高通量測序中植物樣本的制備方法
高通量測序技術已廣泛應用于植物研究中，但植物材料中較多的蛋白質、多糖以及酚、脂類等次生代謝物質，提取核酸的難度往往比動物或原核生物樣本大，因此如何從植物樣本中得到高質量的核酸進行后續的測序，成為在植物高通量測序應用中的首要因素。根據核酸類型，可有如下制備方法可參考： 1. 植物基因組 DNA 主要應用于植物的全基因組測序、重測序等。植物的全基因組測序要求基因組 DNA 量至少在 50~100 μg，可采用經典的 CTAB 抽提方法，配方和步驟如下： CTAB 裂解液配方：100 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0)，20 mmol/L EDTA，1.4mol/L NaCl，2%CTAB，5% β-巰基乙醇 (隨用隨加)， 實驗步驟： (1) 取 1-50 g 新鮮植物材料，于液氮中研成粉。 (2) 將凍粉轉入預冷的離心管中，立即加入等體積 (w/v) 2×CTAB 提取緩沖液，65℃ 保溫 10-20 分......閱讀全文
基因組高通量測序的原理
測序方案建立在雙脫氧測序法(Sanger等，1977)的基礎上。為了從每一克隆插入片段兩端成對地進行測序，每一個質粒模板DNA板應配備兩個384孔循環測序反應板。測序反應采用Big Dye Terminator chemistry version 3．1(AppliedBiosystems)和標準M
高通量測序中植物樣本的制備方法
高通量測序技術已廣泛應用于植物研究中，但植物材料中較多的蛋白質、多糖以及酚、脂類等次生代謝物質，提取核酸的難度往往比動物或原核生物樣本大，因此如何從植物樣本中得到高質量的核酸進行后續的測序，成為在植物高通量測序應用中的首要因素。根據核酸類型，可有如下制備方法可參考： 1. 植物基因組 DNA
高通量測序
高通量測序技術又稱“下一代”測序技術，以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序包括：大規模平行簽名測序、聚合酶克隆、454焦磷酸測序、離子半導體測序和DNA 納米球測序等技術。 高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條DN
首個蕨類植物基因組測序完成
蕨類植物是地球上最多樣化的植物種群之一，也是僅有的沒有完成基因組測序的主要植物種群。2018年7月18日，美國康奈爾大學研究人員在《自然-植物》期刊上發表了其完成蕨類植物基因組測序的結果。 蕨類植物的基因組較大，可以擁有多達720對染色體，包含多達1480億個堿基對的DNA序列（Gb）。相比之
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化，然后克隆到質粒載體上，再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應，挑出單克隆，并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的，第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列，產生的數據量相對來說很小，而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G，可以一次測很多的樣本。高通量
高通量測序技術
沒有測序的癌癥診斷是不完整的，完整的癌癥診斷應該包括一系列基于細胞遺傳學技術、熒光原位雜交技術、標準分子技術以及NGS的預后與預測性分析。對于早期癌癥患者來說，NGS序列分析在多種癌癥的篩查技術中具有不容忽視的代表性;而對于晚期癌癥患者，大量的侵入性測試往往只能篩查出少數幾個藥物靶點。 隨
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化，然后克隆到質粒載體上，再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應，挑出單克隆，并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的，第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列，產生的數據量相對來說很小，而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G，可以一次測很多的樣本。高通量
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化，然后克隆到質粒載體上，再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應，挑出單克隆，并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的，第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列，產生的數據量相對來說很小，而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G，可以一次測很多的樣本。高通量
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titanium第二代
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
高通量測序的意義
高通量測序技術的誕生可以說是基因組學研究領域一個具有里程碑意義的事件。該技術使得核酸測序的單堿基成本與第一代測序技術相比急劇下降, 以人類基因組測序為例, 上世紀末進行的人類基因組計劃花費 30 億美元解碼了人類生命密碼, 而第二代測序使得人類基因組測序已進入萬(美)元基因組時代。如此低廉的單堿
Solexa高通量測序方法
高通量測序發展的背景基因決定了一個人的相貌、身高甚至疾病，它存在于每個人體細胞的ＤＮＡ中。而組成ＤＮＡ的基本物質則是由Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｃ表示的４種堿基，一個人的基因組測序就是排列出其ＤＮＡ上所有堿基的順序。如果每個人都能擁有一份屬于自己的基因組圖譜，那么科學家們長期以來期待的“個性化醫療時代”就會可能成
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組高通量測序
