環狀RNA研究方法（一）
至2015起云序生物已經完成10000+例環狀RNA全轉錄組測序服務，涵蓋了50+疾病，20+物種，幫助眾多客戶在環狀RNA分子的研究中取得突破性進展。客戶發表的環狀RNA文章高達20篇以上。此外云序生物還提供環狀RNA機制研究手段，rip&RNA pull down技術，幫助客戶沖刺高分機制文章。本周小編來講講云序生物客戶利用全轉錄組測序如何又快速發表了一篇5分以上的文章（前期講述了好多篇環狀RNA測序直接發表5分的文章的案例，感興趣的伙伴可以點擊往期的鏈接）。 研究背景：作為非編碼分子的重要成員，環狀RNA分子在多種疾病生理學過程當中都扮演著重要的角色。這一次對于環狀RNA分子的研究聚焦在了電離輻射對細胞的影響。說起電離輻射，其實在我們的生活中微量輻射幾乎無處不在，土壤中有天然輻射源氡氣，體檢的時候使用的X射線機等等。要知道腸上皮細胞對（intestinal epithelium）電離放......閱讀全文
教你輕松玩轉環狀RNA測序加機制研究（一）
從表達譜至海綿機制完美進階，教你輕松玩轉環狀RNA測序加機制研究文章導讀：禽白血病病毒J亞群(ALV-J)屬于逆轉錄病毒屬，慢病毒亞科的家族成員，可引起禽類多種腫瘤性疾病，如骨髓細胞瘤、肉瘤、血管瘤、腎腫瘤和成紅細胞增多癥，以及禽類骨髓白血病，導致受感染雞的高死亡很率。該分散的ALV-J菌株分布廣泛
2020年環狀RNA高分文章怎么發？
環狀RNA作為最新發現的RNA分子，從誕生之日起就是光環加身，屢屢登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期發表的《2019研究前沿》中，“環狀RNA作為癌癥新的生物標志物”成為生物科學領域6個新興前沿之一。2019年環狀RNA共發表SCI論文885篇，較2018年增長約20%，
2020年環狀RNA高分文章怎么發？
環狀RNA作為最新發現的RNA分子，從誕生之日起就是光環加身，屢屢登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期發表的《2019研究前沿》中，“環狀RNA作為癌癥新的生物標志物”成為生物科學領域6個新興前沿之一。2019年環狀RNA共發表SCI論文885篇，較2018年增長約20%，
世界首篇非洲爪蟾環狀RNA研究成果發表！
作為最新的明星分子，環狀RNA的熱度與日俱增。環狀RNA到底火到了什么程度？從云序客戶捷報頻傳﹑研究成果不斷就可見一斑：上期我們剛剛介紹云序客戶發表了世界首個小鼠腦創傷模型外泌體環狀RNA的研究，整合了外泌體和環狀RNA兩大科研熱點。在探索新物種的環狀RNA研究上，云序客戶此前更是先后發表了全世
復旦大學Nature子刊發布環狀RNA重要發現
來自復旦大學、上海交通大學醫學院的研究人員借助分析環狀RNA，揭示出了豐富的circHIPK3通過像海綿般結合多種miRNAs調控了細胞生長。這一重要的研究發現發布在4月6日的《自然通訊》（Nature Communications）雜志上。 復旦大學的黃勝林（Shenglin Huang）研
世界首篇非洲爪蟾環狀RNA研究成果發表！
作為最新的明星分子，環狀RNA的熱度與日俱增。環狀RNA到底火到了什么程度？從云序客戶捷報頻傳﹑研究成果不斷就可見一斑：上期我們剛剛介紹云序客戶發表了世界首個小鼠腦創傷模型外泌體環狀RNA的研究，整合了外泌體和環狀RNA兩大科研熱點。在探索新物種的環狀RNA研究上，云序客戶此前更是先后發表了全世
Molecular－Cancer:環狀RNA通過經典信號通路抑制腫瘤進展
環狀RNA(circRNAs)以單鏈和共價閉環結構為特征，通常由preRNAs的外顯子反向剪接而成。以前，circRNA被認為是低豐度剪接錯誤的副產品。然而，通過深入的RNA測序和生物信息學，circRNAs已被證明廣泛存在于轉錄本中。大量證據表明，環狀RNA(circRNAs)在腫瘤的發生發展
2018國自然研究熱點一：環狀RNA研究深度剖析
1.環狀RNA為什么火？它到底是何方神圣？ 2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世，徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生物醫學界！經過嚴格統計匯總后，2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項，其中有兩項杰出青年基金，一項優秀
環狀RNA（circRNA）功能研究又一利器——過表達載體
