SLAFseq技術:大規模基因分型高通量策略
大規模基因分型在遺傳相關性研究中起著重要作用,尤其是和高通量測序技術結合后,它為基因挖掘帶來了新的機遇。大規模基因分型的有效解決方法:SLAF-seq(specific-locus amplified fragment sequencing),該技術前期利用生物信息學方法,對目標物種的參考基因組(或已知BAC序列)進行系統分析,設計標記開發方案,后期根據前期的方案,構建SLAF-seq文庫,篩選特異性長度片段進行高通量測序,將獲得測序深度和質量滿足要求的SLAF片段來代表目標物種的全基因組信息。它具有以下優勢: 1. 高深度測序保證分型準確; 2. 簡化的策略降低測序成本; 3. 前期簡化方案預測保障標記數量最優; 4. 采用double index技術能適用于大群體。 在文章中,我們用水稻和大豆數據驗證了SLAF-seq技術的有效性,2個結果都顯示預測的和實際的結果一致性非......閱讀全文
高通量測序
高通量測序技術又稱“下一代”測序技術,以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序包括:大規模平行簽名測序、聚合酶克隆、454焦磷酸測序、離子半導體測序和DNA 納米球測序等技術。 高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DN
高通量測序技術
沒有測序的癌癥診斷是不完整的,完整的癌癥診斷應該包括一系列基于細胞遺傳學技術、熒光原位雜交技術、標準分子技術以及NGS的預后與預測性分析。對于早期癌癥患者來說,NGS序列分析在多種癌癥的篩查技術中具有不容忽視的代表性;而對于晚期癌癥患者,大量的侵入性測試往往只能篩查出少數幾個藥物靶點。 隨
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化,然后克隆到質粒載體上,再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應,挑出單克隆,并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的,第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列,產生的數據量相對來說很小,而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G,可以一次測很多的樣本。高通量
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化,然后克隆到質粒載體上,再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應,挑出單克隆,并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的,第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列,產生的數據量相對來說很小,而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G,可以一次測很多的樣本。高通量
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化,然后克隆到質粒載體上,再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應,挑出單克隆,并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的,第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列,產生的數據量相對來說很小,而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G,可以一次測很多的樣本。高通量
高通量測序技術-中的“高通量”-是什么意思
高通量是相對于第一代測序的,第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列,產生的數據量相對來說很小,而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G,可以一次測很多的樣本。在2000年的時候,3700、MegaBace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。不過到2005年以后,高通
高通量組織研磨機低溫以及高通量研磨工藝
高通量組織研磨機是一種特殊的、快速的、率的、多試管的一致系統。在水平方向上進行振動的,研磨球的慣性帶動它們以高能量撞擊位于弧形內表面的樣品材料,從而達到粉碎研磨的效果。它能將任何來源(包括土壤、植物和動物的組織/器官、細菌、酵母、真菌、孢子、古生物標本等)的原始DNA、RNA和蛋白質進行提取和純化
高通量測序的意義
高通量測序技術的誕生可以說是基因組學研究領域一個具有里程碑意義的事件。該技術使得核酸測序的單堿基成本與第一代測序技術相比急劇下降, 以人類基因組測序為例, 上世紀末進行的人類基因組計劃花費 30 億美元解碼了人類生命密碼, 而第二代測序使得人類基因組測序已進入萬(美)元基因組時代。如此低廉的單堿
高通量測序技術包括
高通量測序技術及原理介紹如下:高通量測序技術(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術(“Next-generation” sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。測序技術推進科學研
高通量平行合成儀
儀器產品描述:這是專為精細化工等行業研發設計的組合化學和多產品合成設備。該產品按反應板溫度區域數量不同分為單區反應和多區反應;按多區反應板功能不同可分為加熱型、加熱/冷卻型、回流型;按試管容量不同及試管的裝載數量不同又可分成多個品種規格。 產品特點: ●模塊化設計理念 1、一個
高通量組織研磨器
高通量組織研磨器可以在3分鐘內最多對2×96個樣本同時進行快速、有效的研磨。可以干磨、濕磨和混合以及均質化處理。樣本的種類包括:植物組織、動物組織、細胞、細菌和酵母等等。對于提取大通量樣本中的核酸,大大提高研磨效率和質量。
轉錄組高通量測序
(第二代高通量測序技術-454) 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是,轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下,其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