（第二代高通量測序技術-454） 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下，其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
高通量測序技術包括
高通量測序技術及原理介紹如下：高通量測序技術（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術（“Next-generation” sequencing technology），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。測序技術推進科學研
什么是高通量測序
高通量測序技術（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術（"Next-generation" sequencing technology），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等，主要
高通量測序的步驟
當然，首先地提取出您想要測序的東西，比如RNA、DNA 。再就是建庫-測序-分析。建庫需要將序列片段化、加接頭、PCR。不同的業務有細微的差別，比如RNA要先反轉錄成cDNA等等。然后就是上機測序了！最后就是數據分析了。數據分析分為流程分析（基本分析）和個性分析（根據老師課題分析）。這些以后呢，就是
高通量的PCR模板植物基因組DNA制備方法（三）
將純化定量的水稻品種(93-11)基因組DNA標準樣品(0.5~8 ng)與1.0 μL本方法制備的水稻品種(02428)基因組DNA混合作為模板，用InDel 標記引物(表1)進行PCR擴增和PAGE檢測。箭頭指某反應(或2個反應之間)其02428與93-11條帶的信號值大致相等(即DNA
高通量的PCR模板植物基因組DNA制備方法（四）
2.3 ?高通量的分子標記檢測?本方法制備的DNA濃度雖然低，用96針復制器加入0.5~1 μL模板進行33~35個PCR循環就可獲得足夠濃度的產物，并不需要加入特別多的Taq酶(甚至使用量為每45~50 μL PCR反應液1 U也能擴增分子標記)。該方法已對數萬份水稻樣品進行了分子標記(S
高通量的PCR模板植物基因組DNA制備方法（二）
1.2? 植物材料 ?1.2.1 水稻秧苗。將1.6-mL 96方孔板底部用6 mm電鉆頭打穿，或將舊96孔PCR板的底部剪去約4 mm。使用時將方孔板壓入少量泥巴。每孔放入1粒萌動的水稻種子，在自然日光下(或人工氣候箱)生長至3~4片葉。其他植物小苗也可用類似方法種植。?1.2.2 水稻大植株的鮮
高通量的PCR模板植物基因組DNA制備方法（一）
摘? 要：制備大量生物樣品的模板DNA用于PCR檢測是費時費人工的工作。本文介紹一種高通量的植物基因組DNA(gDNA)快速制備及其用于PCR基因型檢測的操作方法。將一小段單子葉植物苗葉片(長度約30 mm或40 mm，與96方孔板的孔深大致相同) 或一小塊(約2~4 mg)雙子葉植物葉片放入9
華大基因與SAMRC合作建成非洲首個高通量基因組測序中心
近日，南非醫學研究理事會（SAMRC）基因組學中心在開普敦正式啟用，成為非洲首個高通量基因組測序中心。 南非醫學研究理事會（SAMRC）成立于1969年，是南非衛生部下屬機構，旨在通過研發和技術轉移，改善南非人口健康，使民眾能夠享受到更好的生活質量。SAMRC主要研究領域包括結核病、艾滋病、心血管
高通量測序的相關介紹
高通量測序技術（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術（"Next-generation" sequencing technology），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。 名詞解釋 根據發展歷史、影響力、測序原
高通量測序的實驗過程
1.樣本準備（sample fragmentation）2.文庫構建(library preparation)3.測序反應(sequencing reaction)4.數據分析(data analysis)
高通量測序分的原理
對DNA分子進行序列測定。1.對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。2.根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等，主要有以下幾種：大規模平行簽名測序（Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆（Polony S
高通量測序的實驗過程
1.樣本準備（sample fragmentation）2.文庫構建(library preparation)3.測序反應(sequencing reaction)4.數據分析(data analysis)
高通量測序技術的應用
測序技術推進科學研究的發展。隨著第二代測序技術的迅猛發展，科學界也開始越來越多地應用第二代測序技術來解決生物學問題。比如在基因組水平上對還沒有參考序列的物種進行重頭測序(de novosequencing)，獲得該物種的參考序列，為后續研究和分子育種奠定基礎；對有參考序列的物種，進行全基因組重測
高通量測序技術及原理
高通量測序技術及原理介紹如下：1.什么是高通量測序高通量測序技術也被稱作二代測序技術（Next Generation Sequencing, NGS），這是相對一代測序技術（Sanger Sequencing）而言的，同時由于高通量測序的出現使得我們能對一個物種的基因組和轉錄組進行全面、細致的分析成
高通量測序技術SOLiD簡介
目前市場上有四種高通量測序儀，分別是Solexa，454 (GS-FLX)，SOLiD和Polonator。根據測序原理，它們可以被分為兩大類：使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454，及使用連接法測序(Sequencing by Ligat
高通量測序發展史
人類基因組計劃(human genome project, HGP) 在介紹高通量測序發展之前，需要先為大家介紹一個人類發展史上的一項重要創舉——人類基因組計劃(human genome project, HGP)。HGP的完成對測序技術的推動作用意義重大。 HGP是由美國科學家于1985年率先