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    基因數據分析的主流軟件

    在過去的幾年中,許多生物的基因組完成了測序工作,如何對如此龐大的原始序列信息進行分析和應用,正是現在最為棘手的問題。大量的基因預測軟件和在線工具應運而生。如何廣泛而深入地了解并能有的放矢地利用這些工具,已經成為21世紀分子生物學家的必修課。隨著大規模EST和cDNA序列信息的獲取,那些基于表達序列同源范圍的程序,在基因組注釋中的作用日益顯著。即使在稀少基因或組織特異性表達的基因中,基因組序列的相關性信息也頗具參考價值。所以利用基因組序列的比對來擴充基因的信息是不可獲缺的。特別是在對人類基因組做注釋時,與那些相對完整的脊椎動物基因組,如小鼠和魚類的基因組比較是必不可少的步驟。許多基因組測序計劃正在進行之中,盡管仍存在急需解決的問題,比較基因組學方法(comparative genome approach)被認為是最有應用前景的方法。該方法不僅在基因預測中舉足輕重,而且在鑒定調控基因、探索垃圾基因(junk gene)等方面的作用也......閱讀全文

    精準醫療時代已至 基因測序數據分析成為關鍵

      隨著醫學技術提升、就醫環境改善,困擾人們的復雜疾病是否能夠得到更加有效的治療?相關統計顯示,針對城市居民死亡率較高的癌癥(惡性腫瘤)、心臟病、冠心病等復雜疾病,傳統醫療方案的治療效果并不佳。據WINSymposium公布的數據顯示,傳統醫療在腫瘤治療上用藥無效率高達75%。人們仍然談“癌”色變。

    分析和比較各種基因組數據的多面手

      Partek?是一家致力于開發與整合用于生命科學研究數據分析軟件的公司。該公司的系列軟件包括――Partek? Flow?, Partek? Genomics Suite?, and Partek? Pathway?――可以提供基因組數據分析的整體解決方案,也是唯一一家可以提供

    專業貼:基因創業的“船票”究竟有多貴?

      基因領域的創業熱度持續升溫。創業門檻有多高?市場規模有多大?哪些領域更適合創業團隊切入?  近兩年來基因領域的創業熱度持續升溫,在設備、工具、服務,檢測四個跑道上都出現了很多種子創業選手。那么這四個方向的創業門檻有多高?市場規模有多大?哪些領域更適合創業團隊切入,下面我給大家盤算一遍。

    PeerJ:中美合作在三代基因測序軟件領域再次取得重要突破

      近日,國際期刊《PeerJ》在線發表了中國科學院昆明動物研究所馬占山研究員與美國馬里蘭大學葉承曦博士在基因測序領域的合作再次取得重要突破。研究團隊近日正式發布了一款代號為 Sparc 的軟件(軟件試用下載網址: https://sourceforge.net/projects/sparc-con

    華大基因的3萬多“鐵粉”,能否等到股價的再次起飛?

    自2017年7月打開IPO漲停板,到2017年11月股價漲到巔峰的261.39元,再到2018年9月3日股價降到73.39元,華大基因的股東戶數一直在3萬多;而截止2018年上半年股東戶數,為33,283戶。這3萬多“鐵粉”,能否等到華大基因的再次騰飛?我翻越了它不少資料,試圖從公司披露的中報,談談

    美國龍頭企業尋求擴張 基因測序市場廣闊

      美國基因測序龍頭企業Illumina(ILMN)股價在過去10年里大幅上漲16倍,特別是在近四年里上漲了六倍,目前市值已達到270億美元。Illumina長牛表現的背后,是市場對基因測序應用前景以及該公司產品線的高度看好。在Illumina的研發推動下,人類基因測序成本顯著下降,為該技術的商業化

    基因測序市場廣闊 全球龍頭Illumina業績增長迅猛

      美國基因測序龍頭企業Illumina(ILMN)股價在過去10年里大幅上漲16倍,特別是在近四年里上漲了六倍,目前市值已達到270億美元。Illumina長牛表現的背后,是市場對基因測序應用前景以及該公司產品線的高度看好。在Illumina的研發推動下,人類基因測序成本顯著下降,為該技術的商業化

    基因測序:上游三四代技術是趨勢,下游樣本積累是關鍵

      基因測序全產業鏈劃分為上游的測序儀器與試劑耗材市場,中游的基因測序服務市場和下游的生物信息學分析市場。中下游市場面向群體包括醫院、藥廠、科研機構以及消費者等,可分為醫療和非醫療兩個領域。  醫療領域可分為人體基因組和人體微生物基因組兩個子領域。針對人體基因組的主要產品有腫瘤學(診斷篩查與治療、靶

