理鹽水的注射器(5號針頭)作關節上腔穿刺,髁后進針,針尖方向斜向前、內、上,抵達關節結節后斜面后稍后退,回抽如發現有淡黃色液體,即表明已進入關節上腔,

    幾種典型掃描電鏡生物樣本制備

    隨著科學技術的發展,掃描電子顯微鏡技術已成為檢測物質性能和表征微觀結構的重要手段,被廣泛應用于食品學、生物學、醫學、高分子材料等領域[1]。掃描電子顯微鏡在科學研究中有廣泛應用,如觀察不同淀粉顆粒的超微形貌[2]、蛋白復合膜的微觀結構[3]、淀粉納米顆粒的研究[4]及不同儲藏過程中肉食類微結構的變化

    生物芯片生物樣本的制備方法

    分離純化、壙增、獲取其中的蛋白質或DNA、RNA并用熒光標記, 才能與芯片進行反應。用DNA芯片做表達譜研究時,通常是將樣品先抽提MRNA,然后反轉錄成CDNA。同時摻入帶熒光標記的dCTP或dUTP。

    ELISA樣本制備及注意事項(一)

    一、血清的采集、處理和保存1、真空采血針采集新鮮血液,加入無菌試管中;2、采血后室溫靜置1小時;3、將采集血液用離心機4℃,2500rpm離心10min;4、取上清。分裝凍存備用:2-8℃下,可放置保存24-48小時;-20℃下,可放置保存1個月;-80℃下,可放置保存6個月;5、根據你的實驗需要,

    新鮮實體組織樣本的制備(機械法)

    剪碎法網搓法研磨法實驗方法原理機械法分散實體組織。用手術剪刀剪碎組織、用鋒利的解剖刀剁碎組織或用勻漿器制成組織勻漿,再用細注射針頭抽吸細胞或用 300 日尼龍網濾出單細胞懸液;采用網搓法也能獲得大量細胞。機械法易造成細胞碎片和細胞團塊,所以常與其他方法配合使用。實驗材料組織 ? ? ? ? ?

    定量蛋白質組表達譜分析技術iTRAQ/TMT

      iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技術是分別由美國AB Sciex公司和Thermo公司研發的多肽體外標記定量技術。這兩種技術采用2-10種穩定同位素標簽,通過特異性 標記多肽的

    蛋白質組,蛋白質組學及研究技術路線

    基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類

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    單細胞鑒定6000+蛋白,多場景實測數據震撼來襲!

    過去幾年里,單細胞蛋白質組學技術取得了長足發展,單細胞蛋白質組學逐漸走向成熟,后續有望廣泛應用于腫瘤異質性分析、免疫學研究、發育生物學、神經科學以及精準醫學等領域。然而,從技術發展成熟到實際場景應用分析的過程中,我們仍面臨諸多挑戰:1.當前單個細胞的蛋白鑒定深度還有待進一步提升以更好回答科學問題;2

    PBI宣布蛋白組學和前列腺癌癥活體組織樣本制備方法改進

      分析測試百科網訊 PBI公司近日宣布,蘇黎世聯邦理工大學的分子系統生物學研究所的醫藥博士tiannan Guo在蛋白質組學和前列腺癌癥活體組織樣本制備方法改進方面提出了自己的研究數據。  郭博士與其同事,結合了公司的Barocycler NEP2320和MicroPestle的耗材(P

    Agilent在HUPO上推出復雜蛋白質組標準

    安捷倫科技在第八屆HUPO會議上推出新的復雜蛋白質組標準   9月28日,安捷倫科技公司在第八屆HUPO會議上推出新的復雜蛋白質組標準,對于蛋白質生物標志物發現的研究者來說,這個標準可創造性地幫助他們通過基于質譜工作流的認證來進行蛋白質鑒定。這是對基于質譜的蛋白質組工作流進行資質測試的最先進的標準

    紅細胞凝集試驗的樣本的制備方法

    1.?阿氏液(Alsever):即紅細胞保養液枸櫞酸鈉(5H2O) 0.80g枸櫞酸(H2O) 0.055g葡萄糖 2.05g氯化鈉 0.42g雙蒸水 加至 100 ml將以上試劑加熱溶解于雙蒸水中,調整pH至6.8,115℃滅菌10min,4℃保存備用。2. 0.5% 雞紅細胞制備方法先用滅菌注射