轉錄組高通量測序
(第二代高通量測序技術-454) 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是,轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下,其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
高通量平行合成儀
產品描述:這是專為精細化工等行業研發設計的組合化學和多產品合成設備。該產品按反應板溫度區域數量不同分為單區反應和多區反應;按多區反應板功能不同可分為加熱型、加熱/冷卻型、回流型;按試管容量不同及試管的裝載數量不同又可分成多個品種規格。 產品特點: ●模塊化設計理念 1、一個反應
高通量基因點樣儀
高通量基因點樣儀是一種用于基礎醫學領域的醫學科研儀器,于2016年11月17日啟用。 技術指標 1.X 軸移動速度:50-250mm/s;Y 軸移動速度:100mm/s;Z 軸移動速度:100mm/s;X,Y,Z軸移動精度:± 0.2mm;劃線頭定位精度:± 0.2mm。2.劃頭最小間距:
轉錄組高通量測序
(第二代高通量測序技術-454) 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是,轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下,其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titanium第二代
轉錄組高通量測序
(第二代高通量測序技術-454) 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是,轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下,其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
高通量細胞遷移篩選
細胞遷移是一個活的生物生長和維持生命過程中不可缺少的的關鍵過程。為了完成相應的功能,體內的細胞經常會以特定的方向遷移到特定的位置。遷移是一個循環的過程,細胞向前端伸出突觸,縮回其尾端。動物組織中的細胞發生遷移主要是為了響應特定的外部信號。細胞遷移對于胚胎發育、傷口愈合、分化以及免疫應答等都是非常重要
什么是高通量測序
高通量測序技術(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等,主要
高通量測序的步驟
當然,首先地提取出您想要測序的東西,比如RNA、DNA 。再就是建庫-測序-分析。建庫需要將序列片段化、加接頭、PCR。不同的業務有細微的差別,比如RNA要先反轉錄成cDNA等等。然后就是上機測序了!最后就是數據分析了。數據分析分為流程分析(基本分析)和個性分析(根據老師課題分析)。這些以后呢,就是
Solexa高通量測序方法
高通量測序發展的背景基因決定了一個人的相貌、身高甚至疾病,它存在于每個人體細胞的DNA中。而組成DNA的基本物質則是由A、T、G、C表示的4種堿基,一個人的基因組測序就是排列出其DNA上所有堿基的順序。如果每個人都能擁有一份屬于自己的基因組圖譜,那么科學家們長期以來期待的“個性化醫療時代”就會可能成
藥物高通量篩選技術
藥物高通量篩選技術簡單介紹一下關于藥物高通量篩選技術的知識。一.概念高通量篩選(High throughputscreening,HTS)技術是指以分子水平和細胞水平的實驗方法為基礎,以微板形式作為實驗工具載體,以自動化操作系統執行試驗過程,以靈敏快速的檢測儀器采集實驗結果數據,以計算機對實驗數
高通量植物表型平臺簡介
高通量植物表型平臺是植物表型組學、植物功能基因組學、現代遺傳育種研究的強大工具。利用高通量植物表型平臺可以快速獲取大量植株的各種信息。現代農業育種的一個主要方向就是性狀改良,獲得更大的果實/種子,更高的含油量(油料作物),更發達的根系等等。通過高通量植物表型平臺可以快速獲取大量植物表型信息。
高通量測序的相關介紹
高通量測序技術(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。 名詞解釋 根據發展歷史、影響力、測序原
高通量篩選技術的簡介
高通量篩選(High throughput screening,HTS)技術是指以分子水平和細胞水平的實驗方法為基礎,以微板形式作為實驗工具載體,以自動化操作系統執行試驗過程,以靈敏快速的檢測儀器采集實驗結果數據,以計算機分析處理實驗數據,在同一時間檢測數以千萬的樣品,并以得到的相應數據庫支持運
高通量篩選的特點簡介
高通量篩選時每天要對數以千萬的樣品進行檢測,工作枯燥,步驟單一,操作人員容易疲勞、出錯。自動化操作系統由計算機及其操作軟件、自動化加樣設備、溫孵離心設備和堆棧4個部分組成。自動化操作系統代替人工操作顯然有諸多優勢,它利用計算機通過操作軟件控制整個實驗過程,編程過程簡潔明了。
高通量測序的實驗過程
1.樣本準備(sample fragmentation)2.文庫構建(library preparation)3.測序反應(sequencing reaction)4.數據分析(data analysis)
高通量測序技術的應用
測序技術推進科學研究的發展。隨著第二代測序技術的迅猛發展,科學界也開始越來越多地應用第二代測序技術來解決生物學問題。比如在基因組水平上對還沒有參考序列的物種進行重頭測序(de novosequencing),獲得該物種的參考序列,為后續研究和分子育種奠定基礎;對有參考序列的物種,進行全基因組重測
高通量測序分的原理
對DNA分子進行序列測定。1.對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。2.根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等,主要有以下幾種:大規模平行簽名測序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony S
高通量細胞分析設備簡介
儀器主要用途:可用于細胞的定性和定量分析(包括檢測細胞表面和細胞漿抗原、細胞因子、細胞內DNA、RNA含量等,定量分析細胞內pH值,蛋白總含量、DNA及RNA含量、免疫表現、細胞周期動力學、細胞特殊配體、細胞生物活性鑒定、細胞凋亡研究、細胞功能分析、鈣流等),并將具有將特定形狀或功能的細胞從混合