circRNAs 環狀 RNA（circular RNAs,circRNA）是一類具有閉合環狀結構的 RNA 分子，早在 20 世紀八十年代即有研究報道，但由于其表達豐度低，文獻報道較少，一直被認為是 RNA 轉錄剪切的罕見錯誤而被忽視。直到 2012 年開始有研究者開始大批量鑒定 circRN
我國科學家首次發現蘋果具有核酶活性環狀RNA
近日，中國農業科學院植物保護研究所研究員李世訪研究團隊與中國科學技術大學吳清發教授研究團隊合作，在世界上首次發現蘋果中存在具有核酶活性的環狀RNA。 上世紀80年代，在研究蘋果上一種危害嚴重的病害——蘋果銹果病時，中國農業科學院興城果樹研究所的果樹病毒專家劉福昌研究員和日本果樹病毒專家小金澤碩
吉西他濱耐藥胰腺導管癌環狀RNA文章導讀
文章導讀：本篇文章主要研究的藥物是吉西他濱，其主要應用于晚期胰腺癌病人的治療，可是若病人對此類藥物產生了耐藥反應，那勢必會影響患者的生活質量，甚至生命。目前，對于吉西他濱對胰腺癌耐藥機制研究尚不明朗。作者首先構建了對吉西他濱耐藥細胞系，并通過全轉錄組測序比較了耐藥與正常細胞系之間環狀RNA的表達譜。
中國科技大學Nature子刊聚焦環狀RNA
來自中國科技大學、華中師范大學等處的研究人員報告稱，他們鑒別出了一類與RNA聚合酶Ⅱ相關的環狀RNA（circRNAs），將之命名為外顯子-內含子circRNAs（EIciRNAs）。并證實這些EIciRNAs調控了細胞核中的轉錄。這些研究成果在線發表在2月9日的《自然結構與分子生物學
小環狀干擾－RNA－(sciRNA)－作為基因沉默的有效治療平臺
為了實現由RNA干擾(RNAi)途徑介導的有效的治療性基因沉默，小干擾RNA (sirna)必須經過化學修飾。一些具有在代謝上穩定sirna潛力的超rna結構已被評估其誘導基因沉默的能力，但所有這些結構都有局限性或尚未在治療相關的背景下進行探索。共價閉合環狀RNA轉錄本普遍存在于真核生物中，有潛
默沙東大舉押注，環狀RNA明星公司Orna要做什么？
默沙東正在深入研究RNA藥物制造，周二宣布與生物技術初創公司Orna Therapeutics達成一項交易，希望能夠開發出多種新藥和疫苗。通過這筆交易，默沙東將先向Orna支付1.5 億美元預付款，并將在Orna的B 輪2.21億美元中再投資1億美元。同時，Orna可能會收到高達35億美元的下游付款
腦創傷外泌體環狀RNA的鑒定功能及預測
近期，云序生物客戶天津醫科大學總醫院張建寧教授帶領的神經創傷團隊針對大腦創傷的研究。該課題組集合了外泌體和環狀RNA兩大科研熱點，應用云序生物提供的全轉錄組測序服務，僅通過大腦創傷外泌體中環狀RNA表達譜研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》（影響因子5.19）
銳博生物：環狀RNA研究的方法及功能作用介紹
銳博生物：環狀RNA—隱秘的未知RNA平行宇宙 環狀RNA，被喻是隱秘的未知RNA平行宇宙。最近，復旦大學的鄭秋鵬博士（2016交流會嘉賓之一）以第一作者身份在Nature Communications上發布了他們關于circHIPK3的最新研究成果。現在就和小編一起來學習circRNA的
腦創傷外泌體環狀RNA的鑒定功能及預測
研究背景：大腦創傷（TBI）具有極高的發病率和致死率，會不同程度地危害身體健康，目前對其致病機理，尤其是對神經系統造成傷害的分子機理尚不知曉。已知外泌體中富含環狀RNA，這是一種新發現的環狀非編碼RNA，大多以miRNA海綿發揮調控下游功能基因的表達。而本研究作者正是集合了外泌體和環狀RNA兩大科研
銳博生物：環狀RNA研究的方法及功能作用介紹
銳博生物：環狀RNA—隱秘的未知RNA平行宇宙 環狀RNA，被喻是隱秘的未知RNA平行宇宙。最近，復旦大學的鄭秋鵬博士（2016交流會嘉賓之一）以第一作者身份在Nature Communications上發布了他們關于circHIPK3的最新研究成果。現在就和小編一起來學習circRNA的
腦創傷外泌體環狀RNA的鑒定功能及預測
近期，云序生物客戶天津醫科大學總醫院張建寧教授帶領的神經創傷團隊針對大腦創傷的研究。該課題組集合了外泌體和環狀RNA兩大科研熱點，應用云序生物提供的全轉錄組測序服務，僅通過大腦創傷外泌體中環狀RNA表達譜研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》（影響因子5.19）
又是魔剪CRISPR！首次揭秘“環狀RNA”與大腦功能有關