    基因測序產業百家爭鳴 測序儀器市場被歐美壟斷

      基因測序全產業鏈劃分為上游的測序儀器與試劑耗材市場,中游的基因測序服務市場和下游的生物信息學分析市場。中下游市場面向群體包括醫院、藥廠、科研機構以及消費者等,醫療領域可分為醫療和非醫療兩個領域。人體基因組和人體微生物基因組兩個子領域。針對人體基因組的主要產品有腫瘤學(診斷篩查與治療、靶向用藥、伴

    中國版精準醫療計劃將啟動

      國家衛計委11月30日消息,目前我國正在制定“精準醫療”戰略規劃,或將納入到“十三五”重大科技專項中。  精準醫療主要由基因測序等頂尖技術構成,將改變現有的診斷、治療模式,為醫學發展帶來一場變革。據透露,我國將研發一批國產新型防治藥物和醫療器械,形成一批我國定制、國際認可的疾病診療指南

    先進科學:基因編輯如何擺脫“脫靶”困擾

      基因組編輯技術是當前生命科學研究的前沿領域。在多種不同的基因組編輯方法,以CRISPR/Cas9系統最為便捷、高效,應用也最廣泛。  但CRISPR技術存在的脫靶效應依舊是影響其能否廣泛應用的主要限制因素,如何正確評估、檢測脫靶效應,并提出相應的策略降低脫靶效應,是當前基因編輯研究領域的重要研究

    中美合作在三代基因測序軟件領域再次取得重要突破

      針對第三代基因測序儀硬件錯誤率高達15%—40%的現實,該團隊研發出了一套“線性復雜度”(復雜性最低)的算法,Sparc軟件即基于該新算法完成。  綜合測試顯示:采用測序深度僅為30x的三代基因測序數據,Sparc取得組裝共識(Consensus)時錯誤率低于0.5%;同時與目前最優秀的同類軟件

    植物表型組學概念和測量方法討論

    首先植物表型是受基因和環境因素決定或影響的, 反映植物結構及組成、植物生長發育過程及結果的全部物理、生理、生化特征和性狀。說到育種不得不提到“表型”的概念,在生物學和遺傳育種領域,特別是作物育種領域,表型是指基因型和環境決定的形狀、結構、大小、顏色等生物體的外在性狀。表型組又是指某一生物的全部性狀特

    賽默飛重推移動檢測解決方案 定制化快速篩選

      2014年9月24日,賽默飛世爾科技亮相于上海新國際博覽中心召開的2014慕尼黑上海分析生化展,隆重推出了賽默飛移動檢測解決方案并召開新聞發布會,賽默飛中國

    中國學者發文,介紹三代測序數據計算方法的突破

      9月18日,中山大學中山眼科中心謝志、肖傳樂、謝尚潛,中山大學數據科學與計算機學院陳穎,湖南農業大學羅峰等學者合作在 Nature Methods 雜志上發表了三代基因組測序數據計算方法,解決了該領域的關鍵技術難題。  這一項目負責人謝志教授和主要完成人肖傳樂副研究員表示:以 PacBio 和

    華大智造聯手德國Curetis開啟傳染病基因診斷的新時代

      近日,深圳華大智造科技有限公司(以下簡稱華大智造)與德國Curetis公司達成戰略性合作。雙方深入探究基于二代測序平臺的微生物傳感染臨床鑒定方法,此次合作加速了基于基因測序的臨床病原診斷進程,也拓寬了雙方在嚴重病原物感染IVD領域的格局。  針對臨床病原診斷及其遺傳性抗生素抗藥性的鑒定方法,雙方

    未來幾年全球基因測序市場仍快速增長

            基因測序(DNA測序)產業近些年得到迅猛發展。來自BBCresearch的數據顯示,全球基因測序市場總量從2007年的794.1萬美元增長至2013年的45億美元,預計未來幾年全球市場仍將繼續保持快速增長,2018

    中國醫學科學院蛋白質組學研討會勝利召開

       2011年11月17日,第一屆蛋白質組學研討會在中國醫學科學院基礎醫學研究所成功召開,本次研討會是由中國醫學科學院基礎醫學研究所主辦,賽默飛世爾科技公司(ThermoFisher Scientific)合辦和贊助,分析測試百科網(www.antpedia.com)協辦,主題是:蛋白質組學在生物

