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    PCR引物設計原則

    PCR引物設計的目的是為了找到一對合適的核苷酸片段,使其能有效地擴增模板DNA序列。因此,引物的優劣直接關系到PCR的特異性與成功與否。要設計引物首先要找到DNA序列的保守區。同時應預測將要擴增的片段單鏈是否形成二級結構。如這個區域單鏈能形成二級結構,就要避開它。如這一段不能形成二級結構,那就可以在這一區域設計引物。現在可以在這一保守區域里設計一對引物。一般引物長度為15~30堿基,擴增片段長度為100~600堿基對。讓我們先看看P1引物。一般引物序列中G+C含量一般為40%~60%。而且四種堿基的分布最好隨機。不要有聚嘌呤或聚嘧啶存在。否則P1引物設計的就不合理。應重新尋找區域設計引物。 同時引物之間也不能有互補性,一般一對引物間不應多于4個連續堿基的互補。 引物確定以后,可以對引物進行必要的修飾,例如可以在引物的5′......閱讀全文

    Primer 引物設計原則

    概念   引物,是一小段單鏈DNA或RNA,作為DNA復制的起始點,在核酸合成反應時,作為每個多核苷酸鏈進行延伸的出發點而起作用的多核苷酸鏈,在引物的3′-OH上,核苷酸以二酯鏈形式進行合成,因此引物的3′-OH,必須是游離的。類型  存在有自然中生物的DNA復制引物(RNA引物)和聚合酶鏈式反應(

    PCR引物設計及軟件使用技巧

    PCR引物設計及軟件使用技巧張新宇,朱有康,高燕寧(中國協和醫科大學中國醫學科學院腫瘤研究所,北京100021)摘要:本文旨在介紹使用軟件設計PCR引物的技巧。在PCR引物設計原則的基礎上,詳細介紹了兩種常用引物設計軟件的基本使用方法,并對其各自的優缺點進行了比較。一般性引物自動搜索可采用“Prem

    整理的PCR資料.供大家分享.2

    引物設計簡介1.寡聚核苷酸引物的選擇,通常是整個擴增反應成功的關鍵。所選的引物序列將決定PCR產物的大小、位置、以及擴增區域的Tm值這個和擴增物產量有關的重要物理參數。好的引物設計可以避免背景和非特異產物的產生,甚至在RNA-PCR中也能識別cDNA或基因組模板。引物設計也極大的影響擴增產量:若使用

    PCR技術 PCR技術的應用

    一滴殘留在裙子上的精液使得美國總統Bill Clinton不得不坦承他與白宮實習生有不正當的關系。因為他知道現在的生物科技就連一個精子也能被用來做為證據。這種將極微量的生物標本化為可供鑒定的現代技術正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合

    pcr實用技巧-2

    1.簡介寡聚核苷酸引物的選擇,通常是整個擴增反應成功的關鍵。所選的引物序列將決定PCR產物的大小、位置、以及擴增區域的Tm值這個和擴增物產量有關的重要物理參數。好的引物設計可以避免背景和非特異產物的產生,甚至在RNA-PCR中也能識別cDNA或基因組模板。引物設計也極大的影響擴增產量:若使用設計粗糙

    關于PCR你了解多少?

      實驗原理  PCR是體外人工選擇性擴增DNA的一種方法,它類似于生物體內DNA的復制。在生物體內DNA復制需要模板、引物、DNA聚合酶、DNA解旋酶、 dNTPs;而體外PCR反應同樣需要類似的成分,有模板、引物、PCR Buffer、Taq酶、dNTPs。其中引物是人工設計的特定序列,實現對特

    如何做好熒光定量PCR實驗

    熒光定量PCR實驗指南一、基本步驟:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比對;2、引物、探針的設計;3、引物探針的合成;4、反應體系的配制;5、反應條件的設定;6、反應體系和條件的優化;7、熒光曲線和數據分析;8、標準品的制備;二、技術關鍵:1、 目的基因(DNA和mRNA)的查找和比

    PCR引物設計及評價實驗

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    實驗方法原理聚合梅鏈式反應(polymerase chain reaction)即PCR技術,是一種在體外快速擴增特定基因或DNA 序列的方法,故又稱基因的體外擴增法。PCR技術已成為分子生物學研究中使用最多,最廣泛的手段之一,而引物設計是PCR技術中至關重要的一環,使用不合適的PCR引物容易導致實

    寡聚核苷酸引物的選擇

    1.簡介    寡聚核苷酸引物的選擇,通常是整個擴增反應成功的關鍵。所選的引物序列將決定PCR產物的大小、位置、以及擴增區域的Tm值這個和擴增物產量有關的重要物理參數。好的引物設計可以避免背景和非特異產物的產生,甚至在RNA-PCR中也能識別cDNA或基因組模板。引物設

