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  • 從RNA的提取到PCR——RealtimePCR經驗

    一 引物的設計引物的設計對于這個實驗至關重要,因為real time pcr的檢測靈敏度比較高,所以相應的對引物設計的要求就很高。普通的要求規則大家都知道,還有幾點必須注意:1,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進去,結果導致實驗結果的誤差很大,重復性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規PCR,引物同源性不高,只要兩條產物的片段長度相差足夠大,在電泳的時候能夠區分開就可以。real time PCR只有在熔解曲線的時候能分開,所以這就造成整個實驗結果誤差很大,不可信)。3,引物設計要跨內含子,不能在一個外顯子上(我們的實驗是以cDNA為模板來擴增的,如果有DNA污染的話,因為DNA上含有分子量很大的內含子,不可能完成擴增。這對我們消除整個實驗的誤差起很大的作用)。4,引物設計的時候要盡可能設計在同一退火溫度,方便于以后同時擴增很多不同的基因片段。但是如果相差比較大,就得分開做,浪費模板,浪費管家......閱讀全文

    PCR經驗總結(二)

    5. touchdown PCR?? 原理很簡單,但的確是一個很有用的方法。舉個例子就OK, ANNEALING TEMP. 55度94 5min?? 94 30s?? 60 30s?? 72 1min 2cycles?? 94 30s?? 59 30s?? 72 1min 2cycles?? 94

    REALTIME-PCR-WITH-SYBR-GREEN-I-PROTOCOL

    1、反應體系 25ulCocktail 20 ul: Primer FP 1 ul + Primer RP 1u + 2 * SYBR GREEN I MIX 12.5 + H2O 5.5 ul cDNA 5 ul2、Primer 濃度,需要摸索,從200nM到700nm等,設置不同濃度。3、每個引

    realtime-PCR-常用儀器和探針

    ?1.SYBR Green I:一種DNA結合染料,能非特異性地與雙鏈DNA結合,結合后發出熒光,價格便宜,但因無特異性,易受到非特異性擴增和引物二聚體地的影響,是定量結果不可靠。可用融解曲線分析區分特異性和非特異性擴增,引物的設計和反應條件的優化對消除非特異性熒光有很大幫助。2.Taqman探針:

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    SYBR Green I:一種DNA結合染料,能非特異性地與雙鏈DNA結合,結合后發出熒光,價格便宜,但因無特異性,易受到非特異性擴增和引物二聚體地的影響,是定量結果不可靠。可用融解曲線分析區分特異性和非特異性擴增,引物的設計和反應條件的優化對消除非特異性熒光有很大幫助。 2.Taqman探針:

    Realtime-PCR實驗注意事項

    實驗中的一些好習慣加入試劑之前,把它混勻一下,以免放置時間長了濃度不均移液槍用完之后要歸到最大計量的位置,防止久而久之彈簧失去彈性一定要記著關水浴箱,切記切記多和大家討論,同時多關注別人討論的經驗,這幾乎是最快提高的捷徑了所有的試劑都自己配,出了問題才好找原因防止RNA酶污染的措施1. 所有的玻璃器

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    Real-time PCR實驗注意事項實驗中的一些好習慣加入試劑之前,把它混勻一下,以免放置時間長了濃度不均移液槍用完之后要歸到zui大計量的位置,防止久而久之彈簧失去彈性一定要記著關水浴箱,切記切記多和大家討論,同時多關注別人討論的經驗,這幾乎是zui快提高的捷徑了所有的試劑都自己配,出了問題才好

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    實時熒光定量PCR(Real-time PCR,QPCR,熒光定量)分類以及實驗步驟介紹實時熒光定量PCR(Real-time?PCR,QPCR,熒光定量)技術(Real-time?quantitative?PCR),是指在(QPCR,熒光定量)反應體系中加入熒光基因,利用熒光信號積累實時監測整個(

    realtime-PCR技術的原理及應用

    一、實時熒光定量PCR原理(一)定義:在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號累積實時監測整個PCR進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法 。(二)實時原理1、常規PCR技術:對PCR擴增反應的終點產物進行定量和定性分析無法對起始模板準確定量,無法對擴增反應實時檢測。2、實時定量PC

    Realtime-PCR-數據導出-——-ABI儀器篇

      1. Real-time PCR數據:Real-time PCR完成后,所有數據并非可以直接導出,由于每一次實驗的情況都不相同,儀器的很多默認設定都會對最終數據結果造成重大偏差,所以在完成PCR過程后,需要人為對實驗結果進行條件設置,才能提取到科學有效的實驗結果,進而完成對實驗結果的分析和判斷。

    realtime-PCR中內參基因的CT值

    這個要看你在做PCR前的加樣量是否一致。如果加樣量是一致的,而內參做出來差別大(比如3-4個CT值)那說明你的實驗體系有嚴重的問題。理論上加入的DNA量一樣多,內參的CT值應該都一樣。如果你能肯定加樣量是一致的,那說明你的樣本要么降解了,要么就是你的實驗處理對內參的量產生了影響,必須換一個基因做內參

    realtime-PCR中內參基因的CT值

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    RtPCR經驗總結

    Rt-PCR實驗步驟一、實驗器具與材料:1、移液槍:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl2、吸頭:1ml、200μl、20μl3、勻漿管:5ml4、吸頭臺:放置1ml吸頭的一個,放置20μl吸頭的一個5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl6、試劑瓶:2個60ml的棕色試劑瓶(廣口,

    RNA抽提注意事項和經驗指南1

    背景介紹實驗前方法/試劑的選擇問題解答 (外源性污染導致的問題不在本解答考慮中)RNA 抽提的“三大紀律八項注意”Rnase 污染的10大來源RNase 和 DEPC 處理RNA 抽提的10大竅門提高 RNA 得率經典抽提小技巧特殊組織的抽提樣品凍融的影響RNA 質量的判斷RNAguard:使降解成

    RNA抽提-成功經驗法則大公開!

      本期專文要來跟大家討論的話題是核糖核酸(RNA)的萃取,看到這里各位心中可能已經起了疑問: RNA 萃取不是很簡單嗎?只要照著標準步驟操作,加一加試劑就完成了,有必要大費周章特地開篇幅來談這件事嗎?其實越簡單的東西遇到困難時就越難解,各位看倌就請耐著性子,聽我們娓娓道來。   Lab 的經驗和

    RNA抽提注意事項和經驗指南2

    3:裂解液的選擇 – 影響操作方便程度,內源雜質殘留的因素常用的裂解液幾乎都能抑制 Rnase 活性,因此,選擇裂解液的重點是要結合純化方法一起考慮。只有一個例外:高內源酶含量的樣品建議使用含苯酚的裂解液,以增加滅活內源酶的能力。 4:純化方法的選擇 – 影響內源雜質殘留。抽提速度的因素對于干凈的樣

    RNA抽提注意事項和經驗指南3

    RNA 抽提的“三大紀律八項注意” 紀律一:杜絕外源酶的污染。注意一:嚴格戴好口罩,手套。注意二:實驗所涉及的離心管,Tip 頭,移液器桿,電泳槽,實驗臺面等要徹底處理。注意三:實驗所涉及的試劑/溶液,尤其是水,必須確保 RNase-Free。紀律二:阻止內源酶的活性注意四:選擇合適的勻漿方法。注意

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