    高通量測序中植物樣本的制備方法

    高通量測序技術已廣泛應用于植物研究中,但植物材料中較多的蛋白質、多糖以及酚、脂類等次生代謝物質,提取核酸的難度往往比動物或原核生物樣本大,因此如何從植物樣本中得到高質量的核酸進行后續的測序,成為在植物高通量測序應用中的首要因素。根據核酸類型,可有如下制備方法可參考: 1. 植物基因組 DNA

    如何采集制備檢驗所需的食品樣本

    一、采樣的原則和目的首先正確采樣必須遵守兩個原則:第一,采集的樣品要均勻,有代表性,能反映全部被測食品的組分、質量和衛生狀況;第二,采樣過程中要設法保持原有的理化指標,防止成分逸散或帶入雜質。其次食品采樣檢驗的目的在于檢驗試樣感官性質上有無變化,食品的一般成分有無缺陷,加入的添加劑等外來物質是否符合

    新鮮實體組織樣本的制備(酶消化法)

    實驗方法原理對實體組織分散的作用原理主要有3個方面:① 可以破壞組織間的膠原纖維、彈性纖維等;② 可以水解組織間的黏多糖等物質;③ 可以水解組織細胞間的緊密聯結裝置的蛋白質物質。實驗材料組織酶儀器、耗材試管離心管尼龍網實驗步驟1. 將適合于酶消化的組織置于離心管中。2. 將選好的酶溶掖 1~2 ml

    有機元素分析儀的樣本制備原則

    樣品的制備注意事項1、在樣品稱量過程中進行包養時,值得注意的是不要弄破樣品皿,不然,樣品的重量就會不準確,會導致結果沒有效果。2、待測化合物含有磷、氟、硅及金屬陽離子不為氧模態所允許,在進行分析前,含礦物質樣品必須將種類礦物除去。3、由于元素分析儀測定的元素含量中有氫元素的含量,因此待測樣品不能含有

    新鮮實體組織樣本的制備(酶消化法)

    實驗方法原理對實體組織分散的作用原理主要有3個方面:① 可以破壞組織間的膠原纖維、彈性纖維等;② 可以水解組織間的黏多糖等物質;③ 可以水解組織細胞間的緊密聯結裝置的蛋白質物質。實驗材料組織 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

    如何修煉成流式高手之科研樣本制備

    為什么同一個配色,同一份實驗步驟,但是最后實驗結果卻也變成“買家秀與賣家秀”。?? ??我們來看看他的實驗記錄,?但是,如果是在做胞內染色的時候,死細胞對于實驗結果的影響更大,但是普通的PI或者7AAD ,有會因為細胞需要固定,破膜而使所有細胞都是陽性。這個時候我們就需要使用到通用型死活細胞染料,這

    快速檢測樣本制備的一般方法

    ??? 糧食、煙葉、茶葉等干燥產品:將樣本全部磨碎,也可以四分法縮分,取部分樣本磨碎全部通過20目篩,四分法再縮分。 ????肉食品類:切細,絞肉機反復絞三次,混合均勻后縮分。 ??? 水產、禽類:將樣本各取半只,去除非食用部分,食用部分切細,絞肉機反復絞三次,混合均勻后縮分。 ????罐頭食品:開

    新鮮實體組織樣本的制備(酶消化法)

    實驗方法原理 對實體組織分散的作用原理主要有3個方面:① 可以破壞組織間的膠原纖維、彈性纖維等;② 可以水解組織間的黏多糖等物質;③ 可以水解組織細胞間的緊密聯結裝置的蛋白質物質。實驗材料 組織酶儀器、耗材 試管離心管尼龍網實驗步驟 1. 將適合于酶消化的組織置于離心管中。2. 將選好的酶溶掖 1~

    蛋白質提取與制備

    1蛋白質提取與制備蛋白質提取與制備蛋白質種類很多,性質上的差異很大,既或是同類蛋白質,因選用材料不同,使用方法差別也很大,且又處于不同的體系中,因此不可能有一個固定的程序適用各類蛋白質的分離。但多數分離工作中的關鍵部分基本手段還是共同的,大部分蛋白質均可溶于水、稀鹽、稀酸或稀堿溶液中,少數與脂類結合

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