    實時熒光Taqman 探針設計的幾個要點

    實驗室很多同學都要做Real time PCR實驗,實驗室的師兄師姐都會有很多寶貴意見,不過也有實驗室前沒有做過的,查找了下資料和大家分享下關于實時熒光 Taqman 探針設計、實時熒光PCR探針的選擇、引物的設計及評價。熒光探針法是用序列特異的熒光標記探針來檢測產物,探針法的出現使得定量

    PCR引物設計及評價

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    PCR引物設計及評價實驗(二)

    5.  按照搜尋結果顯示,在主窗口中檢查該引物對的二級結構情況,逐條分析,依次篩選。下面進行序列篩選:點擊其中一對引物,如第21#引物,在“Peimer Premier”主窗口,如圖所示:該圖分三部分,最上面是圖示PCR模板及產物位置,中間是所選的上下游引物的一些性質,最下

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    PCR引物設計技巧

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    PCR引物設計知識與技巧分析

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    設計引物遵循原則、引物保存和各種PCR的引物設計

    一 設計引物應遵循以下原則1 、引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。2 、引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。3 、引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現非特異條帶。ATGC最好隨機分布,避免5個以上

    RNA提取與RT-PCR

     1.RNA的提取  RNA的提取其實原理很簡單:通過變性劑破碎細胞或者組織,然后經過氯仿等有機溶劑抽提RNA,再經過沉淀,洗滌,晾干,zui后溶解。但是由于RNA酶無處不在,隨時可能將RNA降解,所以實驗中有很多地方需要注意,稍有疏忽就會前功盡棄。  1.1分離高質量RNA  成功的cDNA合成來

    PCR使用技巧

    基本PCR引物設計參數 引物設計的目的是在兩個目標間取得平衡:擴增特異性和擴增效率。特異性是指發生錯誤引發的頻率。特異性不好或劣等的引物會產生額外無關和不想要的PCR擴增子,在EB染色的瓊脂糖凝膠上可見到;引物效率是指在每一PCR循環中一對引物擴增的產物與理論上成倍增長量的接近程度。&nb

    RNA提取和RT-PCR

    真核生物的基因組是DNA,為什么不直接從DNA PCR得到我們需要的基因呢?因為真核生物的基因含有大量的非編碼區,稱為內元(intron),真正編碼蛋白的區段是被這些內元隔開的,這些編碼區叫做外元(exon)。真核生物的DNA轉錄成為RNA之后,經過剪切和拼接,去掉這些非編碼區,才形成成熟

    引物(primers)設計知識介紹

    引物(primers)引物是人工合成的兩段寡核苷酸序列,一個引物與感興趣區域一端的一條DNA模板鏈互補,另一個引物與感興趣區域另一端的另一條DNA模板鏈互補。引物的重要性在整個PCR體系中, 引物占有十分重要的地位。PCR的特異性要求引物與靶DNA特異結合,不與其他非目的DNA結合,PCR的靈敏性要

    PCR反應體系與反應條件2 冷凍離心機

    PCR反應體系與反應條件  標準的PCR反應體系:   10×擴增緩沖液      10ul   4種dNTP混合物    各200umol/L   引物           各10~100pmol    模板

    PCR反應體系與反應條件 高速冷凍離心機

    PCR反應體系與反應條件    標準的PCR反應體系:   10×擴增緩沖液      10ul   4種dNTP混合物    各200umol/L   引物           各10~1

    3分鐘了解:PCR檢測怎么做以及注意事項

    PCR反應的準備PCR反應體系10×擴增緩沖液10μl4種dNTP混合物(終濃度)各100~250μmol/L引物(終濃度)各5~20μmol/L模板DNA0.1~2μgTaq DNA聚合酶5~10 UMg2+(終濃度)1~3mmol/L補加雙蒸水100 μl其中dNTP、引物、模板DNA、Taq

    攻克多重PCR之難(上篇)

      多重PCR能夠在提高通量的同時節省樣品降低成本,它需要耗費更多的時間和精力,同時也會給用戶回報更豐富的數據。本文介紹了一些實驗技巧和商業化工具,希望能幫您輕松獲得好結果。   PCR 的重要性毋庸贅述,這一諾貝爾獲獎技術的普及帶動了現代基因組學、鑒定技術、醫療診斷等領域的發展。如今,PCR

    多聚酶鏈式反應技術(PCR技術)

    多聚酶鏈式反應即PCR(polymerase chain reaction)技術,應用這一技術可以將微量目的基因(DNA片段)擴增一百萬倍以上。PCR反應理論的提出和技術的完善對于分子生物學的發展具有特殊的意義,它以敏感度高、特異性強、產率高、重復性好以及快速簡便等優點迅速成為分子生物學研究中應用最

    PCR常見問題總匯

    PCR產物的電泳檢測時間   一般為48h以內,有些最好于當日電泳檢測,大于48h后帶型不規則甚致消失。 假陰性,不出現擴增條帶   PCR反應的關鍵環節有①模板核酸的制備,②引物的質量與特異性,③酶的質量及, ④PCR循環條件。尋找原因亦應針對上述環節進行分析研究。   模板:①模板中含有

    RNA提取與RT-PCR(3)

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