近年來，環狀RNA（Circular RNAs，circRNAs）越來越受到科學界的關注，但它們在活體內的功能一直是一個謎。8月10日，發表在Science雜志上題為“Loss of a mammalian circular RNA locus causes miRNA deregulation
揭示登革熱媒介白紋伊蚊環狀RNA的功能和機制
近日，南方醫科大學公共衛生學院/熱帶醫學研究所教授顧金保團隊研究揭示了登革熱媒介白紋伊蚊circRNA（circular RNA，環狀RNA）的功能和機制。相關研究論文發表于PLoS Pathogens。白紋伊蚊是一種傳播疾病的蚊子，它是多種病毒的媒介。白紋伊蚊是登革病毒主要的傳播媒介，其種群在全球
Nature：為什么環狀RNA會是下一代重磅藥物？
基于RNA的疫苗是COVID-19大流行中的英雄，它們創下了歷史上最快疫苗開發時間的記錄，從開發到獲FDA批準上市僅僅用時一年時間。 而最近，mRNA技術更是獲得了諾貝爾獎的認可，Katalin Karikó 和 Drew Weissman 因發現了核苷堿基修飾，從而開發出了有效的mRNA疫苗
北大喬杰、湯富酬、黃巖誼發表環狀RNA新成果
早在幾十年前，生物學家們就發現了環狀RNA。與線性RNA相比，環狀RNA受到的關注比較少，一直被認為是剪切過程中發生的錯誤。隨著二代測序的發展，近幾年人們意識到環狀RNA其實是非常普遍的。這些分子廣泛存在于多種生物的細胞中（從古生菌、酵母、小鼠到人類），能夠通過不同途徑影響基因表達，很可能在細胞
環狀RNA在腸道干細胞自我更新中的重要作用
腸道是食物消化和吸收的主要場所，由單層上皮細胞形成腸上皮屏障。除了上皮細胞，腸道中還有大量的免疫細胞。即使在成體穩態（homeostasis）條件下，腸上皮仍經歷著快速的自我更新，在小鼠中大約5天可以更新一次【1】。定位于腸道隱窩中的干細胞可以分化為腸道中所有的上皮細胞類型【2】。腸干細胞的自我
高度保守的環狀RNA如何調控骨骼肌生長發育
? ?circFgfr2調控骨骼肌生長發育和再生的分子機制。中國農科院供圖 近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所豬基因組設計育種創新團隊系統繪制了豬骨骼肌生長發育環狀RNA圖譜，并揭示了物種間高度
高度保守的環狀RNA如何調控骨骼肌生長發育
ircFgfr2調控骨骼肌生長發育和再生的分子機制。中國農科院供圖 近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所豬基因組設計育種創新團隊系統繪制了豬骨骼肌生長發育環狀RNA圖譜，并揭示了物種間高度保守環狀RNA-circFgfr2調控骨骼肌生長發育的新機制。相關研究成果在線發表在《惡病質、肌少癥與肌肉
從表達譜至海綿機制完美進階－環狀RNA測序加機制研究！
禽白血病病毒J亞群(ALV-J)屬于逆轉錄病毒屬，慢病毒亞科的家族成員，可引起禽類多種腫瘤性疾病，如骨髓細胞瘤、肉瘤、血管瘤、腎腫瘤和成紅細胞增多癥，以及禽類骨髓白血病，導致受感染雞的高死亡很率。該分散的ALV-J菌株分布廣泛，既能水平傳播又能垂直傳播，往往造成禽類養殖領域的巨大經濟損失。目前我
高度保守的環狀RNA如何調控骨骼肌生長發育
? ?circFgfr2調控骨骼肌生長發育和再生的分子機制。中國農科院供圖 近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所豬基因組設計育種創新團隊系統繪制了豬骨骼肌生長發育環狀RNA圖譜，并揭示了物種間高度
環狀RNA結合功能蛋白！找對方向20分文章水到渠成
環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子，不同于對其豐富的表達譜研究，環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制，部分circRNA可競爭性結合miRNA，解除miRNA對靶基因的抑制作用，上調靶基因的表達。其實，環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白，分別在轉
外泌體環狀RNA作為結腸ai分子標志物的實例應用
文章導讀如今想要短平快靠單純測序+驗證發表一篇5分左右文章，光靠一個熱點環狀RNA還不夠，環狀RNA+外泌體，環狀RNA+m6A，環狀RNA+環狀DNA等方向都是可以去嘗試的。小編今 天以云序用戶以環狀RNA+外泌體作為研究方向的案例進行解析。2020年6月18日云序用戶山大二院在Frontiers