    蛋白質組最新研究進展

      蛋白質組(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一個基因組,或一個細胞、組織表達的所有蛋白質。 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別,它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變。 在轉錄時,一個基因可以多種mRNA形式剪接,一個蛋白質組不是一個基因組的直接產物,蛋白質組中蛋

    食為天 保證食品安全 守一方藍天 CBIFS2018圓滿閉幕

      2018年4月10號,CBIFS2018第十一屆中國國際食品安全技術論壇進行到第二天,專家學者熱情不減,在會上展開了熱烈的討論交流。會議現場中國科學院大連化學物理研究所 首席研究員 關亞風  中國科學院大連化學物理研究所首席研究員關亞風帶來題為“真菌毒素樣品制備和液相色譜熒光定量檢測”的報告。關

    細胞器基因組組裝軟件開發研究獲進展

      真核生物細胞器基因組包括線粒體和質體(包括葉綠體、白色體等)的全部DNA分子,是細胞質遺傳的主要載體。在動植物和真菌的單個細胞內,有多個(甚至成千上萬個)細胞器基因組單元的拷貝,使得利用低覆蓋度的全基因組測序數據組裝得到完整的細胞器基因組成為可能。隨著DNA高通量測序技術的發展,測序成本下降,低

    基因測序市場深度剖析

       Technologies(現為Thermo Fisher收購)公司全國臨床與科研事業部銷售總監、ThermoFisher公司全國臨床市場戰略總監柴映爽寫了一系列文章,對基因測序領域進行了深入剖析。讓我們看看這個領域深入工作的人士,怎么看待2015年基因測序市場大熱這一現實的。   ▌第一篇:基

    DNA重組(DNA recombination)技術:DNA序列測定-3

    2.利用末端轉移酶和α-32P-ddNTP標記DNA的3ˊ-末端 在二價陽離子存在下,末端轉移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羥基末端,如果作為底物的核苷酸經過修飾(如ddNTP),則可以在DNA的3ˊ-OH上僅加入一個核苷酸。對于雙鏈DNA片段,亦存在DNA的兩側均被標記問題,可通過上述同

    那些27歲的教授們

      據此前報道,浙江大學27歲的陸盈盈獲評教授引起輿論紛爭,最后浙江大學網站將她的頭銜從教授改為“特聘研究員”。對于網絡上的紛爭,華中科技大學教授薛宇在自己的博客上發表了一篇文章,歷數了那些年輕的教授們,表示這一事件并不應該大驚小怪。觀察者網編輯查詢發現,薛宇教授出生于1980年,2007年成為中國

    2017年暑假生物醫學大型儀器理論與實驗技術培訓班

    (二輪通知 2017年7月10~19日,北京)  中國醫學科學院基礎醫學研究所∕北京協和醫學院基礎學院在醫學領域具有國內一流的影響力和知名度,以尖端的醫學研究及出色的理論和實驗教學成為著名的醫學科學研究與教育基地。為了培養生物醫學領域創新人才,現推出一年一度的,以尖端儀器和實戰訓練為特色的“大型儀器

    《自然—方法學》發表媲美基因組測序速度的組裝算法。

      10年前,Illumina基因組測序技術進入市場時,前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。  歷史總是重演。如今,第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。  12月10日,《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。  論文作者、中國農業科學院農業

    基因檢測=高科技算命? 專家:天賦分析目前達不到

        據中國之聲新聞縱橫報道,您看到過這種廣告嗎:“采集唾液、口腔拭子或者血液樣本,寄回給公司,七到十個工作日,就可以分析出用戶基因信息,明確病因或預知身體患某種疾病的風險”,近年來,基因檢測慢慢火爆起來,如今正從醫學臨床應用轉移到健康消費市場。  目前,國內至少有幾十家公司號稱為普通消

    研究發現全新全基因組組裝方法

       十年前,Illumina基因組測序技術進入市場時,前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。  歷史總是重演。如今,第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。  英國時間12月9日,《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。  這篇論文只有兩位作者,

    分析比產生更快?中國“智”造全基因組組裝算法

      10年前,Illumina基因組測序技術進入市場時,前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。  歷史總是重演。如今,第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。  12月10日,《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。  論文作者、中國農業科學院農業

    BECIA2017新產品獎大盤點:賽默飛、安捷倫、島津位居三甲

      分析測試百科網訊 2017年10月10日-13日,國內分析測試行業影響力最大的展會——BCEIA2017在北京國家會議中心開幕,展出當今國內外分析測試領域的前沿技術和先進儀器設備。本次展會上,組委會頒布了BCEIA 2017新產品獎,共計22家國產儀器廠商、74個產品。其中獲獎最多的廠商是賽默飛

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